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万見検索

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検索結果

検索 (著者・登録者: doudna & j)の結果109件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-42837:
Cryo-EM structure of GeoCas9 in complex with sgRNA and target DNA

EMDB-42838:
Cryo-EM structure of iGeoCas9 in complex with sgRNA and target DNA

PDB-8uza:
Cryo-EM structure of GeoCas9 in complex with sgRNA and target DNA

PDB-8uzb:
Cryo-EM structure of iGeoCas9 in complex with sgRNA and target DNA

EMDB-43613:
Structure of HamAB apo complex from the Escherichia coli Hachiman defense system

EMDB-43615:
Structure of HamB-DNA complex, conformation 1, from the Escherichia coli Hachiman defense system

EMDB-43616:
Structure of HamB-DNA complex, conformation 2, from the Escherichia coli Hachiman defense system

EMDB-43643:
Structure of HamA(E138A,K140A)B-plasmid DNA complex from the Escherichia coli Hachiman defense system

PDB-8vx9:
Structure of HamAB apo complex from the Escherichia coli Hachiman defense system

PDB-8vxa:
Structure of HamB-DNA complex, conformation 1, from the Escherichia coli Hachiman defense system

PDB-8vxc:
Structure of HamB-DNA complex, conformation 2, from the Escherichia coli Hachiman defense system

PDB-8vxy:
Structure of HamA(E138A,K140A)B-plasmid DNA complex from the Escherichia coli Hachiman defense system

EMDB-29561:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:PAM-deficient prespacer complex

EMDB-29562:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:PAM-containing prespacer complex

EMDB-29563:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:half-site integration complex

EMDB-29564:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:half-site integration complex linear CRISPR repeat conformation

EMDB-29565:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:half-site integration complex bent CRISPR repeat conformation

PDB-8fy9:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:PAM-deficient prespacer complex

PDB-8fya:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:PAM-containing prespacer complex

PDB-8fyb:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:half-site integration complex

PDB-8fyc:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:half-site integration complex linear CRISPR repeat conformation

PDB-8fyd:
Cryo-EM structure of Cas1:Cas2-DEDDh:half-site integration complex bent CRISPR repeat conformation

EMDB-27320:
Cryo-EM structure of CasLambda (Cas12l) bound to crRNA and DNA

PDB-8dc2:
Cryo-EM structure of CasLambda (Cas12l) bound to crRNA and DNA

EMDB-24817:
Cas9:sgRNA:DNA (S. pyogenes) with 0 RNA:DNA base pairs, closed-protein/bent-DNA conformation

EMDB-24818:
Cas9:sgRNA (S. pyogenes) in the open-protein conformation

EMDB-24819:
Cas9:sgRNA:DNA (S. pyogenes) forming a 3-base-pair R-loop

EMDB-24823:
Cas9:sgRNA:DNA (S. pyogenes) with 0 RNA:DNA base pairs, open-protein/linear-DNA conformation

PDB-7s36:
Cas9:sgRNA:DNA (S. pyogenes) with 0 RNA:DNA base pairs, closed-protein/bent-DNA conformation

PDB-7s37:
Cas9:sgRNA (S. pyogenes) in the open-protein conformation

PDB-7s38:
Cas9:sgRNA:DNA (S. pyogenes) forming a 3-base-pair R-loop

PDB-7s3h:
Cas9:sgRNA:DNA (S. pyogenes) with 0 RNA:DNA base pairs, open-protein/linear-DNA conformation

EMDB-32389:
PlmCasX-sgRNAv1-dsDNA ternary complex at nts loading state

EMDB-32390:
PlmCasX-sgRNAv1-dsDNA ternary complex at ts loading state

EMDB-32391:
PlmCasX-sgRNAv1-dsDNA ternary complex at nts loading state with flexible H2 domain

EMDB-32392:
PlmCasX-sgRNAv2-dsDNA ternary complex at nts loading state

PDB-7way:
PlmCasX-sgRNAv1-dsDNA ternary complex at nts loading state

PDB-7waz:
PlmCasX-sgRNAv1-dsDNA ternary complex at ts loading state

PDB-7wb0:
PlmCasX-sgRNAv1-dsDNA ternary complex at nts loading state with flexible H2 domain

PDB-7wb1:
PlmCasX-sgRNAv2-dsDNA ternary complex at nts loading state

EMDB-22518:
SpCas9 delta4CE Ternary Complex

EMDB-23600:
Cryo-EM structure of CasPhi-2 (Cas12j) bound to crRNA and DNA

EMDB-23601:
Cryo-EM structure of CasPhi-2 (Cas12j) bound to crRNA and Phosphorothioate-DNA

EMDB-23678:
Cryo-EM structure of CasPhi-2 (Cas12j) bound to crRNA

PDB-7lys:
Cryo-EM structure of CasPhi-2 (Cas12j) bound to crRNA and DNA

PDB-7lyt:
Cryo-EM structure of CasPhi-2 (Cas12j) bound to crRNA and Phosphorothioate-DNA

PDB-7m5o:
Cryo-EM structure of CasPhi-2 (Cas12j) bound to crRNA

EMDB-22855:
Partial Cas6-RT-Cas1--Cas2 complex

EMDB-22856:
Cas6-RT-Cas1--Cas2 complex

PDB-7kft:
Partial Cas6-RT-Cas1--Cas2 complex

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は? / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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