5TK
Bonds
| First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
| C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
| C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
| C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
| C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
| O6 | C6 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
| O3 | C3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
| O5 | C5 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
| C6 | C5 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
| C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
| C5 | C4 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
| C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
| O4 | SA | sing | 1.52Å | 1.51Å | |
| SA | O2S | sing | 1.52Å | 1.51Å | |
| C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.39Å | |
| C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| O2S | H3A | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C6 | H61 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| C6 | H62 | sing | 1.09Å | 1.10Å | |
| O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| O6 | HO6 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
| O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
| First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
| C2 | C1 | O5 | 110.3° | 109.4° |
| C1 | C2 | O2 | 109.6° | 109.5° |
| C1 | C2 | C3 | 110.4° | 109.2° |
| C2 | C1 | O1 | 109.3° | 109.5° |
| C2 | C1 | H1 | 108.5° | 109.5° |
| C1 | C2 | H2 | 108.4° | 109.5° |
| C1 | O5 | C5 | 113.6° | 114.1° |
| O5 | C1 | O1 | 108.5° | 109.5° |
| O5 | C1 | H1 | 109.7° | 109.5° |
| O2 | C2 | C3 | 109.7° | 109.5° |
| O2 | C2 | H2 | 110.0° | 109.5° |
| C2 | O2 | HO2 | 109.5° | 114.0° |
| C2 | C3 | O3 | 109.9° | 109.6° |
| C2 | C3 | C4 | 110.0° | 109.0° |
| C3 | C2 | H2 | 108.6° | 109.6° |
| C2 | C3 | H3 | 108.5° | 109.6° |
| O6 | C6 | C5 | 111.7° | 109.5° |
| O6 | C6 | H61 | 108.9° | 109.5° |
| O6 | C6 | H62 | 108.9° | 109.5° |
| C6 | O6 | HO6 | 109.5° | 114.0° |
| O3 | C3 | C4 | 110.0° | 109.5° |
| O3 | C3 | H3 | 110.0° | 109.6° |
| C3 | O3 | HO3 | 109.5° | 114.0° |
| O5 | C5 | C6 | 108.3° | 109.5° |
| O5 | C5 | C4 | 110.3° | 109.4° |
| O5 | C5 | H5 | 108.8° | 109.4° |
| C6 | C5 | C4 | 113.6° | 109.5° |
| C6 | C5 | H5 | 107.9° | 109.5° |
| C5 | C6 | H61 | 108.9° | 109.4° |
| C5 | C6 | H62 | 108.9° | 109.5° |
| C3 | C4 | C5 | 110.8° | 109.2° |
| C3 | C4 | O4 | 109.5° | 109.6° |
| C4 | C3 | H3 | 108.5° | 109.5° |
| C3 | C4 | H4 | 108.6° | 109.5° |
| C5 | C4 | O4 | 109.5° | 109.5° |
| C5 | C4 | H4 | 108.5° | 109.5° |
| C4 | C5 | H5 | 107.7° | 109.5° |
| C4 | O4 | SA | 112.0° | 114.0° |
| O4 | C4 | H4 | 110.1° | 109.5° |
| O4 | SA | O2S | 109.3° | 103.0° |
| SA | O2S | H3A | 109.5° | 114.0° |
| O1 | C1 | H1 | 110.5° | 109.5° |
| C1 | O1 | HO1 | 109.5° | 113.9° |
| H61 | C6 | H62 | 109.5° | 109.5° |
Dihedrals
| First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
| C2 | C1 | O5 | O1 | 119.7° | 120.0° |
| C2 | C1 | O5 | H1 | 119.5° | 120.0° |
| C1 | C2 | O2 | C3 | 121.4° | 119.7° |
| C1 | C2 | O2 | H2 | 119.2° | 120.1° |
| C1 | C2 | C3 | H2 | 118.8° | 120.0° |
| C1 | C2 | C3 | O3 | 66.9° | 176.8° |
| C2 | C1 | O5 | C5 | 59.4° | 61.1° |
| C1 | C2 | C3 | C4 | 54.3° | 57.0° |
| C2 | C1 | O1 | H1 | 119.3° | 120.0° |
| C1 | C2 | C3 | H3 | 172.9° | 62.9° |
| C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.0° |
| C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 179.9° |
| O5 | C1 | C2 | O2 | 64.5° | 177.5° |
| O5 | C1 | C2 | C3 | 56.5° | 57.6° |
| C1 | O5 | C5 | C6 | 66.3° | 178.8° |
| C1 | O5 | C5 | C4 | 58.7° | 61.1° |
| O5 | C1 | O1 | H1 | 120.4° | 120.0° |
| O5 | C1 | C2 | H2 | 175.3° | 62.4° |
| C1 | O5 | C5 | H5 | 176.7° | 58.8° |
| O5 | C1 | O1 | HO1 | 59.7° | 60.0° |
| O2 | C2 | C3 | H2 | 120.3° | 120.1° |
| O2 | C2 | C3 | O3 | 172.2° | 63.3° |
| O2 | C2 | C3 | C4 | 66.6° | 176.9° |
| O2 | C2 | C1 | O1 | 54.7° | 57.5° |
| O2 | C2 | C1 | H1 | 175.3° | 62.5° |
| O2 | C2 | C3 | H3 | 51.9° | 57.0° |
| C2 | C3 | O3 | C4 | 121.3° | 119.6° |
| C2 | C3 | O3 | H3 | 119.4° | 120.3° |
| C2 | C3 | C4 | H3 | 118.5° | 119.9° |
| C2 | C3 | C4 | C5 | 53.8° | 56.9° |
| C2 | C3 | C4 | O4 | 67.1° | 176.9° |
| C3 | C2 | C1 | O1 | 175.7° | 62.4° |
| C3 | C2 | C1 | H1 | 63.8° | 177.6° |
| C2 | C3 | C4 | H4 | 172.8° | 63.0° |
| C3 | C2 | O2 | HO2 | 58.6° | 179.7° |
| C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 60.0° |
| O6 | C6 | C5 | O5 | 58.0° | 65.1° |
| O6 | C6 | C5 | H61 | 120.3° | 120.0° |
| O6 | C6 | C5 | H62 | 120.3° | 120.1° |
| O6 | C6 | C5 | C4 | 179.0° | 175.0° |
| O6 | C6 | C5 | H5 | 59.6° | 54.9° |
| O6 | C6 | H61 | H62 | 119.0° | 120.1° |
| O3 | C3 | C4 | H3 | 120.3° | 120.2° |
| O3 | C3 | C4 | C5 | 67.4° | 176.8° |
| O3 | C3 | C4 | O4 | 171.7° | 63.2° |
| O3 | C3 | C2 | H2 | 51.9° | 56.8° |
| O3 | C3 | C4 | H4 | 51.6° | 56.9° |
| O5 | C5 | C6 | C4 | 123.0° | 120.0° |
| O5 | C5 | C6 | H5 | 117.6° | 120.0° |
| O5 | C5 | C4 | C3 | 54.9° | 57.6° |
| O5 | C5 | C4 | H5 | 118.7° | 119.9° |
| O5 | C5 | C4 | O4 | 65.9° | 177.5° |
| C5 | O5 | C1 | O1 | 179.1° | 58.8° |
| C5 | O5 | C1 | H1 | 60.0° | 178.9° |
| O5 | C5 | C4 | H4 | 174.0° | 62.3° |
| O5 | C5 | C6 | H61 | 62.3° | 175.0° |
| O5 | C5 | C6 | H62 | 178.3° | 55.0° |
| C6 | C5 | C4 | C3 | 67.0° | 177.6° |
| C6 | C5 | C4 | H5 | 119.5° | 120.1° |
| C6 | C5 | C4 | O4 | 172.2° | 62.5° |
| C6 | C5 | C4 | H4 | 52.1° | 57.7° |
| C5 | C6 | H61 | H62 | 119.0° | 120.0° |
| C5 | C6 | O6 | HO6 | 180.0° | 180.0° |
| C3 | C4 | C5 | O4 | 120.8° | 120.0° |
| C3 | C4 | C5 | H4 | 119.0° | 119.9° |
| C3 | C4 | O4 | H4 | 119.2° | 120.2° |
| C3 | C4 | O4 | SA | 125.9° | 95.0° |
| C4 | C3 | C2 | H2 | 173.1° | 63.0° |
| C3 | C4 | C5 | H5 | 173.6° | 62.4° |
| C4 | C3 | O3 | HO3 | 58.7° | 179.6° |
| C5 | C4 | O4 | H4 | 119.1° | 120.1° |
| C5 | C4 | O4 | SA | 112.4° | 145.3° |
| C5 | C4 | C3 | H3 | 172.3° | 62.9° |
| C4 | C5 | C6 | H61 | 60.7° | 55.0° |
| C4 | C5 | C6 | H62 | 58.7° | 65.0° |
| C4 | O4 | SA | O2S | 169.4° | 180.0° |
| O4 | C4 | C3 | H3 | 51.5° | 57.0° |
| O4 | C4 | C5 | H5 | 52.8° | 57.6° |
| O4 | SA | O2S | H3A | 180.0° | 180.0° |
| SA | O4 | C4 | H4 | 6.7° | 25.2° |
| O1 | C1 | C2 | H2 | 65.4° | 177.6° |
| H1 | C1 | C2 | H2 | 55.1° | 57.6° |
| H1 | C1 | O1 | HO1 | 60.7° | 60.0° |
| H2 | C2 | C3 | H3 | 68.4° | 177.2° |
| H2 | C2 | O2 | HO2 | 60.8° | 60.1° |
| H3 | C3 | C4 | H4 | 68.7° | 177.1° |
| H3 | C3 | O3 | HO3 | 60.6° | 60.3° |
| H4 | C4 | C5 | H5 | 67.4° | 177.7° |
| H5 | C5 | C6 | H61 | 180.0° | 65.0° |
| H5 | C5 | C6 | H62 | 60.7° | 175.0° |
| H61 | C6 | O6 | HO6 | 59.7° | 60.0° |
| H62 | C6 | O6 | HO6 | 59.7° | 60.0° |
