| PDBx/mmCIFについて ... データの読み解き方：mmCIFとPDBML」 (pdf 1.7MB) 講師：金城 玲（大阪大学蛋白 ... 化会館） - 「PDBの”新”フォーマット」 (pdf 1.0MB) 講師：金城 玲（大阪大学蛋白 ... |
| ニュース (2014年4月24日) ... クヘブン国立研究所（Brookhaven National Laboratory）1で、実験的に決定した生物学 ... はこちらからご覧頂けます。 1. Protein Data Bank. (1971) Protein Data Bank. Nature New Biol. 233: 223 ... |
| 画像認証チェック 私たちのサーバが１秒間に数千のスパムメールを ... と終了します）内では最初の1回だけです。 |
| ニュース (2014年7月9日) ... いました。 - 原子の通し番号は1から原子の数まで（フィールド ... イルは、最近のCCP4（REFMAC 5.8）やPhenix（1.8.2）で作ることができます ... |
| これまでにない完全なHIVカプシド構造がPDBで公開されました ... える大きな構造についても、１つのPDBx/mmCIF、 PDBML/XMLファイルとし ... -5639/map/emd_5639.map.gz 参考文献 Mature HIV-1 capsid structure by cryo-electron microscopy and all-atom molecular dynamics. Gongpu ... |
| 代表配列 ... 30％ より大きく、かつE値が 0.1 より大きい組み合わせ） につ ... り返して分割していきます。 1. 最もリンクの多い構造を選 ... |
| 国際結晶学会（8月5-12日）でのwwPDB関連イベントのお知らせ ... M. Berman (RCSB PDB) in MS61 The Beginnings Of Biological Crystallography (1:45 - 4:20pm) in Room 517d. "ポスター発表: Educational ... Helen M. Berman (RCSB PDB) in MS61 The Beginnings Of Biological Crystallography (1:45 - 4:20pm) in Room 517d. - "ポスター発表: ... |
| NER ... の類似度を評価する指標の１つとして使われています。 NER ... 転と変換に相当します。 NERは1から残基数までの範囲の値 ... |
| PDBj Mine 検索結果 ... のパネルには、検索結果数や、１ページに表示される結果数、表 ... の検索結果が表示されます。(１ページに表示する検索結果数 ... |
| Structure Navigator ... は、ジョブ終了から1週間ご確認頂けます。 1. 結果ページの準備 ... |
| 構造ドメイン ... する構造階層を指しますが、 １つのドメインで構成されて ... 素となりますが、 残念ながら１つに定まった構造ドメイン ... |
| DNA - ペーパーモデル ... かたちをしています。 これは1周分のDNA二重らせんのペーパ ... ーモデルです。10塩基で1周すること、二重らせんの溝 ... |
| Sequence Navigator ... ます。実際は２つの superposition があり、１つは RMSD を最小化したものか ... 。 各クラスタにはエントリーが１つずつ表示されます。show all alignments ... |
| 10月4日、5日「トーゴーの日シンポジウム2017」にて、口頭・ポスター発表を行います ... ス） 口頭発表 （講演プログラム） 1. 10月5日（木）10:00-10:15「蛋白質 ... 研究所） ポスター発表 （日程・一覧） 1. No. 24 「ASH Viewerの開発」 発表者： 藤 博 ... |
| 7-4) 登録構造中のリガンドに対して、RSR値は十分低いのに、LLDFが非常に高いのはなぜですか？ - validation FAQ - ... を持つ酵素で、しっかりした1.9Å分解能の構造です。 これは ... 、そうでないかに依存して、0.1から3.6までの異なる値を ... |
| Molmil viewerへのリンクが表示されません。 / Molmilが動作しません。 -FAQ ... することもご検討ください。1 1) CentOS 6.7 + Firefox ESR 38.6.0 + nouveau driverで、こ ... |
| 化学シフト ... ています。 登録時には、 NMR-STAR v3.1形式の化学シフトファイル ... ト http://bmrb.pdbj.org/formats.html (英語) NMR-STAR 3.1のディクショナリ http://bmrb.pdbj.org ... |
| PDBETAのダウンロード ... データの二次構造の同定にDSSP [1]を利用することができます ... 二次構造情報を利用します。 [1] W. Kabsch and C. Sander, Dictionary of protein secondary structure: pattern recognition ... |
| アライメント ... イメントがよく使われます。 １つは配列アライメントで、ア ... けを比較するものです。 もう１つは構造アライメントで、立 ... |
| 機能情報のページについて ... 文献から得られたものです。 1) GO（ジーン・オントロジー）に由来す ... は次のようになっています。 1) オリジナルのCATRESファイルか ... |
| EDM viewer ... がある重い原子を除いて、約1〜5σの範囲内にあります。デフ ... |
| ニュース (2011年01月18日) 2011年1月17日(月)、18日(火)に、「DDBJing 講習会PDBj 講習会 in 長浜」を長浜バイオ大学にて開催いたしました。( セミナー資料 ) |
| [wwPDB] wwPDBの定款を更新し，RDFを公式フォーマットの一つと定義しました ... 、新しい定款（Charter）を作成し、 2021年1月に合意しました。この定款 ... |
| 2013年6月17日（月）、18日（火）に、中国蘇州大学にて、第11回 日韓中バイオインフォマティクストレーニングコースが開催されます。 ... サイト (http://cjk-bioinfo.scbit.org/) - ポスター (pdf 1.2 MB) |
| [wwPDB] 化学のためのオープンソース・ツールに関するワークショップ ... (PDB): PDBデータの利用と理解、評価 １日目: 2021年11月16日（火）3-5pm GMT ... |
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