特定種のポリマーを含むエントリーを検索 - FAQ ... を含むエントリーを検索する 1. 詳細条件検索にアクセス 2 ... |
6-1) 非標準残基や修飾残基を含むアミノ酸配列を登録する方法を教えてください。- wwPDB D&A FAQ - 登録者は、完全なアミノ酸配列についての情報を提供する必要があります。 最終段階の座標ファイルには含まれなかった発現タグや、他の観測されない領域も、配列に含めてください。 標準アミノ酸を含むポリペプチド鎖に対しては、ポリマー鎖に含まれる全ての標準アミノ酸を一文字表記で表したアミノ酸配列を登録してください(例:GLU -> E) 同様に、核酸配列に対しても、ポリマー鎖に含まれる標準ヌクレオチドは一文字表記で表してください(例:Uracil -> U)。 標準アミノ酸と核酸の一文字表記の一覧を参考にし ... |
2016年9月6日より、電子顕微鏡法(3DEM)によって決定した構造をPDBへ登録する際は、EMDBへのマップの登録が必須になります。 ... マップが登録された後、最大1年間は、非公開の状態にして ... |
ニュース(2016年5月10日) ... ー「jV」を更新しました(4.5→4.5.1)。 修正点は、静止画像保存先に ... |
構造因子ファイルの修正、公開計画について ... ードに記載されています。 2013年1月16日より、修正済みの構造 ... |
4-2) ファイルのアップロードが失敗する理由を教えてください。 - wwPDB D&A FAQ - ... してください。 エラーメッセージ #1: "File is not readable(ファイルが読めま ... |
NMRと電子顕微鏡法による構造に対して、新しい検証レポートが公開されました。 ... るために作られました。 2016年1月から、 NMRと電子顕微鏡法に ... |
ニュース (2016年5月26日) ... ホール) 席数 100席 <演者・演題> - 演者1:小林直宏(大阪大学蛋白質研 ... |
PDBjの新しいツールと活動を紹介した論文が、Protein Scienceから公開されました。 ... ., Kobayashi, N., Fujiwara, T., Kurisu, G. and Nakamura, H. Protein Science 27 (1): 95-102 (2018) |
次世代ツールの稼働開始と10万件への道のり ... 要望に対応できるでしょう。 1月末に新システムの使用を ... |
ニュース (2015年4月16日) ... : 大阪大学蛋白質研究所本館1階セミナー室 [Map] (注)会場が変更 ... |
化合物検索 ... とに3つのタブがあります。 - 1番目のタブには、化合物の概 ... |
ニュース (2015年6月5日) ... 席数 100席 <講習会プログラム> 1. 「日本と世界の蛋白質構造デ ... |
分子構造情報の活用例について紹介した文献が出版されました ... )『分子構造の活用』」 Journal of Computer Chemistry, 14 (1): A3-A5 (2015) [doi:10.2477/jccj.2015-0004 ... |
ニュース (2015年5月15日) ... れる方 -> 当方より貸出PC(Windows 8.1)をご利用下さい(先着15名) - 主 ... |
2015年9月13日(日) 、金沢大学で開催された 第53回生物物理学会年会 にて、PDBjランチョンセミナーを行いました。 ... Room B) 席数 100席 <演者・演題> - 演者1:岩崎 憲治(大阪大学 蛋白質研 ... |
アミノ酸命名法を標準化します ... 命名を使うよう移行中です。 1月以降は、これらを含む新規 ... |
7-6) Cootでは電子密度マップ係数をどのように使用すればよいでしょうか? - validation FAQ - ... 段階のプロセスで行います。 1. cifファイルをMTZファイルへ ... |
11月24日~26日、テレコムセンタービル(東京お台場)にて開催される「サイエンスアゴラ2017」に出展します ... 下記内容の出展を行います。 1. 実際にPDBjのデータベースへアク ... |
EDM viewer ... がある重い原子を除いて、約1〜5σの範囲内にあります。デフ ... |
BMRB登録・編集に関するお問い合わせ ... するお問い合わせは、回答に1週間から10日程度の時間を ... |
雑誌の発行年が1991年、巻番号が266、実験手法が「X-RAY DIFFRACTION」(X線回折)であるエントリーのPDBIDを得る ... brief_summary b WHERE '{1991}' && citation_year AND '{"266"}' && citation_volume AND '{1}' && exptl_method_ids タグ - brief_summary - 著者・登録者 ... |
9月21日 (木)、第55回 日本生物物理学会年会にて、ランチョンセミナーを開催します ... 、ご来場下さい。 - セミナー要旨(pdf 1.8MB) - ランチョンセミナープログ ... |
[wwPDB] EMDBのポリシーと処理手順に関する文書を公開しました ... 実に増大し続け、現在はほぼ1万件のマップが公開されて ... |
6月22日(木)、 第17回日本蛋白質科学会年会 にて、ランチョンセミナーを開催します。 ... 、ご来場下さい。 - セミナー要旨(pdf 1.2MB) - ランチョンセミナープログ ... |