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文字列結合(||)

... 関数と演算子)。 例: SELECT カラム名1 || ( || カラム名2 || ) AS 別名 FROM テーブル ...

ニュース (2016年12月14日)

... 従うようになりました。 2016年1月以来、OneDepシステムは、電子顕 ...

実験情報

... ます。対応は以下の通りです。 1. X線回折(X-RAY DIFFRACTION) 2. 中性子回 ...

[wwPDB] wwPDBの定款: 正規メンバーと準メンバー

... 、 準メンバーはwwPDBの活動の一部(1つ以上のwwPDBコアアーカイブに ...

[wwPDB] 新しいバージョンのPDB-IHM 検証レポートに、クロスリンキング質量分析に基づく構造モデルの評価が追加されました。

... に、PRIDEクロスリンキングは、 mzIdentML 1.2.0 コミュニティデータ標準 ...

情報を取り出す(SELECT)

... います(参考:PostgreSQL 9.5.4文書 - 7.1. 概要)。 - 出力対象となる項目名 ...

[wwPDB] PDBエントリー中の蛋白質修飾の取り扱いが標準化されました

... トであり、BBSRC助成金番号BB/V018779/1の助成を受けています。 [ wwPDB News ...

11/17(土)、ららぽーとEXPOCITY(大阪府吹田市)にて開催される「大阪大学共創DAY@EXPOCITY『大阪大学とあそぼう』」に出展します

... 下記内容の出展を行います。 1. 実際にPDBjのデータベースへアク ...

結果件数を制限する(LIMIT)

... 文書 - 7.6. LIMITとOFFSET)。 SELECT カラム名1 FROM テーブル名 LIMIT 数値

[wwPDB] PDBエントリー中の蛋白質の修飾の取り扱いを標準化します

... トであり、BBSRC助成金番号BB/V018779/1の助成を受けています。 [ wwPDB News ...

11/10(土)・11(日)、東京お台場にて開催される「サイエンスアゴラ2018」に出展します

... 下記内容の出展を行います。 1. 実際にPDBjのデータベースへアク ...

[wwPDB] ペプチド残基に関するアノテーションの更新と標準化

... 部であり、BBSRC助成金番号BB/V018779/1の助成を受けています。 [ wwPDB News ...

詳細検索

... 間一致の検索もできます。 例?1Aで始まるエントリーID 1A* 例 ...

ニュース (2016年10月15日)

... に従うようになります。 2016年1月からは、OneDepシステム (http://wwpdb.org ...

2022年日本バイオインフォマティクス学会年会、第11回生命医薬情報学連合大会にてランチョンセミナーを開催します

... ター(大阪府豊中市新千里東町1丁目4-2) 5階会議室501-503 定 ...

高分子鎖の中にD体またはL体のポリペプチド鎖を含むエントリーのPDBIDを得る

... 検索はこちら SELECT pdbid FROM brief_summary WHERE ('{1,2}' && chain_type_ids) 主要項目テーブルbrief ...

「ペプチド鎖」と「水を除く低分子」の両方を含むエントリーのPDBIDを得る

... ON e1.pdbid=e2.pdbid AND e1.id=e2.entity_id WHERE ('{1,2}' && b.chain_type_ids) AND e1.type='non-polymer' AND NOT ...

BINDS-PDBj合同講習会「NMRによる構造計算入門」

... だきます。 参加受付締切: 2019年1月18日(金) 17:00 (申し込みはこ ...

2-1) ハイブリッド手法の構造を登録する方法を教えてください。 - wwPDB D&A FAQ -

登録開始時に、構造の決定に用いた実験手法についての情報を求められます。 複数の実験手法を選択することもできます。 例えば、X線/中性子線ハイブリッド法を使用した場合、X線回折と中性子線回折の両方を選択してください。 登録が終了すると、関連するアクセッションコードが割り当てられます (例えば、X線回折と溶液NMR法で解析された構造には、PDBアクセッションコードとBMRBアクセッションコードの両方が割り当てられます)。 登録セッションが進むと、登録者は、各々の実験手法に対するデータ収集や精密化とい ...

7-1) 全ての必須項目が入力済みであるかどうか、どのようにしてわかりますか?- wwPDB D&A FAQ -

登録画面の左上の隅にある進捗バーに、必須項目の入力状況が表示されます。 未入力の必須項目を確認したいときはいつでも、進捗バーをクリックしてください。 全ての必須項目が入力済みになると、進捗バーが登録ボタンに変わります。 データ入力が完了し、登録ボタンをクリックすると、PDB又はEMDB又はBMRBのアクセションコードが発行され、 データはwwPDBのアノテーション処理用に送信されます。 [質問一覧に戻る]

3-1) 自身が解析中の構造や、未公開の構造に対して、検証レポートを得ることができますか? - validation FAQ -

X線結晶構造に対しては、スタンドアロンの検証サーバを利用して、検証レポートをオン・デマンドで作成することができます。 NMRやEMによって決定した構造についても、間もなく利用できるようになる予定です。 最新情報は、wwPDBサイト原文 (英語)もご覧ください。 [質問一覧に戻る]

5-1) もし、検証レポートの内容が間違っていると考える場合、どうすればよいですか? - validation FAQ -

問題について、できるだけ詳細な情報とともに、 validation@mail.wwpdb.orgまで、英語にてご連絡ください。 最新情報は、wwPDBサイト原文 (英語)もご覧ください。 [質問一覧に戻る]

特定種のポリマーを含むエントリーを検索 - FAQ

... を含むエントリーを検索する 1. 詳細条件検索にアクセス 2 ...

PDB Bundle

... したマッピングファイルをつにまとめて圧縮したもの ...

2-1) 登録構造の座標や実験データが一般公開される前に、どんな情報が公開されますか? - validation FAQ -

論文の投稿過程(論文が出版されるまで投稿情報は機密情報として扱われます)と同様に、 PDBエントリーの公開以前は、一般に公開される情報は限られています。 (次のFAQ 2-2もご覧ください。) 機密情報である検証レポートは、登録者のみに送付されます (このレポートを論文と一緒に投稿するかどうかは登録者が選択できます)。 この検証レポートには、配置のチェック、構造因子の検証、リガンドの検証結果が記載されます。 座標や実験データは、レポートには含められていません。 wwPDB検証レポート ...

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件を2025-06-25に公開中

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