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6W9R	Crystal structure of an OTU deubiquitinase from Wolbachia pipientis wMel bound to ubiquitin 分子名称: CITRATE ANION, OTU domain-containing protein wMelOTU, Ubiquitin 著者 Schubert, A.F, Pruneda, J.N, Komander, D. 登録日 2020-03-23 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.82 Å) 主引用文献 Identification and characterization of diverse OTU deubiquitinases in bacteria. Embo J., 39, 2020
6W9S	Crystal structure of an OTU deubiquitinase from Escherichia albertii bound to ubiquitin 分子名称: FORMIC ACID, OTU domain-containing protein EschOTU, Ubiquitin 著者 Schubert, A.F, Pruneda, J.N, Komander, D. 登録日 2020-03-23 公開日 2020-07-01 最終更新日 2020-08-12 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Identification and characterization of diverse OTU deubiquitinases in bacteria. Embo J., 39, 2020
5GO7	Linear tri-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.801 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOC	Lys11-linked diubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, SODIUM ION, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.733 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOI	Lys48-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.594 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOG	Lys29-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.977 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOK	K11/K63-branched tri-Ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.84 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOB	Lys6-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.153 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOH	Lys33-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.946 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GO0	Solution structure of nedd8 from Trypanosoma brucei 分子名称: Ubiquitin, putative 著者 Wang, R, Liao, S, Zhang, J, Tu, X. 登録日 2016-07-25 公開日 2017-07-26 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of nedd8 from Trypanosoma brucei To Be Published
5GO8	Linear tetra-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.21 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOD	Lys27-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, MAGNESIUM ION, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.15 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOJ	Lys63-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.549 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5H07	TNIP2-Ub complex, C2 form 分子名称: Polyubiquitin-C, TNFAIP3-interacting protein 2 著者 Lo, Y.C, Lin, S.C. 登録日 2016-10-04 公開日 2017-03-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.586 Å) 主引用文献 Structural Insights into Linear Tri-ubiquitin Recognition by A20-Binding Inhibitor of NF-kappa B, ABIN-2 Structure, 25, 2017
5GVI	Zebrafish USP30 in complex with Lys6-linked diubiquitin 分子名称: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, ZINC ION, ubiquitin 著者 Sato, Y, Fukai, S. 登録日 2016-09-05 公開日 2017-09-13 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.87 Å) 主引用文献 Structural basis for specific cleavage of Lys6-linked polyubiquitin chains by USP30 Nat. Struct. Mol. Biol., 24, 2017
5JBV	Lys27-linked triubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, NITRATE ION, Ubiquitin 著者 Pan, M, Gao, S, Zheng, Y. 登録日 2016-04-13 公開日 2016-05-18 最終更新日 2022-02-09 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.104 Å) 主引用文献 Structure of Lys27-linked triubiquitin To Be Published
5J8P	Lys27-linked diubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, MAGNESIUM ION, ubiquitin 著者 Pan, M, Gao, S, Zheng, Y. 登録日 2016-04-08 公開日 2016-05-18 最終更新日 2022-02-09 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.554 Å) 主引用文献 Structure of Lys27-linked diubiquitin To Be Published
5JBY	Lys27-linked triubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, ubiquitin 著者 Pan, M, Gao, S, Zheng, Y. 登録日 2016-04-14 公開日 2016-07-20 最終更新日 2022-02-09 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.987 Å) 主引用文献 Structure of Lys27-linked triubiquitin To Be Published
5JZE	Erve virus viral OTU domain protease in complex with mouse ISG15 分子名称: CITRATE ANION, RNA-dependent RNA polymerase, Ubiquitin-like protein ISG15, ... 著者 Deaton, M.K, Dzimianski, J.V, Pegan, S.D. 登録日 2016-05-16 公開日 2016-10-19 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.47 Å) 主引用文献 Biochemical and Structural Insights into the Preference of Nairoviral DeISGylases for Interferon-Stimulated Gene Product 15 Originating from Certain Species. J.Virol., 90, 2016
5K9P	Ser20 phosphorylated ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Huguenin-Dezot, N, Chin, J.W. 登録日 2016-06-01 公開日 2016-07-20 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.55 Å) 主引用文献 Synthesis of Isomeric Phosphoubiquitin Chains Reveals that Phosphorylation Controls Deubiquitinase Activity and Specificity. Cell Rep, 16, 2016
8F1F	Structure of K48-linked tri-ubiquitin in complex with cyclic peptide 分子名称: 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID, GLYCEROL, Non-proteinogenic cyclic peptide (inhibitor), ... 著者 Lubkowski, J, Fushman, D, Lemma, B. 登録日 2022-11-05 公開日 2023-11-01 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Mechanism of selective recognition of Lys48-linked polyubiquitin by macrocyclic peptide inhibitors of proteasomal degradation. Nat Commun, 14, 2023
8HM2	Crystal structure of human ubiquitin-like protein from bacteroides fragilis c terminal cysteine mutant 分子名称: Putative ubiquitin 著者 Tong, M, Chen, Z, Gao, X. 登録日 2022-12-02 公開日 2023-11-29 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.34 Å) 主引用文献 Bacteroides fragilis ubiquitin homologue drives intraspecies bacterial competition in the gut microbiome. Nat Microbiol, 9, 2024
8IC9	Lys48-linked K48C-diubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-B, Ubiquitin 著者 Hiranyakorn, M, Yagi-Utsumi, M, Yanaka, S, Ohtsuka, N, Momiyama, N, Satoh, T, Kato, K. 登録日 2023-02-11 公開日 2023-04-26 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.25 Å) 主引用文献 Mutational and Environmental Effects on the Dynamic Conformational Distributions of Lys48-Linked Ubiquitin Chains. Int J Mol Sci, 24, 2023
8ID2	Crystal structure of the ubiquitin-like domain in the SF3A1 subunit of human U2 snRNP complexed with the stem-loop 4 of U1 snRNA 分子名称: RNA (5'-R(*GP*GP*GP*GP*AP*CP*UP*GP*CP*GP*UP*UP*CP*GP*CP*GP*CP*UP*UP*UP*CP*CP*CP*C)-3'), Splicing factor 3A subunit 1 著者 Terawaki, S, Nameki, N, Kuwasako, K. 登録日 2023-02-12 公開日 2023-05-17 最終更新日 2023-08-09 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Structural insights into recognition of SL4, the UUCG stem-loop, of human U1 snRNA by the ubiquitin-like domain, including the C-terminal tail in the SF3A1 subunit of U2 snRNP. J.Biochem., 174, 2023
7M4N	Crystal structure of RBR E3 ligase RNF216 in complex with K63-linked di-ubiquitin 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF216, GLYCEROL, SULFATE ION, ... 著者 Cotton, T.R, Lechtenberg, B.C. 登録日 2021-03-21 公開日 2022-01-05 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.52 Å) 主引用文献 Structural basis of K63-ubiquitin chain formation by the Gordon-Holmes syndrome RBR E3 ubiquitin ligase RNF216. Mol.Cell, 82, 2022

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