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1GJZ	Solution structure of a dimeric N-terminal fragment of human ubiquitin 分子名称: UBIQUITIN 著者 Bolton, D, Evans, P.A, Stott, K, Broadhurst, R.W. 登録日 2001-08-06 公開日 2001-12-13 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure and Properties of a Dimeric N-Terminal Fragment of Human Ubiquitin. J.Mol.Biol., 314, 2001
1ZW7	Elimination of the C-cap in Ubiquitin Structure, Dynamics and Thermodynamic Consequences 分子名称: Ubiquitin 著者 Ermolenko, D.N, Dangi, B, Gronenborn, A.M, Makhatadze, G.I. 登録日 2005-06-03 公開日 2006-05-16 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Elimination of the C-cap in ubiquitin-structure, dynamics and thermodynamic consequences. Biophys.Chem., 126, 2007
5JBV	Lys27-linked triubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, NITRATE ION, Ubiquitin 著者 Pan, M, Gao, S, Zheng, Y. 登録日 2016-04-13 公開日 2016-05-18 最終更新日 2022-02-09 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.104 Å) 主引用文献 Structure of Lys27-linked triubiquitin To Be Published
1AAR	STRUCTURE OF A DIUBIQUITIN CONJUGATE AND A MODEL FOR INTERACTION WITH UBIQUITIN CONJUGATING ENZYME (E2) 分子名称: DI-UBIQUITIN 著者 Cook, W.J, Jeffrey, L.C, Carson, M, Chen, Z, Pickart, C.M. 登録日 1992-04-17 公開日 1993-10-31 最終更新日 2024-06-05 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Structure of a diubiquitin conjugate and a model for interaction with ubiquitin conjugating enzyme (E2). J.Biol.Chem., 267, 1992
1IYF	Solution structure of ubiquitin-like domain of human parkin 分子名称: parkin 著者 Sakata, E, Yamaguchi, Y, Kurimoto, E, Kikuchi, J, Yokoyama, S, Kawahara, H, Yokosawa, H, Hattori, N, Mizuno, Y, Tanaka, K, Kato, K, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 登録日 2002-08-13 公開日 2003-03-25 最終更新日 2023-12-27 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Parkin binds the Rpn10 subunit of 26S proteasomes through its ubiquitin-like domain EMBO REP., 4, 2003
1J8C	Solution Structure of the Ubiquitin-like Domain of hPLIC-2 分子名称: ubiquitin-like protein hPLIC-2 著者 Walters, K.J, Kleijnen, M.F, Goh, A.M, Wagner, G, Howley, P.M. 登録日 2001-05-21 公開日 2002-03-20 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural studies of the interaction between ubiquitin family proteins and proteasome subunit S5a. Biochemistry, 41, 2002
6W9R	Crystal structure of an OTU deubiquitinase from Wolbachia pipientis wMel bound to ubiquitin 分子名称: CITRATE ANION, OTU domain-containing protein wMelOTU, Ubiquitin 著者 Schubert, A.F, Pruneda, J.N, Komander, D. 登録日 2020-03-23 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.82 Å) 主引用文献 Identification and characterization of diverse OTU deubiquitinases in bacteria. Embo J., 39, 2020
4DWF	Crystal structure of a HLA-B associated transcript 3 (BAT3) from Homo sapiens at 1.80 A resolution 分子名称: HLA-B-associated transcript 3, SULFATE ION 著者 Joint Center for Structural Genomics (JCSG), Partnership for T-Cell Biology (TCELL) 登録日 2012-02-24 公開日 2012-03-28 最終更新日 2023-02-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Crystal structure of a HLA-B associated transcript 3 (BAT3) from Homo sapiens at 1.80 A resolution To be published
6FJ7	Caldiarchaeum Subterraneum Ubiquitin 分子名称: SULFATE ION, Ubiquitin-like protein 著者 Wojtynek, M, Martin, J, Hartmann, M.D. 登録日 2018-01-21 公開日 2018-07-25 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.05 Å) 主引用文献 Rpn11-mediated ubiquitin processing in an ancestral archaeal ubiquitination system. Nat Commun, 9, 2018
1BT0	STRUCTURE OF UBIQUITIN-LIKE PROTEIN, RUB1 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, PROTEIN (UBIQUITIN-LIKE PROTEIN 7, RUB1), ... 著者 Delacruz, W.P, Fisher, A.J. 登録日 1998-09-02 公開日 1998-12-30 最終更新日 2023-08-09 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 The rub family of ubiquitin-like proteins. Crystal structure of Arabidopsis rub1 and expression of multiple rubs in Arabidopsis. J.Biol.Chem., 273, 1998
5XPK	Crystal structure of ubiquitin-k6mimic 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Man, P, Shuai, G, Qian, Q, Lei, L. 登録日 2017-06-03 公開日 2017-07-19 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.274 Å) 主引用文献 Structure of ubiquitin-k6mimic at 2.27 Angstroms resolution. To Be Published
5XQM	NMR solution structure of SMO1, Sumo homologue in Caenorhabditis elegans 分子名称: Small ubiquitin-related modifier 著者 Gowda, C.M, Surana, P, Das, R. 登録日 2017-06-07 公開日 2017-11-08 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural and functional analysis of SMO-1, the SUMO homolog in Caenorhabditis elegans PLoS ONE, 12, 2017
1D3Z	UBIQUITIN NMR STRUCTURE 分子名称: PROTEIN (UBIQUITIN) 著者 Cornilescu, G, Marquardt, J.L, Ottiger, M, Bax, A. 登録日 1999-10-01 公開日 1999-10-14 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Validation of Protein Structure from Anisotropic Carbonyl Chemical Shifts in a Dilute Liquid Crystalline Phase J.Am.Chem.Soc., 120, 1998
5XIU	Crystal structure of RNF168 UDM2 in complex with Lys63-linked diubiquitin 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, E3 ubiquitin-protein ligase RNF168, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a 著者 Takahashi, T.S, Sato, Y, Fukai, S. 登録日 2017-04-27 公開日 2018-03-07 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Structural insights into two distinct binding modules for Lys63-linked polyubiquitin chains in RNF168. Nat Commun, 9, 2018
5XK4	Retracted state of S65-phosphorylated ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Dong, X, Gong, Z, Qin, L.Y, Ran, M.L, Zhang, C.L, Liu, K, Liu, Z, Zhang, W.P, Tang, C. 登録日 2017-05-05 公開日 2017-06-28 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Ubiquitin S65 phosphorylation engenders a pH-sensitive conformational switch Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 114, 2017
5XK5	Relaxed state of S65-phosphorylated ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Xu, D, Zhou, G, Qin, L.Y, Ran, M.L, Zhang, C.L, Liu, K, Liu, Z, Zhang, W.P, Tang, C. 登録日 2017-05-05 公開日 2017-06-28 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Ubiquitin S65 phosphorylation engenders a pH-sensitive conformational switch Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 114, 2017
1C3T	ROTAMER STRAIN AS A DETERMINANT OF PROTEIN STRUCTURAL SPECIFICITY 分子名称: PROTEIN (1D8 UBIQUITIN) 著者 Lazar, G.A, Johnson, E.C, Desjarlais, J.R, Handel, T.M. 登録日 1999-07-28 公開日 1999-08-20 最終更新日 2024-04-10 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Rotamer strain as a determinant of protein structural specificity. Protein Sci., 8, 1999
1F9J	STRUCTURE OF A NEW CRYSTAL FORM OF TETRAUBIQUITIN 分子名称: TETRAUBIQUITIN 著者 Phillips, C.L, Thrower, J, Pickart, C.M, Hill, C.P. 登録日 2000-07-10 公開日 2001-02-07 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Structure of a new crystal form of tetraubiquitin. Acta Crystallogr.,Sect.D, 57, 2001
1G6J	STRUCTURE OF RECOMBINANT HUMAN UBIQUITIN IN AOT REVERSE MICELLES 分子名称: UBIQUITIN 著者 Babu, C.R, Flynn, P.F, Wand, A.J. 登録日 2000-11-06 公開日 2001-03-28 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Validation of protein structure from preparations of encapsulated proteins dissolved in low viscosity fluids. J.Am.Chem.Soc., 123, 2001
2RU6	The pure alternative state of ubiquitin 分子名称: Ubiquitin 著者 Kitazawa, S, Kameda, T, Kumo, A, Utsumi, M, Baxter, N, Kato, K, Williamson, M.P, Kitahara, R. 登録日 2013-12-04 公開日 2014-02-12 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Close Identity between Alternatively Folded State N2 of Ubiquitin and the Conformation of the Protein Bound to the Ubiquitin-Activating Enzyme Biochemistry, 53, 2014
4S22	Crystal structure of K29 linked di-Ubiquitin 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, GLYCEROL, IODIDE ION, ... 著者 Kristariyanto, Y.A, Abdul Rehman, S.A, Campbell, D.G, Morrice, N.A, Johnson, C, Toth, R, Kulathu, Y. 登録日 2015-01-17 公開日 2015-04-08 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 K29-selective ubiquitin binding domain reveals structural basis of specificity and heterotypic nature of k29 polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015
4UN2	Crystal structure of the UBA domain of Dsk2 in complex with Ubiquitin 分子名称: UBIQUITIN, UBIQUITIN DOMAIN-CONTAINING PROTEIN DSK2 著者 Michielssens, S, Peters, J.H, Ban, D, Pratihar, S, Seeliger, D, Sharma, M, Giller, K, Sabo, T.M, Becker, S, Lee, D, Griesinger, C, de Groot, B.L. 登録日 2014-05-23 公開日 2014-08-27 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.51 Å) 主引用文献 A Designed Conformational Shift to Control Protein Binding Specificity. Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 53, 2014
2RSU	Alternative structure of Ubiquitin 分子名称: Ubiquitin 著者 Kitazawa, S, Kameda, T, Yagi-Utsumi, M, Kato, K, Kitahara, R. 登録日 2012-06-15 公開日 2013-03-27 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution Structure of the Q41N Variant of Ubiquitin as a Model for the Alternatively Folded N2 State of Ubiquitin Biochemistry, 52, 2013
2W9N	crystal structure of linear di-ubiquitin 分子名称: CHLORIDE ION, UBIQUITIN, ZINC ION 著者 Komander, D, Reyes-Turcu, F, Wilkinson, K.D, Barford, D. 登録日 2009-01-27 公開日 2009-04-28 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å) 主引用文献 Molecular Discrimination of Structurally Equivalent Lys 63-Linked and Linear Polyubiquitin Chains. Embo Rep., 10, 2009
2WWZ	TAB2 NZF DOMAIN IN COMPLEX WITH Lys63-linked di-ubiquitin, P212121 分子名称: MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE KINASE 7-INTERACTING PROTEIN 2, UBIQUITIN, ZINC ION 著者 Kulathu, Y, Akutsu, M, Bremm, A, Hofmann, K, Komander, D. 登録日 2009-10-30 公開日 2009-11-24 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.4 Å) 主引用文献 Two-Sided Ubiquitin Binding Explains Specificity of the Tab2 Nzf Domain Nat.Struct.Mol.Biol., 16, 2009

 

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