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5L1Z	TAR complex with HIV-1 Tat-AFF4-P-TEFb 分子名称: AF4/FMR2 family member 4, Cyclin-T1, Cyclin-dependent kinase 9, ... 著者 Schulze-Gahmen, U, Hurley, J. 登録日 2016-07-29 公開日 2016-10-26 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (5.9 Å) 主引用文献 Insights into HIV-1 proviral transcription from integrative structure and dynamics of the Tat:AFF4:P-TEFb:TAR complex. Elife, 5, 2016
6TUQ	Cryo-EM structure of Pf4 bacteriophage coat protein without ssDNA 分子名称: Coat protein B of bacteriophage Pf1 著者 Tarafder, A.K, von Kugelgen, A, Bharat, T.A.M. 登録日 2020-01-08 公開日 2020-02-26 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.9 Å) 主引用文献 Phage liquid crystalline droplets form occlusive sheaths that encapsulate and protect infectious rod-shaped bacteria. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 117, 2020
2KH5	Solution Structure of cis-5R,6S-thymine glycol opposite complementary adenine in duplex DNA 分子名称: 5'-D(*AP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*CP*GP*CP*AP*C)-3', 5'-D(*GP*TP*GP*CP*GP*(CTG)P*GP*TP*TP*TP*GP*T)-3' 著者 Brown, K.L. 登録日 2009-03-24 公開日 2010-03-02 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Binding of the human nucleotide excision repair proteins XPA and XPC/HR23B to the 5R-thymine glycol lesion and structure of the cis-(5R,6S) thymine glycol epimer in the 5'-GTgG-3' sequence: destabilization of two base pairs at the lesion site Nucleic Acids Res., 38, 2010
2KH6	Solution Structure of cis-5R,6S-thymine glycol opposite complementary adenine in duplex DNA 分子名称: 5'-D(*AP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*CP*GP*CP*AP*C)-3', 5'-D(*GP*TP*GP*CP*GP*(CTG)P*GP*TP*TP*TP*GP*T)-3' 著者 Brown, K.L. 登録日 2009-03-24 公開日 2010-03-02 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Binding of the human nucleotide excision repair proteins XPA and XPC/HR23B to the 5R-thymine glycol lesion and structure of the cis-(5R,6S) thymine glycol epimer in the 5'-GTgG-3' sequence: destabilization of two base pairs at the lesion site Nucleic Acids Res., 38, 2010
4QN0	Crystal structure of the CPS-6 mutant Q130K 分子名称: Endonuclease G, mitochondrial, MAGNESIUM ION 著者 Lin, J.L.J, Yuan, H.S. 登録日 2014-06-17 公開日 2015-06-17 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.74 Å) 主引用文献 Oxidative Stress Impairs Cell Death by Repressing the Nuclease Activity of Mitochondrial Endonuclease G Cell Rep, 16, 2016
2KYO	Dimeric human ckit-2 proto-oncogene promoter quadruplex DNA NMR, 10 structures 分子名称: 5'-D(*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*T)-3' 著者 Kuryavyi, V, Phan, A.T, Patel, D.J. 登録日 2010-06-05 公開日 2010-06-30 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structures of all parallel-stranded monomeric and dimeric G-quadruplex scaffolds of the human c-kit2 promoter. Nucleic Acids Res., 38, 2010
2KYP	Monomeric Human CKIT-2 proto-oncogene promoter quadruplex DNA NMR, 12 structures 分子名称: 5'-D(*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*TP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*T)-3' 著者 Kuryavyi, V, Phan, A.T, Patel, D.J. 登録日 2010-06-06 公開日 2010-06-30 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structures of all parallel-stranded monomeric and dimeric G-quadruplex scaffolds of the human c-kit2 promoter. Nucleic Acids Res., 38, 2010
7Y60	Cryo-EM structure of human CAF1LC bound right-handed Di-tetrasome 分子名称: Chromatin assembly factor 1 subunit A, Chromatin assembly factor 1 subunit B, Histone H3.1, ... 著者 Liu, C.P, Yu, C, Yu, Z.Y, Xu, R.M. 登録日 2022-06-18 公開日 2023-08-16 最終更新日 2023-09-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.8 Å) 主引用文献 Structural insights into histone binding and nucleosome assembly by chromatin assembly factor-1. Science, 381, 2023
1X75	CcdB:GyrA14 complex 分子名称: Cytotoxic protein ccdB, DNA gyrase subunit A 著者 Dao-Thi, M.H, Van Melderen, L, De Genst, E, Wyns, L, Loris, R. 登録日 2004-08-13 公開日 2005-05-17 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Molecular Basis of Gyrase Poisoning by the Addiction Toxin CcdB J.Mol.Biol., 348, 2005
5JPA	Hexameric HIV-1 CA H12Y mutant 分子名称: Capsid Protein P24 著者 Jacques, D.A, James, L.C. 登録日 2016-05-03 公開日 2016-08-10 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 HIV-1 uses dynamic capsid pores to import nucleotides and fuel encapsidated DNA synthesis. Nature, 536, 2016
5KED	Structure of the 2.65 Angstrom P2(1) crystal of K. pneumonia MrkH 分子名称: Flagellar brake protein YcgR 著者 Schumacher, M. 登録日 2016-06-09 公開日 2016-08-17 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.65 Å) 主引用文献 To be released: Structures of K. pneumonia MrkH: dual utilization of the PilZ fold for c-di-GMP and DNA binding by a novel activator of biofilm genes To Be Published
1XNS	Peptide trapped Holliday junction intermediate in Cre-loxP recombination 分子名称: Recombinase CRE, loxP DNA 著者 Ghosh, K, Lau, C.K, Guo, F, Segall, A.M, Van Duyne, G.D. 登録日 2004-10-05 公開日 2004-12-14 最終更新日 2023-08-23 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Peptide trapping of the Holliday junction intermediate in Cre-loxP site-specific recombination. J.Biol.Chem., 280, 2005
1XO1	T5 5'-EXONUCLEASE MUTANT K83A 分子名称: 5'-EXONUCLEASE 著者 Ceska, T.A, Suck, D, Sayers, J.R. 登録日 1998-11-19 公開日 1999-04-02 最終更新日 2023-08-23 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Mutagenesis of conserved lysine residues in bacteriophage T5 5'-3' exonuclease suggests separate mechanisms of endo-and exonucleolytic cleavage. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 96, 1999
1JI5	Dlp-1 from bacillus anthracis 分子名称: (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL, Dlp-1, FE (III) ION 著者 Papinutto, E, Dundon, W.G, Pitulis, N, Battistutta, R, Montecucco, C, Zanotti, G. 登録日 2001-06-29 公開日 2002-06-19 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structure of two iron-binding proteins from Bacillus anthracis. J.Biol.Chem., 277, 2002
1JIG	Dlp-2 from Bacillus anthracis 分子名称: Dlp-2, FE (III) ION 著者 Papinutto, E, Dundon, W.G, Pitulis, N, Battistutta, R, Montecucco, C, Zanotti, G. 登録日 2001-07-02 公開日 2002-06-19 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.46 Å) 主引用文献 Structure of two iron-binding proteins from Bacillus anthracis. J.Biol.Chem., 277, 2002
8BA5	Crystal structure of the DNMT3A ADD domain 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, MAGNESIUM ION, ... 著者 Linhard, V, Kunert, S, Wollenhaupt, J, Broehm, A, Schwalbe, H, Jeltsch, A. 登録日 2022-10-11 公開日 2022-11-23 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.45 Å) 主引用文献 The MECP2-TRD domain interacts with the DNMT3A-ADD domain at the H3-tail binding site. Protein Sci., 32, 2023
6SQG	Crystal structure of viral rhodopsin OLPVRII 分子名称: (2S)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate, EICOSANE, RETINAL, ... 著者 Gushchin, I, Kovalev, K, Bratanov, D, Polovinkin, V, Astashkin, R, Popov, A, Bourenkov, G, Gordeliy, V. 登録日 2019-09-03 公開日 2019-11-06 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Unique structure and function of viral rhodopsins. Nat Commun, 10, 2019
7KH1	Baseplate Complex for Myoviridae Phage XM1 分子名称: baseplate organization protein, gp11, baseplate stabilizing protein, ... 著者 Wang, Z, Klose, T, Jiang, W, Kuhn, R.J. 登録日 2020-10-19 公開日 2021-10-27 最終更新日 2024-05-29 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.2 Å) 主引用文献 Structure of Vibrio phage XM1, a simple contractile DNA injection machine Biorxiv, 2021
7KLN	Myoviridae Phage XM1 Neck Region (12-fold) 分子名称: Head completion protein, gp1, Portal protein 著者 Wang, Z, Klose, T, Jiang, W, Kuhn, R.J. 登録日 2020-10-30 公開日 2021-11-03 最終更新日 2022-05-25 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.6 Å) 主引用文献 Structure of Vibrio phage XM1, a simple contractile DNA injection machine Biorxiv, 2021
7KJK	The Neck region of Phage XM1 (6-fold symmetry) 分子名称: Collar spike protein, Head completion protein, Tail sheath protein, ... 著者 Wang, Z, Klose, T, Jiang, W, Kuhn, R.J. 登録日 2020-10-26 公開日 2021-11-03 最終更新日 2024-05-29 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.6 Å) 主引用文献 Structure of Vibrio phage XM1, a simple contractile DNA injection machine Biorxiv, 2021
7KMX	The capsid of Myoviridae Phage XM1 分子名称: Major capsid protein, Minor capsid protein 著者 Wang, Z, Klose, T, Jiang, W, Kuhn, R.J. 登録日 2020-11-03 公開日 2021-11-10 最終更新日 2024-05-29 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.2 Å) 主引用文献 Structure of Vibrio phage XM1, a simple contractile DNA injection machine Biorxiv, 2021
1JUX	1.6A Resolution Crystal Structures of the DNA Octamers d(IUATATAC) and d(ITITACAC):Binding of Two Distamycin Drugs Side-by-Side 分子名称: 5'-D(*IP*TP*IP*TP*AP*CP*AP*C)-3', DISTAMYCIN A 著者 Deng, J, Pan, B, Sundaralingam, M. 登録日 2001-08-28 公開日 2004-01-27 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 Structure of d(ITITACAC) complexed with distamycin at 1.6 A resolution. Acta Crystallogr.,Sect.D, 59, 2003
1EMV	CRYSTAL STRUCTURE OF COLICIN E9 DNASE DOMAIN WITH ITS COGNATE IMMUNITY PROTEIN IM9 (1.7 ANGSTROMS) 分子名称: COLICIN E9, IMMUNITY PROTEIN IM9, PHOSPHATE ION 著者 Kuhlmann, U.C, Pommer, A.J, Moore, G.M, James, R, Kleanthous, C. 登録日 2000-03-20 公開日 2000-09-13 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 Specificity in protein-protein interactions: the structural basis for dual recognition in endonuclease colicin-immunity protein complexes. J.Mol.Biol., 301, 2000
1T5L	Crystal structure of the DNA repair protein UvrB point mutant Y96A revealing a novel fold for domain 2 分子名称: UvrABC system protein B, ZINC ION 著者 Truglio, J.J, Croteau, D.L, Skorvaga, M, DellaVecchia, M.J, Theis, K, Mandavilli, B.S, Van Houten, B, Kisker, C. 登録日 2004-05-04 公開日 2004-06-22 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Interactions between UvrA and UvrB: the role of UvrB's domain 2 in nucleotide excision repair Embo J., 23, 2004
7D69	Cryo-EM structure of the nucleosome containing Giardia histones 分子名称: 601L DNA (145-MER), Histone H2A, Histone H2B, ... 著者 Sato, S, Takizawa, Y, Kurumizaka, H. 登録日 2020-09-29 公開日 2021-09-08 最終更新日 2024-05-29 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.57 Å) 主引用文献 Cryo-EM structure of the nucleosome core particle containing Giardia lamblia histones. Nucleic Acids Res., 49, 2021

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