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7KC0	Structure of the Saccharomyces cerevisiae replicative polymerase delta in complex with a primer/template and the PCNA clamp 分子名称: 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, DNA (25-MER), DNA (5'-D(P*AP*TP*GP*AP*CP*CP*AP*TP*GP*AP*TP*TP*AP*CP*GP*AP*AP*TP*TP*GP*C)-3'), ... 著者 Zheng, F, Georgescu, R, Li, H, O'Donnell, M.E. 登録日 2020-10-04 公開日 2020-12-02 最終更新日 2020-12-16 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.2 Å) 主引用文献 Structure of eukaryotic DNA polymerase delta bound to the PCNA clamp while encircling DNA. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 117, 2020
3JA9	Structure of native human PCNA 分子名称: Proliferating cell nuclear antigen 著者 Lau, W.C.Y, Li, Y, Zhang, Q, Huen, M.S.Y. 登録日 2015-05-19 公開日 2015-12-09 最終更新日 2019-12-18 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (22 Å) 主引用文献 Molecular architecture of the Ub-PCNA/Pol eta complex bound to DNA Sci Rep, 5, 2015
3L0W	Structure of split monoubiquitinated PCNA with ubiquitin in position two 分子名称: Monoubiquitinated Proliferating cell nuclear antigen, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Freudenthal, B.D, Gakhar, L, Ramaswamy, S, Washington, M.T. 登録日 2009-12-10 公開日 2010-03-23 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structure of monoubiquitinated PCNA and implications for translesion synthesis and DNA polymerase exchange. Nat.Struct.Mol.Biol., 17, 2010
6HVO	Crystal structure of human PCNA in complex with three peptides of p12 subunit of human polymerase delta 分子名称: DNA polymerase delta subunit 4, Proliferating cell nuclear antigen, SULFATE ION 著者 Gonzalez-Magana, A, Romano-Moreno, M, Rojas, A.L, Blanco, F.J, De Biasio, A. 登録日 2018-10-11 公開日 2019-01-23 最終更新日 2019-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 The p12 subunit of human polymerase delta uses an atypical PIP box for molecular recognition of proliferating cell nuclear antigen (PCNA). J.Biol.Chem., 294, 2019
5DA7	monomeric PCNA bound to a small protein inhibitor 分子名称: DNA polymerase sliding clamp 1, Proliferating cell nuclear antigen, SULFATE ION, ... 著者 Ladner, J.E, Altieri, A.S, Kelman, Z. 登録日 2015-08-19 公開日 2016-05-11 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.802 Å) 主引用文献 A small protein inhibits proliferating cell nuclear antigen by breaking the DNA clamp. Nucleic Acids Res., 44, 2016
3L10	Structure of split monoubiquitinated PCNA with ubiquitin in position one 分子名称: Monoubiquitinated Proliferating cell nuclear antigen, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Freudenthal, B.D, Gakhar, L, Ramaswamy, S, Washington, M.T. 登録日 2009-12-10 公開日 2010-03-23 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structure of monoubiquitinated PCNA and implications for translesion synthesis and DNA polymerase exchange. Nat.Struct.Mol.Biol., 17, 2010
6K3A	Crystal structure of human PCNA in complex with DNMT1 PIP box motif. 分子名称: Peptide from DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Jimenji, T, Kori, S, Arita, K. 登録日 2019-05-17 公開日 2019-06-26 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Structure of PCNA in complex with DNMT1 PIP box reveals the basis for the molecular mechanism of the interaction. Biochem.Biophys.Res.Commun., 516, 2019
5DAI	Proliferating cell nuclear antigen homolog 1 bound to FEN-1 peptide 分子名称: C-terminus of FEN-1 protein, DNA polymerase sliding clamp 1, SULFATE ION 著者 Ladner, J.E, Altieri, A.S, Kelman, Z. 登録日 2015-08-20 公開日 2016-05-11 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 A small protein inhibits proliferating cell nuclear antigen by breaking the DNA clamp. Nucleic Acids Res., 44, 2016
7M5M	PCNA bound to peptide mimetic 分子名称: N-BUTANE, Peptide mimetic (ACE)RQCSMTCFYHSK(NH2) with linker, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Vandborg, B.A, Bruning, J.B. 登録日 2021-03-24 公開日 2021-08-11 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 A cell permeable bimane-constrained PCNA-interacting peptide. Rsc Chem Biol, 2, 2021
7M5L	PCNA bound to peptide mimetic with linker 分子名称: PROPANE, Peptide mimetic (ACE)RQCSMTCFYHSK(NH2) with linker, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Vandborg, B.A, Bruning, J.B. 登録日 2021-03-24 公開日 2021-08-11 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 A cell permeable bimane-constrained PCNA-interacting peptide. Rsc Chem Biol, 2, 2021
7M5N	PCNA bound to peptide mimetic with linker 分子名称: 1,3-dimethylbenzene, Peptide mimetic (ACE)RQCSMTCFYHSK(NH2) with linker, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Vandborg, B.A, Bruning, J.B. 登録日 2021-03-24 公開日 2021-08-11 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.11 Å) 主引用文献 A cell permeable bimane-constrained PCNA-interacting peptide. Rsc Chem Biol, 2, 2021
7KQ1	PCNA bound to truncated peptide mimetic 分子名称: LYS-ARG-ARG-GLN-THR-SER-MET-THR-ASP-PHE-TYR-HIS-SER-LYS-ARG, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Vandborg, B.A, Bruning, J.B. 登録日 2020-11-13 公開日 2021-05-19 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.3 Å) 主引用文献 Unlocking the PIP-box: A peptide library reveals interactions that drive high-affinity binding to human PCNA. J.Biol.Chem., 296, 2021
7KQ0	PCNA bound to peptide mimetic 分子名称: LYS-ARG-ARG-GLN-THR-SER-MET-THR-ASP-TYR-TYR-HIS-SER-LYS-ARG, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Vandborg, B.A, Bruning, J.B. 登録日 2020-11-13 公開日 2021-05-19 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Unlocking the PIP-box: A peptide library reveals interactions that drive high-affinity binding to human PCNA. J.Biol.Chem., 296, 2021
6KNB	PolD-PCNA-DNA (form A) 分子名称: DNA polymerase D DP2 (DNA polymerase II large) subunit, DNA polymerase II small subunit, DNA polymerase sliding clamp 1, ... 著者 Mayanagi, K, Oki, K, Miyazaki, N, Ishino, S, Yamagami, T, Iwasaki, K, Kohda, D, Morikawa, K, Shirai, T, Ishino, Y. 登録日 2019-08-05 公開日 2020-08-05 最終更新日 2021-02-17 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (6.9 Å) 主引用文献 Two conformations of DNA polymerase D-PCNA-DNA, an archaeal replisome complex, revealed by cryo-electron microscopy. Bmc Biol., 18, 2020
5AUJ	Pyrococcus furiosus proliferating cell nuclear antigen (PCNA) SeMet derivative 分子名称: DNA polymerase sliding clamp 著者 Watanabe, Y, Oyama, T. 登録日 2015-04-21 公開日 2016-04-27 最終更新日 2020-02-19 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Pyrococcus furiosus proliferating cell nuclear antigen (PCNA) SeMet derivative To Be Published
6KNC	PolD-PCNA-DNA (form B) 分子名称: DNA polymerase D DP2 (DNA polymerase II large) subunit, DNA polymerase II small subunit, DNA polymerase sliding clamp 1, ... 著者 Mayanagi, K, Oki, K, Miyazaki, N, Ishino, S, Yamagami, T, Iwasaki, K, Kohda, D, Morikawa, K, Shirai, T, Ishino, Y. 登録日 2019-08-05 公開日 2020-08-05 最終更新日 2024-03-27 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (9.3 Å) 主引用文献 Two conformations of DNA polymerase D-PCNA-DNA, an archaeal replisome complex, revealed by cryo-electron microscopy. Bmc Biol., 18, 2020
5E0U	Human PCNA variant (S228I) complexed with p21 at 1.9 Angstroms 分子名称: Cyclin-dependent kinase inhibitor 1, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Duffy, C.M, Hilbert, B.J, Kelch, B.A. 登録日 2015-09-29 公開日 2016-04-20 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.93 Å) 主引用文献 A Disease-Causing Variant in PCNA Disrupts a Promiscuous Protein Binding Site. J.Mol.Biol., 428, 2016
5E0V	Human PCNA variant (S228I) complexed with FEN1 at 2.1 Angstroms 分子名称: Flap endonuclease 1, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Duffy, C.M, Hilbert, B.J, Kelch, B.A. 登録日 2015-09-29 公開日 2016-04-20 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.074 Å) 主引用文献 A Disease-Causing Variant in PCNA Disrupts a Promiscuous Protein Binding Site. J.Mol.Biol., 428, 2016
2HIK	heterotrimeric PCNA sliding clamp 分子名称: PCNA1 (SSO0397), PCNA2 (SSO1047), PCNA3 (SSO0405) 著者 Pascal, J.M, Tsodikov, O.V, Ellenberger, T. 登録日 2006-06-29 公開日 2006-11-07 最終更新日 2017-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.3 Å) 主引用文献 A Flexible Interface between DNA Ligase and PCNA Supports Conformational Switching and Efficient Ligation of DNA. Mol.Cell, 24, 2006
2HII	heterotrimeric PCNA sliding clamp 分子名称: PCNA1 (SSO0397), PCNA2 (SSO1047), PCNA3 (SSO0405) 著者 Pascal, J.M, Tsodikov, O.V, Ellenberger, T. 登録日 2006-06-29 公開日 2006-11-07 最終更新日 2017-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.79 Å) 主引用文献 A Flexible Interface between DNA Ligase and PCNA Supports Conformational Switching and Efficient Ligation of DNA. Mol.Cell, 24, 2006
6S1O	Human polymerase delta holoenzyme Conformer 3 分子名称: DNA polymerase delta catalytic subunit, DNA polymerase delta subunit 2, DNA polymerase delta subunit 3, ... 著者 Lancey, C, Hamdan, S.M, De Biasio, A. 登録日 2019-06-19 公開日 2019-12-25 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (8.1 Å) 主引用文献 Structure of the processive human Pol delta holoenzyme. Nat Commun, 11, 2020
6AIG	Crystal structure of PCNA1 from Aeropyrum pernix 分子名称: DNA polymerase sliding clamp 1 著者 Yamauchi, T, Kikuchi, M, Tsunoda, M. 登録日 2018-08-23 公開日 2018-09-26 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Crystal structure of PCNA1 from Aeropyrum pernix To Be Published
6T7Y	Structure of PCNA bound to cPIP motif of DP2 from P. abyssi 分子名称: DNA polymerase sliding clamp, cPIP motif from the DP2 large subunit of PolD 著者 Madru, C, Raia, P, Hugonneau Beaufet, I, Delarue, M, Carroni, M, Sauguet, L. 登録日 2019-10-23 公開日 2020-03-04 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Structural basis for the increased processivity of D-family DNA polymerases in complex with PCNA. Nat Commun, 11, 2020
6CX2	S177G Mutant of Yeast PCNA 分子名称: Proliferating cell nuclear antigen 著者 Powers, K.T. 登録日 2018-04-02 公開日 2018-04-11 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.101 Å) 主引用文献 Identification of New Mutations at the PCNA Subunit Interface that Block Translesion Synthesis. PLoS ONE, 11, 2016
6TNY	Processive human polymerase delta holoenzyme 分子名称: DNA polymerase delta catalytic subunit, DNA polymerase delta subunit 2, DNA polymerase delta subunit 3, ... 著者 Lancey, C, Hamdan, S.M, De Biasio, A. 登録日 2019-12-10 公開日 2019-12-18 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.08 Å) 主引用文献 Structure of the processive human Pol delta holoenzyme. Nat Commun, 11, 2020

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