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4FJH	RB69 DNA polymerase ternary complex with dGTP/dC 分子名称: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.11 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
6QZK	Structure of Clostridium butyricum Argonaute bound to a guide DNA (5' deoxycytidine) and a 19-mer target DNA 分子名称: Clostridium butyricum Argonaute, DNA target (5'-D(T*AP*TP*AP*CP*AP*AP*CP*CP*TP*AP*CP*TP*AP*CP*CP*TP*CP*T)-3'), FORMIC ACID, ... 著者 Swarts, D.C, Jinek, M, Hegge, J.W, Van der Oost, J. 登録日 2019-03-11 公開日 2019-04-24 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.548 Å) 主引用文献 DNA-guided DNA cleavage at moderate temperatures by Clostridium butyricum Argonaute. Nucleic Acids Res., 47, 2019
4FJJ	RB69 DNA polymerase ternary complex with dTTP/dC 分子名称: CALCIUM ION, DNA polymerase, DNA primer, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.99 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FJM	RB69 DNA polymerase ternary complex with dCTP/dA 分子名称: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.02 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FJN	RB69 DNA polymerase ternary complex with dTTP/dA 分子名称: CALCIUM ION, DNA polymerase, DNA primer, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.98 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
6RAU	PostS3_Pmar_lig4_WT 分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE, ATP-dependent DNA ligase, DNA (5'-D(*AP*TP*TP*GP*CP*GP*AP*CP*CP*CP*CP*AP*CP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*A)-3'), ... 著者 Leiros, H.K.S, Williamson, A. 登録日 2019-04-08 公開日 2019-07-10 最終更新日 2024-05-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.99 Å) 主引用文献 Structural intermediates of a DNA-ligase complex illuminate the role of the catalytic metal ion and mechanism of phosphodiester bond formation. Nucleic Acids Res., 47, 2019
4FK2	RB69 DNA polymerase ternary complex with dTTP/dG 分子名称: CALCIUM ION, DNA polymerase, DNA primer, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-12 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.98 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
8EZ9	Dimeric complex of DNA-PKcs 分子名称: DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, unknown region of DNA-PKcs 著者 Chen, S, He, Y. 登録日 2022-10-31 公開日 2023-06-14 最終更新日 2024-06-19 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (5.67 Å) 主引用文献 Cryo-EM visualization of DNA-PKcs structural intermediates in NHEJ. Sci Adv, 9, 2023
6RAS	Pmar-Lig_Pre. 分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE, ATP-dependent DNA ligase, DNA, ... 著者 Leiros, H.K.S, Williamson, A. 登録日 2019-04-07 公開日 2019-07-10 最終更新日 2024-05-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.75 Å) 主引用文献 Structural intermediates of a DNA-ligase complex illuminate the role of the catalytic metal ion and mechanism of phosphodiester bond formation. Nucleic Acids Res., 47, 2019
5JH0	Crystal structure of the mitochondrial DNA packaging protein Abf2p in complex with DNA at 2.18 Angstrom resolution 分子名称: ARS-binding factor 2, mitochondrial, DNA (5'-D(*AP*AP*TP*AP*AP*TP*AP*AP*AP*TP*TP*AP*TP*AP*TP*AP*AP*TP*AP*TP*AP*A)-3'), ... 著者 Chakraborty, A, Lyonnais, S, Sola, M. 登録日 2016-04-20 公開日 2017-02-08 最終更新日 2024-05-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.18 Å) 主引用文献 DNA structure directs positioning of the mitochondrial genome packaging protein Abf2p. Nucleic Acids Res., 45, 2017
4FJG	RB69 DNA polymerase ternary complex with dATP/dC 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.02 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FK0	RB69 DNA polymerase ternary complex with dCTP/dG 分子名称: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-12 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.18 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
4FJL	RB69 DNA polymerase ternary complex with dGTP/dA 分子名称: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA polymerase, ... 著者 Xia, S, Wang, J, Konigsberg, W.H. 登録日 2012-06-11 公開日 2012-12-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.87 Å) 主引用文献 DNA mismatch synthesis complexes provide insights into base selectivity of a B family DNA polymerase. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
7T20	E. coli DnaB bound to ssDNA and AMPPNP 分子名称: DNA (5'-D(*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*TP*T)-3'), MAGNESIUM ION, PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER, ... 著者 Oakley, A.J, Xu, Z.Q. 登録日 2021-12-02 公開日 2022-12-14 最終更新日 2024-06-05 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.7 Å) 主引用文献 Sequence of conformation changes of DnaB helicase during DNA unwinding and priming in Escherichia coli To Be Published
5JGH	Crystal structure of the mitochondrial DNA packaging protein Abf2p in complex with DNA at 2.6 Angstrom resolution 分子名称: ACETATE ION, ARS-binding factor 2, mitochondrial, ... 著者 Chakraborty, A, Lyonnais, S, Sola, M. 登録日 2016-04-20 公開日 2017-02-08 最終更新日 2024-05-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 DNA structure directs positioning of the mitochondrial genome packaging protein Abf2p. Nucleic Acids Res., 45, 2017
3G8X	GR DNA binding domain:GilZ 16bp complex-65 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, DNA (5'-D(*AP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*TP*TP*GP*GP*GP*TP*TP*CP*C)-3'), DNA (5'-D(*TP*GP*GP*AP*AP*CP*CP*CP*AP*AP*TP*GP*TP*TP*CP*T)-3'), ... 著者 Pufall, M.A, Yamamoto, K.R, Meijsing, S.H. 登録日 2009-02-12 公開日 2009-04-21 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.05 Å) 主引用文献 DNA binding site sequence directs glucocorticoid receptor structure and activity. Science, 324, 2009
4ELU	Snapshot of the large fragment of DNA polymerase I from Thermus Aquaticus processing modified pyrimidines 分子名称: 2'-deoxy-5-[(4-ethynylphenyl)ethynyl]cytidine 5'-(tetrahydrogen triphosphate), ACETATE ION, DNA (5'-D(*AP*AP*AP*GP*CP*GP*CP*GP*CP*CP*GP*TP*GP*GP*TP*C)-3'), ... 著者 Marx, A, Diederichs, K, Obeid, S. 登録日 2012-04-11 公開日 2013-03-27 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Interactions of non-polar and "Click-able" nucleotides in the confines of a DNA polymerase active site. Chem.Commun.(Camb.), 48, 2012
3FYL	GR DNA binding domain:CGT complex 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, DNA (5'-D(*AP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*TP*CP*CP*G)-3'), DNA (5'-D(*TP*CP*GP*GP*AP*CP*AP*AP*AP*AP*TP*GP*TP*TP*CP*T)-3'), ... 著者 Pufall, M.A, Yamamoto, K.R, Meijsing, S.H. 登録日 2009-01-22 公開日 2009-04-21 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.63 Å) 主引用文献 DNA binding site sequence directs glucocorticoid receptor structure and activity. Science, 324, 2009
3G99	GR DNA binding domain:Pal complex-9 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, BROMIDE ION, DNA (5'-D(*AP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*TP*TP*CP*T)-3'), ... 著者 Pufall, M.A, Yamamoto, K.R, Meijsing, S.H. 登録日 2009-02-13 公開日 2009-04-21 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.81 Å) 主引用文献 DNA binding site sequence directs glucocorticoid receptor structure and activity. Science, 324, 2009
3G9I	GR DNA Binding domain: Pal complex-35 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, DNA (5'-D(*AP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*TP*TP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*AP*AP*AP*TP*GP*TP*TP*CP*T)-3'), ... 著者 Pufall, M.A, Yamamoto, K.R, Meijsing, S.H. 登録日 2009-02-13 公開日 2009-04-21 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 DNA binding site sequence directs glucocorticoid receptor structure and activity. Science, 324, 2009
4YNQ	TREX1-dsDNA complex 分子名称: DNA (24-MER), DNA (5'-D(P*GP*TP*GP*CP*TP*GP*AP*CP*GP*TP*CP*AP*GP*CP*AP*CP*GP*AP*CP*G)-3'), MAGNESIUM ION, ... 著者 Fye, J.M, Harvey, S, Perrino, F.W, Hollis, T. 登録日 2015-03-10 公開日 2015-05-27 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Exonuclease TREX1 degrades double-stranded DNA to prevent spontaneous lupus-like inflammatory disease. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 112, 2015
4ELT	Snapshot of the large fragment of DNA polymerase I from Thermus Aquaticus processing modified pyrimidines 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, 2'-deoxy-5-[(4-ethynylphenyl)ethynyl]uridine 5'-(tetrahydrogen triphosphate), ACETATE ION, ... 著者 Marx, A, Diederichs, K, Obeid, S. 登録日 2012-04-11 公開日 2013-03-27 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Interactions of non-polar and "Click-able" nucleotides in the confines of a DNA polymerase active site. Chem.Commun.(Camb.), 48, 2012
7K11	CryoEM structure of inactivated-form FATKIN domain of DNA-PK 分子名称: DNA-dependent protein kinase catalytic subunit 著者 Chen, X, Gellert, M, Yang, W. 登録日 2020-09-06 公開日 2021-01-06 最終更新日 2024-03-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.21 Å) 主引用文献 Structure of an activated DNA-PK and its implications for NHEJ. Mol.Cell, 81, 2021
3G9J	GR DNA binding domain:Pal, 18bp complex-36 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, DNA (5'-D(*CP*CP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*AP*AP*AP*TP*GP*TP*TP*CP*TP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*CP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*TP*TP*CP*TP*G)-3'), ... 著者 Pufall, M.A, Yamamoto, K.R, Meijsing, S.H. 登録日 2009-02-13 公開日 2009-04-21 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.32 Å) 主引用文献 DNA binding site sequence directs glucocorticoid receptor structure and activity. Science, 324, 2009
3G6P	GR DNA binding domain:FKBP5 complex, 18bp 分子名称: ACETATE ION, DNA (5'-D(*CP*CP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*CP*CP*CP*TP*GP*TP*TP*CP*TP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*CP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*TP*GP*TP*TP*CP*TP*G)-3'), ... 著者 Pufall, M.A, Yamamoto, K.R, Meijsing, S.H. 登録日 2009-02-07 公開日 2009-04-21 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.985 Å) 主引用文献 DNA binding site sequence directs glucocorticoid receptor structure and activity. Science, 324, 2009

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