3DJ5
| Crystal structure of the mouse Aurora-A catalytic domain (Asn186->Gly, Lys240->Arg, Met302->Leu) in complex with Compound 290. | 分子名称: | 3-({3-[(6-amino-5-bromopyrimidin-4-yl)sulfanyl]propanoyl}amino)-4-methoxy-N-phenylbenzamide, serine/threonine kinase 6 | 著者 | Elling, R.A, Erlanson, D.A, Yang, W, Tangonan, B.T, Hansen, S.K, Romanowski, M.J. | 登録日 | 2008-06-22 | 公開日 | 2009-05-05 | 最終更新日 | 2023-08-30 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) | 主引用文献 | New fragment-based drug discovery To be Published
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3DJ6
| Crystal structure of the mouse Aurora-A catalytic domain (Asn186->Gly, Lys240->Arg, Met302->Leu) in complex with Compound 823. | 分子名称: | 4-methoxy-N-phenyl-3-({3-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-ylmethyl)sulfanyl]propanoyl}amino)benzamide, serine/threonine kinase 6 | 著者 | Elling, R.A, Erlanson, D.A, Yang, W, Tangonan, B.T, Hansen, S.K, Romanowski, M.J. | 登録日 | 2008-06-22 | 公開日 | 2009-05-05 | 最終更新日 | 2023-08-30 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) | 主引用文献 | New fragment-based drug discovery To be Published
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3MR6
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex with a CPD 2bp upstream of the active site (TT4) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA (5'-D(*C*AP*TP*CP*AP*(TTD)P*AP*CP*GP*AP*GP*C)-3'), DNA (5'-D(*TP*CP*TP*CP*GP*TP*AP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Biertumpfel, C, Zhao, Y, Ramon-Maiques, S, Gregory, M.T, Lee, J.Y, Yang, W. | 登録日 | 2010-04-28 | 公開日 | 2010-06-30 | 最終更新日 | 2024-04-03 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) | 主引用文献 | Structure and mechanism of human DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
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3MR2
| Human DNA polymerase eta in complex with normal DNA and incoming nucleotide (Nrm) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*T*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Biertumpfel, C, Zhao, Y, Ramon-Maiques, S, Gregory, M.T, Lee, J.Y, Yang, W. | 登録日 | 2010-04-28 | 公開日 | 2010-06-30 | 最終更新日 | 2024-02-21 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.83 Å) | 主引用文献 | Structure and mechanism of human DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
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3MR5
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex with a CPD 1bp upstream of the active site (TT3) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA (5'-D(*AP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*AP*A)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*AP*CP*(TTD)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*A)-3'), ... | 著者 | Biertumpfel, C, Zhao, Y, Ramon-Maiques, S, Gregory, M.T, Lee, J.Y, Yang, W. | 登録日 | 2010-04-28 | 公開日 | 2010-06-30 | 最終更新日 | 2024-04-03 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) | 主引用文献 | Structure and mechanism of human DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
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3MR3
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex with the 3'T of a CPD in the active site (TT1) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*(TTD)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Biertumpfel, C, Zhao, Y, Ramon-Maiques, S, Gregory, M.T, Lee, J.Y, Yang, W. | 登録日 | 2010-04-28 | 公開日 | 2010-06-30 | 最終更新日 | 2024-02-21 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) | 主引用文献 | Structure and mechanism of human DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
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3SI8
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex with the 5'T of a CPD in the active site (TT2) | 分子名称: | (2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-tetrahydro-2-(hydroxymethyl)furan-3-ol, 1,2-ETHANEDIOL, 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, ... | 著者 | Biertumpfel, C, Zhao, Y, Kondo, Y, Ramon-Maiques, S, Gregory, M, Lee, J.Y, Masutani, C, Lehmann, A.R, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2011-06-17 | 公開日 | 2011-08-03 | 最終更新日 | 2024-03-13 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.15 Å) | 主引用文献 | Structure and mechanism of human DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
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4BAC
| prototype foamy virus strand transfer complexes on product DNA | 分子名称: | 5'-D(*AP*GP*GP*AP*GP*CP*CP*AP*AP*GP*AP*CP*GP*GP *AP*TP*CP)-3', 5'-D(*AP*TP*TP*GP*TP*CP*AP*TP*GP*GP*AP*AP*TP*TP *TP*TP*GP*TP*AP)-3', DNA (38-MER), ... | 著者 | Yin, Z, Lapkouski, M, Yang, W, Craigie, R. | 登録日 | 2012-09-12 | 公開日 | 2012-10-10 | 最終更新日 | 2023-12-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3.263 Å) | 主引用文献 | Assembly of Prototype Foamy Virus Strand Transfer Complexes on Product DNA Bypassing Catalysis of Integration. Protein Sci., 21, 2012
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3TAT
| TYROSINE AMINOTRANSFERASE FROM E. COLI | 分子名称: | PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE, TYROSINE AMINOTRANSFERASE | 著者 | Ko, T.P, Yang, W.Z, Wu, S.P, Tsai, H, Yuan, H.S. | 登録日 | 1998-08-12 | 公開日 | 1999-08-12 | 最終更新日 | 2023-08-09 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3.5 Å) | 主引用文献 | Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the Escherichia coli tyrosine aminotransferase. Acta Crystallogr.,Sect.D, 55, 1999
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4B3P
| Structures of HIV-1 RT and RNA-DNA Complex Reveal a Unique RT Conformation and Substrate Interface | 分子名称: | DNA, P51 RT, REVERSE TRANSCRIPTASE/RIBONUCLEASE H, ... | 著者 | Lapkouski, M, Tian, L, Miller, J.T, Le Grice, S.F.J, Yang, W. | 登録日 | 2012-07-25 | 公開日 | 2013-01-16 | 最終更新日 | 2023-12-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (4.839 Å) | 主引用文献 | Complexes of HIV-1 RT, Nnrti and RNA/DNA Hybrid Reveal a Structure Compatible with RNA Degradation Nat.Struct.Mol.Biol., 20, 2013
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1X9Z
| Crystal structure of the MutL C-terminal domain | 分子名称: | CHLORIDE ION, DNA mismatch repair protein mutL, GLYCEROL, ... | 著者 | Guarne, A, Ramon-Maiques, S, Wolff, E.M, Ghirlando, R, Hu, X, Miller, J.H, Yang, W. | 登録日 | 2004-08-24 | 公開日 | 2004-10-26 | 最終更新日 | 2011-07-13 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) | 主引用文献 | Structure of the MutL C-terminal domain: a model of intact MutL and its roles in mismatch repair Embo J., 23, 2004
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4ECV
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 230 sec | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.521 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ED7
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: TG crystal at pH 7.0 (K+ MES) with 1 Ca2+ ion | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*G)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-27 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.717 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ECU
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 200 sec | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.949 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ED6
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 6.7 for 15 hr, Sideway translocation | 分子名称: | DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*A)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta, ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-27 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.211 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ECR
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 40 sec | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.892 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ECY
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 6.0 (Na+ MES) with 1 Ca2+ ion | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.943 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ED2
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 7.2 (Na+ HEPES) with 1 Ca2+ ion | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.711 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ED3
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 7.5 (Na+ HEPES) with 1 Ca2+ ion | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.791 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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1XRX
| Crystal structure of a DNA-binding protein | 分子名称: | CALCIUM ION, SeqA protein | 著者 | Guarne, A, Brendler, T, Zhao, Q, Ghirlando, R, Austin, S, Yang, W. | 登録日 | 2004-10-16 | 公開日 | 2005-05-10 | 最終更新日 | 2013-03-06 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.15 Å) | 主引用文献 | Crystal structure of a SeqA-N filament: implications for DNA replication and chromosome organization. Embo J., 24, 2005
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4ECZ
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 6.5 (Na+ MES) with 1 Ca2+ ion | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.834 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ECT
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 140 sec | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.795 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ED0
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 6.8 (Na+ MES) with 1 Ca2+ ion | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.653 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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1RYS
| REPLICATION OF A CIS-SYN THYMINE DIMER AT ATOMIC RESOLUTION | 分子名称: | 1,2-ETHANEDIOL, 5'-D(*GP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*GP*AP*TP*TP*CP*A)-3', 5'-D(*TP*CP*TP*TP*TP*GP*AP*AP*TP*CP*CP*TP*TP*CP*CP*CP*CP*C)-3', ... | 著者 | Ling, H, Boudsocq, F, Plosky, B, Woodgate, R, Yang, W. | 登録日 | 2003-12-22 | 公開日 | 2004-02-10 | 最終更新日 | 2024-02-14 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.03 Å) | 主引用文献 | Replication of a Cis-Syn Thymine Dimer at Atomic Resolution Nature, 424, 2003
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4ECS
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 80 sec | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.951 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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