3BM3
| Restriction endonuclease PspGI-substrate DNA complex | 分子名称: | CITRIC ACID, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*CP*CP*AP*GP*GP*TP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*GP*TP*AP*CP*CP*TP*GP*GP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Szczepanowski, R.H, Carpenter, M, Czapinska, H, Tamulaitis, G, Siksnys, V, Bhagwat, A, Bochtler, M. | 登録日 | 2007-12-12 | 公開日 | 2008-09-16 | 最終更新日 | 2021-10-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) | 主引用文献 | A direct crystallographic demonstration that Type II restriction endonuclease PspGI flips nucleotides To be Published
|
|
1Z7L
| |
6QM2
| NlaIV restriction endonuclease | 分子名称: | POTASSIUM ION, SODIUM ION, Type-2 restriction enzyme NlaIV | 著者 | Czapinska, H, Siwek, W, Szczepanowski, R.H, Bujnicki, J.M, Bochtler, M, Skowronek, K. | 登録日 | 2019-02-01 | 公開日 | 2019-05-01 | 最終更新日 | 2024-05-15 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) | 主引用文献 | Crystal Structure and Directed Evolution of Specificity of NlaIV Restriction Endonuclease. J.Mol.Biol., 431, 2019
|
|
3IMB
| Alternative binding mode of restriction endonuclease BcnI to cognate DNA | 分子名称: | 5'-D(*CP*GP*CP*CP*CP*GP*GP*AP*C)-3', 5'-D(*GP*TP*CP*CP*GP*GP*GP*CP*G)-3', R.BcnI | 著者 | Sokolowska, M, Kaus-Drobek, M, Czapinska, H, Tamulaitis, G, Szczepanowski, R.H, Siksnys, V, Bochtler, M. | 登録日 | 2009-08-10 | 公開日 | 2010-08-11 | 最終更新日 | 2023-11-01 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.89 Å) | 主引用文献 | How BcnI and MvaI distinguish W from S To be Published
|
|
2V31
| Structure of First Catalytic Cysteine Half-domain of mouse ubiquitin- activating enzyme | 分子名称: | UBIQUITIN-ACTIVATING ENZYME E1 X | 著者 | Jaremko, L, Jaremko, M, Wojciechowski, W, Filipek, R, Szczepanowski, R.H, Bochtler, M, Zhukov, I. | 登録日 | 2007-06-11 | 公開日 | 2008-06-24 | 最終更新日 | 2024-05-15 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Structure of First Catalytic Cysteine Half-Domain of Mouse Ubiquitin-Activating Enzyme To be Published
|
|
5NYW
| Anbu (ancestral beta-subunit) from Yersinia bercovieri | 分子名称: | 1,2-ETHANEDIOL, AZIDE ION, CHLORIDE ION, ... | 著者 | Piasecka, A, Czapinska, H, Vielberg, M, Szczepanowski, R.H, Reed, S, Groll, M, Bochtler, M. | 登録日 | 2017-05-12 | 公開日 | 2017-05-24 | 最終更新日 | 2024-01-31 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.501 Å) | 主引用文献 | The Y. bercovieri Anbu crystal structure sheds light on the evolution of highly (pseudo)symmetric multimers. J. Mol. Biol., 430, 2018
|
|
4OL8
| Ty3 reverse transcriptase bound to DNA/RNA | 分子名称: | 5'-D(*CP*AP*TP*CP*TP*TP*CP*CP*TP*CP*TP*CP*TP*CP*TP*C)-3', 5'-R(*CP*UP*GP*AP*GP*AP*GP*AP*GP*AP*GP*GP*AP*AP*GP*AP*UP*G)-3', Reverse transcriptase/ribonuclease H, ... | 著者 | Nowak, E, Miller, J.T, Bona, M.K, Studnicka, J, Szczepanowski, R.H, Jurkowski, J, Le Grice, S.F.J, Nowotny, M. | 登録日 | 2014-01-23 | 公開日 | 2014-03-05 | 最終更新日 | 2014-04-16 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) | 主引用文献 | Ty3 reverse transcriptase complexed with an RNA-DNA hybrid shows structural and functional asymmetry. Nat.Struct.Mol.Biol., 21, 2014
|
|
2GB7
| Metal-depleted Ecl18kI in complex with uncleaved, modified DNA | 分子名称: | DNA STRAND 1, DNA STRAND 2, R.Ecl18kI | 著者 | Bochtler, M, Szczepanowski, R.H, Tamulaitis, G, Grazulis, S, Czapinska, H, Manakova, E, Siksnys, V. | 登録日 | 2006-03-10 | 公開日 | 2006-06-20 | 最終更新日 | 2024-02-14 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) | 主引用文献 | Nucleotide flips determine the specificity of the Ecl18kI restriction endonuclease Embo J., 25, 2006
|
|
2FQZ
| Metal-depleted Ecl18kI in complex with uncleaved DNA | 分子名称: | DNA STRAND 1, DNA STRAND 2, R.Ecl18kI | 著者 | Bochtler, M, Szczepanowski, R.H, Tamulaitis, G, Grazulis, S, Czapinska, H, Manakova, E, Siksnys, V. | 登録日 | 2006-01-18 | 公開日 | 2006-06-20 | 最終更新日 | 2024-02-14 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2 Å) | 主引用文献 | Nucleotide flips determine the specificity of the Ecl18kI restriction endonuclease Embo J., 25, 2006
|
|
4XLG
| C. glabrata Slx1 in complex with Slx4CCD. | 分子名称: | CHLORIDE ION, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, ... | 著者 | Gaur, V, Wyatt, H.D.M, Komorowska, W, Szczepanowski, R.H, de Sanctis, D, Gorecka, K.M, West, S.C, Nowotny, M. | 登録日 | 2015-01-13 | 公開日 | 2015-03-25 | 最終更新日 | 2024-01-10 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.78 Å) | 主引用文献 | Structural and Mechanistic Analysis of the Slx1-Slx4 Endonuclease. Cell Rep, 10, 2015
|
|
4XM5
| C. glabrata Slx1. | 分子名称: | CHLORIDE ION, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, ZINC ION | 著者 | Gaur, V, Wyatt, H.D.M, Komorowska, W, Szczepanowski, R.H, de Sanctis, D, Gorecka, K.M, West, S.C, Nowotny, M. | 登録日 | 2015-01-14 | 公開日 | 2015-03-25 | 最終更新日 | 2024-05-08 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.34 Å) | 主引用文献 | Structural and Mechanistic Analysis of the Slx1-Slx4 Endonuclease. Cell Rep, 10, 2015
|
|
2OA9
| Restriction endonuclease MvaI in the absence of DNA | 分子名称: | ACETATE ION, CADMIUM ION, CHLORIDE ION, ... | 著者 | Kaus-Drobek, M, Czapinska, H, Sokolowska, M, Tamulaitis, G, Szczepanowski, R.H, Urbanke, K, Siksnys, V, Bochtler, M. | 登録日 | 2006-12-15 | 公開日 | 2007-02-20 | 最終更新日 | 2023-12-27 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.5 Å) | 主引用文献 | Restriction endonuclease MvaI is a monomer that recognizes its target sequence asymmetrically. Nucleic Acids Res., 35, 2007
|
|
2OAA
| Restriction endonuclease MvaI-cognate DNA substrate complex | 分子名称: | 5'-D(*CP*AP*TP*CP*CP*AP*GP*GP*TP*AP*C)-3', 5'-D(*GP*GP*TP*AP*CP*CP*TP*GP*GP*AP*T)-3', CALCIUM ION, ... | 著者 | Kaus-Drobek, M, Czapinska, H, Sokolowska, M, Tamulaitis, G, Szczepanowski, R.H, Urbanke, K, Siksnys, V, Bochtler, M. | 登録日 | 2006-12-15 | 公開日 | 2007-02-20 | 最終更新日 | 2023-08-30 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.5 Å) | 主引用文献 | Restriction endonuclease MvaI is a monomer that recognizes its target sequence asymmetrically. Nucleic Acids Res., 35, 2007
|
|
2ODH
| Restriction Endonuclease BCNI in the Absence of DNA | 分子名称: | ACETATE ION, DI(HYDROXYETHYL)ETHER, R.BcnI | 著者 | Sokolowska, M, Kaus-Drobek, M, Czapinska, H, Tamulaitis, G, Szczepanowski, R.H, Urbanke, K, Siksnys, V, Bochtler, M. | 登録日 | 2006-12-22 | 公開日 | 2007-03-20 | 最終更新日 | 2023-12-27 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) | 主引用文献 | Monomeric restriction endonuclease BcnI in the apo form and in an asymmetric complex with target DNA. J.Mol.Biol., 369, 2007
|
|
2ODI
| Restriction Endonuclease BCNI-Cognate DNA Substrate Complex | 分子名称: | 5'-D(*AP*AP*CP*CP*CP*GP*GP*AP*GP*AP*C)-3', 5'-D(*CP*TP*CP*CP*GP*GP*GP*TP*TP*GP*T)-3', CALCIUM ION, ... | 著者 | Sokolowska, M, Kaus-Drobek, M, Czapinska, H, Tamulaitis, G, Szczepanowski, R.H, Urbanke, C, Siksnys, V, Bochtler, M. | 登録日 | 2006-12-22 | 公開日 | 2007-03-20 | 最終更新日 | 2023-12-27 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.45 Å) | 主引用文献 | Monomeric restriction endonuclease BcnI in the apo form and in an asymmetric complex with target DNA. J.Mol.Biol., 369, 2007
|
|
2Q10
| RESTRICTION ENDONUCLEASE BcnI (WILD TYPE)-COGNATE DNA SUBSTRATE COMPLEX | 分子名称: | CALCIUM ION, CHLORIDE ION, DNA (5'-D(*AP*AP*CP*CP*CP*GP*GP*AP*GP*AP*C)-3'), ... | 著者 | Sokolowska, M, Kaus-Drobek, M, Czapinska, H, Tamulaitis, G, Szczepanowski, R.H, Urbanke, C, Siksnys, V, Bochtler, M. | 登録日 | 2007-05-23 | 公開日 | 2007-06-05 | 最終更新日 | 2023-08-30 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) | 主引用文献 | Monomeric Restriction Endonuclease BcnI in the Apo Form and in an Asymmetric Complex with Target DNA. J.Mol.Biol., 369, 2007
|
|
1X9Y
| The prostaphopain B structure | 分子名称: | cysteine proteinase | 著者 | Filipek, R, Szczepanowski, R, Sabat, A, Potempa, J, Bochtler, M. | 登録日 | 2004-08-24 | 公開日 | 2004-11-23 | 最終更新日 | 2023-08-23 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) | 主引用文献 | Prostaphopain B structure: a comparison of proregion-mediated and staphostatin-mediated protease inhibition. Biochemistry, 43, 2004
|
|
2LZJ
| Refined solution structure and dynamics of First Catalytic Cysteine Half-domain from mouse E1 enzyme | 分子名称: | Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 | 著者 | Jaremko, M, Jaremko, L, Nowakowski, M, Szczepanowski, R.H, Filipek, R, Wojciechowski, M, Bochtler, M, Ejchart, A. | 登録日 | 2012-10-03 | 公開日 | 2013-09-18 | 最終更新日 | 2024-05-15 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | NMR structural studies of the first catalytic half-domain of ubiquitin activating enzyme. J.Struct.Biol., 185, 2014
|
|
1YR3
| Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase II, the product of the xapA gene | 分子名称: | SULFATE ION, XANTHINE, Xanthosine phosphorylase | 著者 | Dandanell, G, Szczepanowski, R.H, Kierdaszuk, B, Shugar, D, Bochtler, M. | 登録日 | 2005-02-03 | 公開日 | 2005-04-19 | 最終更新日 | 2023-08-23 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3.2 Å) | 主引用文献 | Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase II, the product of the xapA gene J.Mol.Biol., 348, 2005
|
|
1YQU
| Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase II, the product of the xapA gene | 分子名称: | GUANINE, PHOSPHATE ION, Xanthosine phosphorylase | 著者 | Dandanell, G, Szczepanowski, R.H, Kierdaszuk, B, Shugar, D, Bochtler, M. | 登録日 | 2005-02-02 | 公開日 | 2005-04-19 | 最終更新日 | 2023-08-23 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) | 主引用文献 | Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase II, the product of the xapA gene J.Mol.Biol., 348, 2005
|
|
1YQQ
| Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase II, the product of the xapA gene | 分子名称: | GUANINE, PHOSPHATE ION, Xanthosine phosphorylase | 著者 | Dandanell, G, Szczepanowski, R.H, Kierdaszuk, B, Shugar, D, Bochtler, M. | 登録日 | 2005-02-02 | 公開日 | 2005-04-19 | 最終更新日 | 2024-04-03 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) | 主引用文献 | Escherichia coli Purine Nucleoside Phosphorylase II, the Product of the xapA Gene J.Mol.Biol., 348, 2005
|
|