3WBA
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3WBE
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4J9P
| Human DNA polymerase eta-DNA postinsertion binary complex with TA base pair | 分子名称: | DNA (5'-D(*C*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*A)-3'), DNA polymerase eta, ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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4J9L
| Human DNA polymerase eta-DNA ternary complex: misincorporation G opposite T after a C at the primer 3' end (CA/G) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA, DNA polymerase eta, ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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4J9O
| Human DNA polymerase eta-DNA ternary complex: primer extension after a T:G mispair | 分子名称: | 1,2-ETHANEDIOL, 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*T*AP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*G)-3'), ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.597 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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4J9Q
| Human DNA polymerase eta-DNA postinsertion binary complex with TG mispair | 分子名称: | DNA (5'-D(*TP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*G)-3'), DNA (5'-D(*TP*C*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta, ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.96 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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4J9K
| Human DNA polymerase eta-DNA ternary complex: misincorporation G opposite T after a T at the primer 3' end (TA/G) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA, DNA polymerase eta, ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.03 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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4J9M
| Human DNA polymerase eta-DNA ternary complex: misincorporation G opposite T after an A at the primer 3' end (AA/G) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA, DNA polymerase eta, ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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4J9N
| Human DNA polymerase eta-DNA ternary complex: misincorporation G opposite T after a G at the primer 3' end (GA/G) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA, DNA polymerase eta, ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.956 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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6MO0
| Structure of dengue virus protease with an allosteric Inhibitor that blocks replication | 分子名称: | 1-(4-{3-[4-(furan-3-yl)phenyl]-5-[(piperidin-4-yl)methoxy]pyrazin-2-yl}phenyl)methanamine, FLAVIVIRUS_NS2B/Peptidase S7 | 著者 | Lin, Y.-L, Nie, S, Hua, Y, Wu, J, Wu, F, Huo, T, Yao, Y, Song, Y. | 登録日 | 2018-10-03 | 公開日 | 2019-05-22 | 最終更新日 | 2023-10-11 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) | 主引用文献 | Discovery, X-ray Crystallography and Antiviral Activity of Allosteric Inhibitors of Flavivirus NS2B-NS3 Protease. J. Am. Chem. Soc., 141, 2019
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4DL2
| Human DNA polymerase eta inserting dCMPNPP opposite CG template (GG0a) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*CP*GP*GP*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), ... | 著者 | Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2012-02-05 | 公開日 | 2012-05-09 | 最終更新日 | 2023-09-13 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.15 Å) | 主引用文献 | Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
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4DL6
| Human DNA polymerase eta extending primer immediately after cisplatin crosslink (Pt-GG3). | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, Cisplatin, DNA (5'-D(*TP*AP*GP*TP*GP*TP*GP*CP*C)-3'), ... | 著者 | Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2012-02-05 | 公開日 | 2012-05-09 | 最終更新日 | 2023-09-13 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) | 主引用文献 | Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
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4DL3
| Human DNA polymerase eta inserting dCMPNPP opposite GG template (GG0b). | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*TP*AP*CP*GP*GP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*C)-3'), ... | 著者 | Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2012-02-05 | 公開日 | 2012-05-09 | 最終更新日 | 2023-09-13 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) | 主引用文献 | Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
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6MO1
| Structure of dengue virus protease with an allosteric Inhibitor that blocks replication | 分子名称: | 5-[4-(aminomethyl)phenyl]-6-[4-(furan-3-yl)phenyl]-N-[(piperidin-4-yl)methyl]pyrazin-2-amine, FLAVIVIRUS_NS2B/Peptidase S7 | 著者 | Lin, Y.-L, Hua, Y, Nie, S, Wu, J, Wu, F, Huo, T, Yao, Y, Song, Y. | 登録日 | 2018-10-03 | 公開日 | 2019-05-15 | 最終更新日 | 2023-10-11 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3 Å) | 主引用文献 | Discovery, X-ray Crystallography and Antiviral Activity of Allosteric Inhibitors of Flavivirus NS2B-NS3 Protease. J.Am.Chem.Soc., 141, 2019
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6MO2
| Structure of dengue virus protease with an allosteric Inhibitor that blocks replication | 分子名称: | 1-(4-{5-[(piperidin-4-yl)methoxy]-3-[4-(1H-pyrazol-4-yl)phenyl]pyrazin-2-yl}phenyl)methanamine, FLAVIVIRUS_NS2B/Peptidase S7 | 著者 | Lin, Y.-L, Nie, S, Hua, Y, Wu, J, Wu, F, Huo, T, Yao, Y, Song, Y. | 登録日 | 2018-10-03 | 公開日 | 2019-05-15 | 最終更新日 | 2023-10-11 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) | 主引用文献 | Discovery, X-ray Crystallography and Antiviral Activity of Allosteric Inhibitors of Flavivirus NS2B-NS3 Protease. J.Am.Chem.Soc., 141, 2019
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4DL5
| Human DNA polymerase eta inserting dCMPNPP opposite the 5'G of cisplatin crosslinked Gs (Pt-GG2). | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, Cisplatin, DNA (5'-D(*TP*AP*CP*GP*GP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), ... | 著者 | Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hanaoka, F, Hua, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-02-05 | 公開日 | 2012-05-09 | 最終更新日 | 2023-09-13 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.92 Å) | 主引用文献 | Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
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4DL7
| Human DNA polymerase eta fails to extend primer 2 nucleotide after cisplatin crosslink (Pt-GG4). | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, Cisplatin, DNA (5'-D(*TP*AP*CP*TP*CP*GP*GP*TP*CP*AP*CP*T)-3'), ... | 著者 | Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2012-02-05 | 公開日 | 2012-05-09 | 最終更新日 | 2023-09-13 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.97 Å) | 主引用文献 | Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
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6LRD
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4XWW
| Crystal structure of RNase J complexed with RNA | 分子名称: | DR2417, GLYCEROL, MANGANESE (II) ION, ... | 著者 | Lu, M, Zhang, H, Xu, Q, Hua, Y, Zhao, Y. | 登録日 | 2015-01-29 | 公開日 | 2015-12-16 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) | 主引用文献 | Structural insights into catalysis and dimerization enhanced exonuclease activity of RNase J Nucleic Acids Res., 43, 2015
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5F56
| Structure of RecJ complexed with DNA and SSB-ct | 分子名称: | ALA-ASP-LEU-PRO-PHE, DNA (5'-D(*CP*TP*GP*AP*TP*GP*GP*CP*A)-3'), MANGANESE (II) ION, ... | 著者 | Zhao, Y, Hua, Y, Cheng, K. | 登録日 | 2015-12-04 | 公開日 | 2016-06-15 | 最終更新日 | 2023-11-08 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) | 主引用文献 | Structural basis for DNA 5 -end resection by RecJ Elife, 5, 2016
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4XWT
| Crystal structure of RNase J complexed with UMP | 分子名称: | DR2417, GLYCEROL, MANGANESE (II) ION, ... | 著者 | Lu, M, Zhang, H, Xu, Q, Hua, Y, Zhao, Y. | 登録日 | 2015-01-29 | 公開日 | 2015-12-16 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.003 Å) | 主引用文献 | Structural insights into catalysis and dimerization enhanced exonuclease activity of RNase J Nucleic Acids Res., 43, 2015
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6JQ1
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5H7F
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4J9R
| Human DNA polymerase eta-DNA translocated binary complex with TG mispair | 分子名称: | DNA (5'-D(*T*AP*CP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*T)-3'), DNA (5'-D(P*TP*AP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*G)-3'), DNA polymerase eta, ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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4J9S
| Human DNA polymerase eta-DNA translocated binary complex: with TA base pair | 分子名称: | DNA (5'-D(*T*AP*TP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*A)-3'), DNA polymerase eta, ... | 著者 | Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. | 登録日 | 2013-02-16 | 公開日 | 2013-05-01 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) | 主引用文献 | Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
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