日本で解析された最初のCOVID-19関連エントリーが公開されました

PDBデータが医薬品開発を加速することは広く知られており，現在猛威をふるう新型コロナウイルス感染症（COVID-19）に対しても， 世界中で積極的な研究が進められています。

PDBは地域分担で運営されているので，アジア発の蛋白質構造は全て大阪大学にあるPDBjで編集された後に世界共通のPDBアーカイブへ登録されます。 COVID-19に関連する最初の構造は，中国・上海科技大学のRao Zihe氏とYang Haitao氏が率いる共同グループが解析したメインプロテアーゼの構造でした（PDB ID: 6lu7）。 その後，沢山のCOVID-19関連構造が決定されてきましたが，この度，日本で最初のCOVID-19関連構造が大阪大学蛋白質研究所の高木淳一教授のグループからデータ登録され，論文発表を待たずに公開されました（右図，PDB ID: 7dmu）。

新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）がヒトに感染するとき，スパイク蛋白質と呼ばれる表面に突き出た突起部分がACE2と呼ばれる受容体を認識します 。 高木教授のグループが着目したのはスパイク蛋白質の受容体結合部位（RBD: receptor binding domain）で，グループで開発したRBD親和性の向上したACE2受容体改変体（オレンジ色）が，スパイク蛋白質のRBD（緑色）に結合した構造を決定しました。SARS-CoV-2のヒトへの感染をブロックする中和抗体に代わるアプローチとして注目されます。