8J3R

Cryo-EM structure of the AsCas12f-HKRA-sgRNAS3-5v7-target DNA

8J3R の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb8j3r/pdb
• EMDBエントリー: 35965
• 分子名称: Transposase IS605 OrfB C-terminal domain-containing protein, DNA (37-MER), DNA (38-MER), ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: crispr-cas, rna binding protein-dna complex, rna binding protein-dna-rna complex, rna binding protein/dna/rna
• 由来する生物種: Sulfoacidibacillus thermotolerans; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 5
• 化学式量合計: 161469.33

構造登録者

Hino, T.,Omura, N.S.,Nakagawa, R.,Togashi, T.,Takeda, N.S.,Hiramoto, T.,Tasaka, S.,Hirano, H.,Tokuyama, T.,Uosaki, H.,Ishiguro, H.,Yamano, H.,Ozaki, Y.,Motooka, D.,Mori, H.,Kirita, Y.,Kise, Y.,Itoh, Y.,Matoba, S.,Aburatani, H.,Yachie, N.,Siksnys, V.,Ohmori, T.,Hoshino, A.,Nureki, O. (登録日: 2023-04-18, 公開日: 2023-09-27, 最終更新日: 2024-10-09)

• 主引用文献: Hino, T.,Omura, S.N.,Nakagawa, R.,Togashi, T.,Takeda, S.N.,Hiramoto, T.,Tasaka, S.,Hirano, H.,Tokuyama, T.,Uosaki, H.,Ishiguro, S.,Kagieva, M.,Yamano, H.,Ozaki, Y.,Motooka, D.,Mori, H.,Kirita, Y.,Kise, Y.,Itoh, Y.,Matoba, S.,Aburatani, H.,Yachie, N.,Karvelis, T.,Siksnys, V.,Ohmori, T.,Hoshino, A.,Nureki, O.; An AsCas12f-based compact genome-editing tool derived by deep mutational scanning and structural analysis.; Cell, 186:4920-4935.e23, 2023; PubMed: 37776859; DOI: 10.1016/j.cell.2023.08.031

実験手法

ELECTRON MICROSCOPY (2.95 Å)