7XI9

Cryo-EM structure of human DNMT1 (aa:351-1616) in complex with ubiquitinated H3 and hemimethylated DNA analog (CXXC-ordered form)

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7XI9 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb7xi9/pdb
• EMDBエントリー: 33200
• 分子名称: DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, DNA (5'-D(*AP*CP*TP*TP*AP*(5CM)P*GP*GP*AP*AP*GP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*CP*TP*TP*CP*(C55)P*GP*TP*AP*AP*GP*T)-3'), ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: dna methyltransferase, transferase-dna complex, transferase/dna
• 由来する生物種: Homo sapiens (human); 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 3
• 化学式量合計: 151156.98

構造登録者

Onoda, H.,Kikuchi, A.,Kori, S.,Yoshimi, S.,Yamagata, A.,Arita, K. (登録日: 2022-04-12, 公開日: 2022-11-30, 最終更新日: 2024-07-03)

• 主引用文献: Kikuchi, A.,Onoda, H.,Yamaguchi, K.,Kori, S.,Matsuzawa, S.,Chiba, Y.,Tanimoto, S.,Yoshimi, S.,Sato, H.,Yamagata, A.,Shirouzu, M.,Adachi, N.,Sharif, J.,Koseki, H.,Nishiyama, A.,Nakanishi, M.,Defossez, P.A.,Arita, K.; Structural basis for activation of DNMT1.; Nat Commun, 13:7130-7130, 2022; PubMed: 36414620; DOI: 10.1038/s41467-022-34779-4

実験手法

ELECTRON MICROSCOPY (2.52 Å)