6KSF

Crystal Structure of ALKBH1 bound to 21-mer DNA bulge

6KSF の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb6ksf/pdb
• 分子名称: Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 1, DNA (5'-D(*DGP*DCP*DTP*DGP*DAP*DGP*DTP*DGP*DCP*DCP*DCP*DGP*DCP*DGP*DTP*DGP*DCP*DTP*DGP*DGP*DAP*DTP*DCP*DC)-3'), DNA (5'-D(*DGP*DGP*DAP*DTP*DCP*DCP*DAP*DGP*DCP*DAP*DCP*DGP*DCP*DCP*DAP*DCP*DTP*DCP*DAP*DGP*DC)-3'), ... (7 entities in total)
• 機能のキーワード: dna methylation, complex, demethylase, gene regulation
• 由来する生物種: Mus musculus (house mouse); 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 3
• 化学式量合計: 52109.35

構造登録者

Li, H.,Zhang, M. (登録日: 2019-08-23, 公開日: 2020-04-08, 最終更新日: 2023-11-22)

• 主引用文献: Zhang, M.,Yang, S.,Nelakanti, R.,Zhao, W.,Liu, G.,Li, Z.,Liu, X.,Wu, T.,Xiao, A.,Li, H.; Mammalian ALKBH1 serves as an N6-mA demethylase of unpairing DNA.; Cell Res., 30:197-210, 2020; PubMed: 32051560; DOI: 10.1038/s41422-019-0237-5

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å)