6B09

Crystal structure of HsNUDT16 in complex with diADPR (soaked)

6B09 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb6b09/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5VY2 5W6X 5W6Z 5WJI
• 分子名称: U8 snoRNA-decapping enzyme, [(2~{R},3~{S},4~{S},5~{S})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S})-5-[[[[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{S})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxymethyl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate, MAGNESIUM ION, ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: nudix hydrolase, decapping enzyme, demodification of parylation, hydrolase
• 由来する生物種: Homo sapiens (Human)
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 44776.51

構造登録者

Thirawatananond, P.,Gabelli, S.B. (登録日: 2017-09-14, 公開日: 2019-01-09, 最終更新日: 2024-03-13)

• 主引用文献: Thirawatananond, P.,McPherson, R.L.,Malhi, J.,Nathan, S.,Lambrecht, M.J.,Brichacek, M.,Hergenrother, P.J.,Leung, A.K.L.,Gabelli, S.B.; Structural analyses of NudT16-ADP-ribose complexes direct rational design of mutants with improved processing of poly(ADP-ribosyl)ated proteins.; Sci Rep, 9:5940-5940, 2019; PubMed: 30976021; DOI: 10.1038/s41598-019-39491-w

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (3.2 Å)