5ZNR

Crystal structure of PtSHL in complex with an H3K27me3 peptide

5ZNR の概要

分子名称SHORT LIFE family protein, 17-mer peptide from Histone H3.2, ZINC ION, ... (4 entities in total)
機能のキーワードbah, phd, shl, plant, h3k27me3, epigenetics, gene regulation
由来する生物種Populus trichocarpa (Western balsam poplar)
詳細
ポリマー鎖数4
分子量合計54252.27
構造登録者
Lv, X.,Du, J. (登録日: 2018-04-10, 公開日: 2018-07-18)
主引用文献
Qian, S.,Lv, X.,Scheid, R.N.,Lu, L.,Yang, Z.,Chen, W.,Liu, R.,Boersma, M.D.,Denu, J.M.,Zhong, X.,Du, J.
Dual recognition of H3K4me3 and H3K27me3 by a plant histone reader SHL.
Nat Commun, 9:2425-2425, 2018
PubMed: 29930355 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1038/s41467-018-04836-y
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (3.202 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.232130.8%6.5%2.3%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 5znr
回転なし
Molmil generated image of 5znr
x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

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回転なし
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x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (5znr.pdb1.gz [69.76 KB])
生物学的単位の座標ファイル (5znr.pdb2.gz [68.76 KB])
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