5YTZ

Crystal structure of echinomycin-d(ACGTCGT)2 complex

5YTZ の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5ytz/pdb
• 関連するBIRD辞書のPRD_ID: PRD_000491
• 分子名称: DNA (5'-D(P*AP*CP*GP*TP*CP*GP*(UD))-3'), Echinomycin, MANGANESE (II) ION, ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: echinomycin, dna intercalator, antibiotic, echinomycin-dna complex, mismatched base pairs, t-t mismatch, pyrimidine-pyrimidine base pairing, dna mismatch repair (mmr), non-canonical duplex structure, antibiotic-dna complex, antibiotic/dna
• 由来する生物種: Streptomyces echinatus; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 4
• 化学式量合計: 6820.17

構造登録者

Hou, M.H.,Wu, P.C.,Kao, Y.F. (登録日: 2017-11-20, 公開日: 2018-05-23, 最終更新日: 2023-11-22)

• 主引用文献: Wu, P.C.,Tzeng, S.L.,Chang, C.K.,Kao, Y.F.,Waring, M.J.,Hou, M.H.; Cooperative recognition of T:T mismatch by echinomycin causes structural distortions in DNA duplex; Nucleic Acids Res., 46:7396-7404, 2018; PubMed: 29741655; DOI: 10.1093/nar/gky345

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.55 Å)