5XQ2

Crystal structure of T. thermophilus Argonaute protein complexed with a bulge 5A6 on the guide strand

5XQ2 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5xq2/pdb
• 分子名称: TtAgo (D546N), DNA (5'-D(P*TP*GP*AP*AP*GP*AP*TP*AP*GP*TP*AP*GP*GP*TP*TP*GP*T)-3'), DNA (5'-D(*AP*CP*AP*AP*CP*CP*TP*AP*CP*TP*AP*CP*CP*TP*CP*G)-3'), ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: argonaute, mirna, bulge, mismatch, dna binding protein
• 由来する生物種: Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039); 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 8
• 化学式量合計: 180527.80

構造登録者

Sheng, G.,Gogakos, T.,Wang, J.,Zhao, H.,Serganov, A.,Juranek, S.,Tuschl, T.,Patel, D.,Wang, Y. (登録日: 2017-06-06, 公開日: 2017-10-04, 最終更新日: 2023-11-22)

• 主引用文献: Sheng, G.,Gogakos, T.,Wang, J.,Zhao, H.,Serganov, A.,Juranek, S.,Tuschl, T.,Patel, D.J.,Wang, Y.; Structure/cleavage-based insights into helical perturbations at bulge sites within T. thermophilus Argonaute silencing complexes; Nucleic Acids Res., 45:9149-9163, 2017; PubMed: 28911094; DOI: 10.1093/nar/gkx547

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (3.33 Å)