5V3F

Co-crystal structure of the fluorogenic RNA Mango

5V3F の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5v3f/pdb
• 分子名称: RNA (31-MER), POTASSIUM ION, 4-{[(2S)-3-{2,16-dioxo-20-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-6,9,12-trioxa-3,15-diazaicosan-1-yl}-2,3-dihydro-1,3-benzothiazol-2-yl]methyl}-1-methylquinolin-1-ium, ... (5 entities in total)
• 機能のキーワード: quadruplex fluorescent rna, rna
• 由来する生物種: synthetic construct
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 22428.93

構造登録者

Trachman, R.J.,Ferre-D'Amare, A.R. (登録日: 2017-03-07, 公開日: 2017-05-24, 最終更新日: 2024-03-06)

• 主引用文献: Trachman, R.J.,Demeshkina, N.A.,Lau, M.W.L.,Panchapakesan, S.S.S.,Jeng, S.C.Y.,Unrau, P.J.,Ferre-D'Amare, A.R.; Structural basis for high-affinity fluorophore binding and activation by RNA Mango.; Nat. Chem. Biol., 13:807-813, 2017; PubMed: 28553947; DOI: 10.1038/nchembio.2392

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å)