5JFD
Thrombin in complex with (S)-N-(2-(aminomethyl)-5-chlorobenzyl)-1-((benzylsulfonyl)-D-arginyl)pyrrolidine-2-carboxamide
5JFD の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb5jfd/pdb |
関連するPDBエントリー | 3EQ0 |
関連するBIRD辞書のPRD_ID | PRD_000667 |
分子名称 | Prothrombin, Hirudin variant-2, (2S)-N-[[2-(aminomethyl)-5-chloro-phenyl]methyl]-1-[(2R)-5-carbamimidamido-2-(phenylmethylsulfonylamino)pentanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide, ... (9 entities in total) |
機能のキーワード | coagulation, blood clotting, convertion of fibrinogen to fibrin, blood clotting inhibitor, thrombin inhibitor, preorganization, glycosylation, blood, hydrolase |
由来する生物種 | Homo sapiens (Human) 詳細 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 3 |
化学式量合計 | 36532.97 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Sandner, A.,Hufner-Wulsdorf, T.,Heine, A.,Steinmetzer, T.,Klebe, G. Strategies for Late-Stage Optimization: Profiling Thermodynamics by Preorganization and Salt Bridge Shielding. J.Med.Chem., 62:9753-9771, 2019 Cited by PubMed: 31633354DOI: 10.1021/acs.jmedchem.9b01196 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.46 Å) |
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