5CG9

NgTET1 in complex with 5mC DNA in space group P3221

5CG9 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5cg9/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5CG8
• 分子名称: Tet-like dioxygenase, DNA (5'-D(P*CP*AP*TP*GP*CP*GP*CP*TP*GP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*TP*GP*TP*CP*AP*GP*(5CM)P*GP*CP*AP*TP*GP*G)-3'), ... (8 entities in total)
• 機能のキーワード: dioxygenase, 5-methylcytosine, ngtet1, oxidoreductase-dna complex, oxidoreductase/dna
• 由来する生物種: Naegleria gruberi (Amoeba); 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 6
• 化学式量合計: 76977.57

構造登録者

Hashimoto, H.,Pais, J.E.,Dai, N.,Zhang, X.,Zheng, Y.,Cheng, X. (登録日: 2015-07-09, 公開日: 2015-09-09, 最終更新日: 2023-09-27)

• 主引用文献: Hashimoto, H.,Pais, J.E.,Dai, N.,Correa, I.R.,Zhang, X.,Zheng, Y.,Cheng, X.; Structure of Naegleria Tet-like dioxygenase (NgTet1) in complexes with a reaction intermediate 5-hydroxymethylcytosine DNA.; Nucleic Acids Res., 43:10713-10721, 2015; PubMed: 26323320; DOI: 10.1093/nar/gkv870

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.693 Å)