4YLO

E. coli Transcription Initiation Complex - 16-bp spacer and 4-nt RNA

4YLO の概要

関連するPDBエントリー4YLN 4YLP
分子名称DNA-directed RNA polymerase subunit alpha, DNA-directed RNA polymerase subunit beta, DNA-directed RNA polymerase subunit beta', ... (10 entities in total)
機能のキーワードrna polymerase, initiation complex, dna bubble, transcription-dna-rna complex, transcription/dna/rna
由来する生物種Escherichia coli
詳細
細胞内の位置Cytoplasm  P00579
ポリマー鎖数27
分子量合計1422497.16
構造登録者
Zuo, Y.,Steitz, T.A. (登録日: 2015-03-05, 公開日: 2015-04-22, 最終更新日: 2017-09-06)
主引用文献
Zuo, Y.,Steitz, T.A.
Crystal Structures of the E. coli Transcription Initiation Complexes with a Complete Bubble.
Mol.Cell, 58:534-540, 2015
PubMed: 25866247 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1016/j.molcel.2015.03.010
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (6 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliersRNA backbone0.314452.2%12.7%5.8%0.34MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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