4I9V
The atomic structure of 5-Hydroxymethyl 2'-deoxycitidine base paired with 2'-deoxyguanosine in Dickerson Drew Dodecamer
4I9V の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb4i9v/pdb |
関連するPDBエントリー | 355D |
分子名称 | DNA (5'-D(*CP*GP*CP*GP*AP*AP*TP*TP*(5HC)P*GP*CP*G)-3'), MAGNESIUM ION, SPERMINE (FULLY PROTONATED FORM), ... (4 entities in total) |
機能のキーワード | 5-hydroxymethyl 2' deoxycitidine, 5-hydroxymethyl-dc adduct, modified ddd, dodecamer of b-dna, dna |
由来する生物種 | Synthetic DNA |
タンパク質・核酸の鎖数 | 2 |
化学式量合計 | 7823.89 |
構造登録者 | Nocek, B.,Szulik, M.W.,Joachimiak, A.,Stone, M.P. (登録日: 2012-12-05, 公開日: 2013-11-20, 最終更新日: 2023-09-20) |
主引用文献 | Szulik, M.W.,Pallan, P.S.,Nocek, B.,Voehler, M.,Banerjee, S.,Brooks, S.,Joachimiak, A.,Egli, M.,Eichman, B.F.,Stone, M.P. Differential stabilities and sequence-dependent base pair opening dynamics of watson-crick base pairs with 5-hydroxymethylcytosine, 5-formylcytosine, or 5-carboxylcytosine. Biochemistry, 54:1294-1305, 2015 Cited by PubMed: 25632825DOI: 10.1021/bi501534x 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.02 Å) |
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