4GBT

Structural characterization of H-1 Parvovirus: comparison of infectious virions to replication defective particles

4GBT の概要

関連するPDBエントリー4G0R
分子名称Capsid protein VP1, SODIUM ION, CHLORIDE ION, ... (4 entities in total)
機能のキーワードbeta-barrel, icosahedral virus, virus, capsid, capsid proteins, parvovirus, capsid protein
由来する生物種H-1 parvovirus
細胞内の位置Virion  P03136
ポリマー鎖数1
分子量合計81399.67
構造登録者
Halder, S.,Nam, H.-J.,Govindasamy, L.,Vogel, M.,Dinsart, C.,Salome, N.,McKenna, R.,Agbandje-McKenna, M. (登録日: 2012-07-27, 公開日: 2013-02-27, 最終更新日: 2018-01-24)
主引用文献
Halder, S.,Nam, H.J.,Govindasamy, L.,Vogel, M.,Dinsart, C.,Salome, N.,McKenna, R.,Agbandje-McKenna, M.
Structural characterization of h-1 parvovirus: comparison of infectious virions to empty capsids.
J.Virol., 87:5128-5140, 2013
PubMed: 23449783 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1128/JVI.03416-12
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実験手法
X-RAY DIFFRACTION (3.2 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.2511201.7%0MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (4gbt.pdb1.gz [5.12 MB])