3W39
Crystal structure of HLA-B*5201 in complexed with HIV immunodominant epitope (TAFTIPSI)
3W39 の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb3w39/pdb |
分子名称 | HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain, Beta-2-microglobulin, peptid from Gag-Pol polyprotein (3 entities in total) |
機能のキーワード | class i major histocompatibility complex, mhc, membrane, immune system |
由来する生物種 | Homo sapiens (human) 詳細 |
細胞内の位置 | Membrane; Single-pass type I membrane protein: P30490 Secreted: P61769 Matrix protein p17: Virion (Potential). Capsid protein p24: Virion (Potential). Nucleocapsid protein p7: Virion (Potential). Reverse transcriptase/ribonuclease H: Virion (Potential). Integrase: Virion (Potential): P12499 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 6 |
化学式量合計 | 89731.51 |
構造登録者 | Yagita, Y.,Kuse, N.,Kuroki, K.,Gatanaga, H.,Carlson, J.M.,Chikata, T.,Brumme, Z.L.,Murakoshi, H.,Akahoshi, T.,Pfeifer, N.,Mallal, S.,John, M.,Ose, T.,Matsubara, H.,Kanda, R.,Fukunaga, Y.,Honda, K.,Kawashima, Y.,Ariumi, Y.,Oka, S.,Maenaka, K.,Takiguchi, M. (登録日: 2012-12-13, 公開日: 2013-02-13, 最終更新日: 2023-11-08) |
主引用文献 | Yagita, Y.,Kuse, N.,Kuroki, K.,Gatanaga, H.,Carlson, J.M.,Chikata, T.,Brumme, Z.L.,Murakoshi, H.,Akahoshi, T.,Pfeifer, N.,Mallal, S.,John, M.,Ose, T.,Matsubara, H.,Kanda, R.,Fukunaga, Y.,Honda, K.,Kawashima, Y.,Ariumi, Y.,Oka, S.,Maenaka, K.,Takiguchi, M. Distinct HIV-1 Escape Patterns Selected by Cytotoxic T Cells with Identical Epitope Specificity J.Virol., 87:2253-2263, 2013 Cited by PubMed: 23236061DOI: 10.1128/JVI.02572-12 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) |
構造検証レポート
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