3VYQ

Crystal structure of the methyl CpG Binding Domain of MBD4 in complex with the 5mCG/TG sequence in space group P1

3VYQ の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb3vyq/pdb
• 関連するPDBエントリー: 3VXV 3VXX 3VYB
• 分子名称: Methyl-CpG-binding domain protein 4, DNA (5'-D(*AP*CP*AP*TP*CP*(5CM)P*GP*GP*TP*GP*A)-3'), DNA (5'-D(*TP*CP*AP*CP*TP*GP*GP*AP*TP*GP*T)-3'), ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: methyl cpg binding domain, protein-dna complex, versatile base recognition, hydrolase-dna complex, hydrolase/dna
• 由来する生物種: Mus musculus (mouse)
• 細胞内の位置: Nucleus: Q9Z2D7
• タンパク質・核酸の鎖数: 4
• 化学式量合計: 23659.93

構造登録者

Otani, J.,Arita, K.,Kato, T.,Kinoshita, M.,Ariyoshi, M.,Shirakawa, M. (登録日: 2012-10-02, 公開日: 2013-01-16, 最終更新日: 2023-11-08)

• 主引用文献: Otani, J.,Arita, K.,Kato, T.,Kinoshita, M.,Kimura, H.,Suetake, I.,Tajima, S.,Ariyoshi, M.,Shirakawa, M.; Structural basis of the versatile DNA recognition ability of the methyl-CpG binding domain of methyl-CpG binding domain protein 4; J.Biol.Chem., 288:6351-6362, 2013; PubMed: 23316048; DOI: 10.1074/jbc.M112.431098

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.525 Å)