3HDF

Crystal structure of truncated endolysin R21 from phage 21

3HDF の概要

関連するPDBエントリー3HDE
分子名称Lysozyme, NITRATE ION, GLYCEROL, ... (4 entities in total)
機能のキーワードlysozyme-like, antimicrobial, bacteriolytic enzyme, glycosidase, hydrolase, late protein
由来する生物種Enterobacteria phage P21 (Bacteriophage 21)
ポリマー鎖数2
分子量合計32648.92
構造登録者
Sun, Q.,Sacchettini, J.C. (登録日: 2009-05-07, 公開日: 2009-11-03, 最終更新日: 2017-11-01)
主引用文献
Sun, Q.,Kuty, G.F.,Arockiasamy, A.,Xu, M.,Young, R.,Sacchettini, J.C.
Regulation of a muralytic enzyme by dynamic membrane topology.
Nat.Struct.Mol.Biol., 16:1192-1194, 2009
PubMed: 19881499 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1038/nsmb.1681
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å)
?

構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.227700.9%2.6%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
検証レポート(詳細版)をダウンロード

他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 3hdf
回転なし
Molmil generated image of 3hdf
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 3hdf
y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

Molmil generated image of 3hdf
回転なし
Molmil generated image of 3hdf
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 3hdf
y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (3hdf.pdb2.gz [26.67 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3hdf.pdb1.gz [26.9 KB])