3H2V

Human raver1 RRM1 domain in complex with human vinculin tail domain Vt

3H2V の概要

関連するPDBエントリー1RKE 1tr2 3H2U
分子名称Vinculin, Raver-1 (3 entities in total)
機能のキーワードfocal adhesion, actin cytoskeleton, rnp motif, rna binding, alternative splicing, cytoplasm, nucleus, phosphoprotein, rna-binding, cell adhesion
由来する生物種Homo sapiens (human)
細胞内の位置Nucleus (By similarity) Q8IY67
ポリマー鎖数8
分子量合計119004.69
構造登録者
Lee, J.H.,Rangarajan, E.S.,Yogesha, S.D.,Izard, T. (登録日: 2009-04-14, 公開日: 2009-07-28, 最終更新日: 2011-07-13)
主引用文献
Lee, J.H.,Rangarajan, E.S.,Yogesha, S.D.,Izard, T.
Raver1 interactions with vinculin and RNA suggest a feed-forward pathway in directing mRNA to focal adhesions
Structure, 17:833-842, 2009
PubMed: 19523901 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1016/j.str.2009.04.010
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å)
NMR情報
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.292331.5%22.4%2.6%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 3h2v
回転なし
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x軸(左右方向)周りに90°回転
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他の静止画像(生物学的単位)

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y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (3h2v.pdb2.gz [40.52 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3h2v.pdb3.gz [40.37 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3h2v.pdb1.gz [41.2 KB])
生物学的単位の座標ファイル (3h2v.pdb4.gz [41.63 KB])