3C5D

Crystal structure of HIV-1 subtype F DIS extended duplex RNA bound to lividomycin

3C5D の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb3c5d/pdb
• 関連するPDBエントリー: 2QEK 3C3Z 3C44
• 分子名称: 'HIV-1 subtype F genomic RNA, POTASSIUM ION, (2R,3S,4S,5S,6R)-2-((2S,3S,4R,5R,6R)-5-AMINO-2-(AMINOMETHYL)-6-((2R,3S,4R,5S)-5-((1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-DIAMINO-2-((2S,3R ,5S,6R)-3-AMINO-5-HYDROXY-6-(HYDROXYMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YLOXY)-6-HYDROXYCYCLOHEXYLOXY)-4-HYDROXY-2-(HYDROXYMET HYL)-TETRAHYDROFURAN-3-YLOXY)-4-HYDROXY-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-3-YLOXY)-6-(HYDROXYMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-3,4,5-TRIOL, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: hiv-1, rna, aminoglycoside, lividomycin, extended duplex
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 16528.65

構造登録者

Freisz, S.,Lang, K.,Micura, R.,Dumas, P.,Ennifar, E. (登録日: 2008-01-31, 公開日: 2008-05-06, 最終更新日: 2023-11-01)

• 主引用文献: Freisz, S.,Lang, K.,Micura, R.,Dumas, P.,Ennifar, E.; Binding of aminoglycoside antibiotics to the duplex form of the HIV-1 genomic RNA dimerization initiation site.; Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 47:4110-4113, 2008; PubMed: 18435520; DOI: 10.1002/anie.200800726

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å)