2V0G

LEUCYL-TRNA SYNTHETASE FROM THERMUS THERMOPHILUS COMPLEXED WITH A tRNA(leu) transcript with 5-FLUORO-1,3-DIHYDRO-1-HYDROXY-2,1- BENZOXABOROLE (AN2690) forming an adduct to the ribose of adenosine- 76 in the enzyme editing site.

2V0G の概要

関連するPDBエントリー1H3N 1OBC 1OBH 2BTE 2BYT 2V0C
分子名称AMINOACYL-TRNA SYNTHETASE, TRNALEU, LEUCINE, ... (6 entities in total)
機能のキーワードclass i aminoacyl- trna synthetase, protein biosynthesis, aminoacyl-trna synthetase, atp + l-leucine + trna (leu) gives amp + ppi l-leucyl-trna synthetase, metal-binding, nucleotide-binding zinc, ligase, editing, synthetase, atp-binding
由来する生物種THERMUS THERMOPHILUS
ポリマー鎖数4
分子量合計258287.99
構造登録者
主引用文献
Rock, F.,Mao, W.,Yaremchuk, A.,Tukalo, M.,Crepin, T.,Zhou, H.,Zhang, Y.,Hernandez, V.,Akama, T.,Baker, S.,Plattner, J.,Shapiro, L.,Martinis, S.A.,Benkovic, S.J.,Cusack, S.,Alley, M.R.K.
An Antifungal Agent Inhibits an Aminoacyl-tRNA Synthetase by Trapping tRNA in the Editing Site.
Science, 316:1759-, 2007
PubMed: 17588934 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1126/SCIENCE.1142189
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (3.5 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliersRNA backbone0.290142.3%5.3%0.8%0.37MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (2v0g.pdb2.gz [178.45 KB])
生物学的単位の座標ファイル (2v0g.pdb1.gz [179.39 KB])