2GVF

HCV NS3-4A protease domain complexed with a macrocyclic ketoamide inhibitor, SCH419021

2GVF の概要

関連するPDBエントリー1A1R 2FM2 1RGQ 2A4G 2A4R 2A4Q
分子名称polyprotein, Polyprotein, ZINC ION, ... (5 entities in total)
機能のキーワードhepatitis c, protease, ketoamide inhibitor, hydrolase
由来する生物種Hepatitis C virus
詳細
ポリマー鎖数4
分子量合計47911.88
構造登録者
主引用文献
Arasappan, A.,Njoroge, F.G.,Chen, K.X.,Venkatraman, S.,Parekh, T.N.,Gu, H.,Pichardo, J.,Butkiewicz, N.,Prongay, A.,Madison, V.,Girijavallabhan, V.
P2-P4 macrocyclic inhibitors of hepatitis C virus NS3-4A serine protease.
Bioorg.Med.Chem.Lett., 16:3960-3965, 2006
PubMed: 16730985 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1016/j.bmcl.2006.05.022
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å)
NMR情報
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.21290.8%6.3%2.9%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (2gvf.pdb2.gz [29.02 KB])
生物学的単位の座標ファイル (2gvf.pdb3.gz [62.22 KB])
生物学的単位の座標ファイル (2gvf.pdb1.gz [36.79 KB])