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6QTP

2.37A structure of gepotidacin with S.aureus DNA gyrase and uncleaved DNA

エンティティ
Entity ID鎖名説明種類鎖長化学式量分子数データベース名(アクセス番号)由来する生物種エンティティの一般名
1B, DDNA gyrase subunit B,DNA gyrase subunit Bpolymer20222605.72UniProt (P66937)
Pfam (PF01751)
Pfam (PF00986)
In PDB
Staphylococcus aureus
2A, CDNA gyrase subunit Apolymer49055537.32UniProt (Q99XG5)
Pfam (PF00521)
In PDB
Staphylococcus aureus
3E, FDNA (5'-D(*GP*AP*GP*CP*GP*TP*AP*CP*AP*GP*CP*TP*GP*TP*AP*CP*GP*CP*TP*T)-3')polymer206150.02synthetic construct
4B, DMANGANESE (II) IONnon-polymer54.92Chemie (MN)
5BSODIUM IONnon-polymer23.01Chemie (NA)
6AGLYCEROLnon-polymer92.11Chemie (GOL)
7CSULFATE IONnon-polymer96.11Chemie (SO4)
8E(3~{R})-3-[[4-(3,4-dihydro-2~{H}-pyrano[2,3-c]pyridin-6-ylmethylamino)piperidin-1-yl]methyl]-1,4,7-triazatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-6,8(12),9-triene-5,11-dionenon-polymer448.51Chemie (JHN)
9waterwater18.0602Chemie (HOH)
配列変更
B, D: 410 - 543 (UniProt: P66937)
PDB外部データベース詳細
Met 409-initiating methionine
B, D: 580 - 644 (UniProt: P66937)
PDB外部データベース詳細
Thr 578-linker
Gly 579-linker
配列ビューア
非対称単位の内容
タンパク質・
核酸鎖
鎖の数6
化学式量合計168586.0
タンパク質・
核酸・
糖鎖以外*
分子数6
化学式量合計769.5
全て*化学式量合計169355.5
*水分子は含んでいません

225158

件を2024-09-18に公開中

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