6E13
Pseudomonas putida PqqB with a non-physiological zinc at the active site binds the substrate mimic, 5-cysteinyl-3,4-dihydroxyphenylalanine (5-Cys-DOPA), non-specifically but supports the proposed function of the enzyme in pyrroloquinoline quinone biosynthesis.
エンティティ
Entity ID | 鎖名 | 説明 | 種類 | 鎖長 | 化学式量 | 分子数 | データベース名(アクセス番号) | 由来する生物種 | エンティティの一般名 |
1 | A | Coenzyme PQQ synthesis protein B | polymer | 308 | 33999.5 | 1 | UniProt (Q88QV5) Pfam (PF12706) In PDB | Pseudomonas putida (strain ATCC 47054 / DSM 6125 / NCIMB 11950 / KT2440) | Pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein B |
2 | A | ZINC ION | non-polymer | 65.4 | 2 | Chemie (ZN) | |||
3 | A | CHLORIDE ION | non-polymer | 35.5 | 1 | Chemie (CL) | |||
4 | A | 3-{[(2S)-2-amino-2-carboxyethyl]sulfanyl}-5-hydroxy-L-tyrosine | non-polymer | 316.3 | 1 | Chemie (HKS) | |||
5 | water | water | 18.0 | 31 | Chemie (HOH) |
配列変更
A: 1 - 303 (UniProt: Q88QV5)
PDB | 外部データベース | 詳細 |
---|---|---|
Met 0 | - | initiating methionine |
Ala 11 | Gly 11 | conflict |
Thr 253 | Met 253 | conflict |
Leu 304 | - | expression tag |
Glu 305 | - | expression tag |
His 306 | - | expression tag |
His 307 | - | expression tag |
配列ビューア
非対称単位の内容
タンパク質・ 核酸鎖 | 鎖の数 | 1 |
化学式量合計 | 33999.5 | |
タンパク質・ 核酸・ 糖鎖以外* | 分子数 | 4 |
化学式量合計 | 482.6 | |
全て* | 化学式量合計 | 34482.1 |