3ZVK
Crystal structure of VapBC2 from Rickettsia felis bound to a DNA fragment from their promoter
エンティティ
| Entity ID | 鎖名 | 説明 | 種類 | 鎖長 | 化学式量 | 分子数 | データベース名(アクセス番号) | 由来する生物種 | エンティティの一般名 |
| 1 | A, B, C, D (A, B, C, D) | TOXIN OF TOXIN-ANTITOXIN SYSTEM | polymer | 134 | 15318.6 | 4 | UniProt (Q4UNB2) Pfam (PF01850) | RICKETTSIA FELIS | VAPC2 |
| 2 | E, F, G, H (E, F, G, H) | ANTITOXIN OF TOXIN-ANTITOXIN SYSTEM VAPB | polymer | 78 | 9023.5 | 4 | UniProt (Q4UNB3) Pfam (PF04014) | RICKETTSIA FELIS | VAPB2 |
| 3 | I (X) | DNA | polymer | 26 | 8022.3 | 1 | RICKETTSIA FELIS | ||
| 4 | J (Y) | DNA | polymer | 26 | 7942.2 | 1 | RICKETTSIA FELIS | ||
| 5 | K, L, M, N (E, F, G, H) | 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID | non-polymer | 195.2 | 4 | Chemie (MES) | |||
| 6 | O, P, Q, R, S... (A, B, C, D, E...) | water | water | 18.0 | 356 | Chemie (HOH) |
配列変更
A, B, C, D: 1 - 134 (UniProt: Q4UNB2)
| PDB | 外部データベース | 詳細 |
|---|---|---|
| Gly 6 | Asp 6 | engineered mutation |
配列ビューア
非対称単位の内容
| タンパク質・ 核酸鎖 | 鎖の数 | 10 |
| 化学式量合計 | 113332.9 | |
| タンパク質・ 核酸・ 糖鎖以外* | 分子数 | 4 |
| 化学式量合計 | 780.9 | |
| 全て* | 化学式量合計 | 114113.8 |
