Summary Structural details Experimental details Functional details Sequence Neighbor History Downloads

6GX0

Blood group synthase AAGlyB in complex with UDP-Gal and cryoprotected with PEG 3350

Functional Information from GO Data

Chain	GOid	namespace	contents
A	0005975	biological_process	carbohydrate metabolic process
A	0016020	cellular_component	membrane
A	0016758	molecular_function	hexosyltransferase activity

Functional Information from PDB Data

site_id	AC1
Number of Residues	6
Details	binding site for residue MN A 401

Chain	Residue
A	ASP211
A	ASP213
A	GDU402
A	HOH513
A	HOH702
A	HOH767

site_id	AC2
Number of Residues	32
Details	binding site for residue GDU A 402

Chain	Residue
A	TYR126
A	TRP181
A	VAL184
A	SER185
A	ARG188
A	ASP211
A	VAL212
A	ASP213
A	GLY267
A	ALA268
A	TRP300
A	HIS301
A	ASP302
A	GLU303
A	MN401
A	HOH509
A	HOH510
A	HOH513
A	HOH541
A	HOH558
A	HOH573
A	HOH600
A	HOH621
A	HOH637
A	HOH664
A	HOH721
A	HOH745
A	HOH764
A	HOH767
A	PHE121
A	ILE123
A	LYS124

site_id	AC3
Number of Residues	6
Details	binding site for residue SO4 A 403

Chain	Residue
A	ARG110
A	ASN113
A	ARG146
A	THR166
A	GLY167
A	HOH763

site_id	AC4
Number of Residues	4
Details	binding site for residue SO4 A 404

Chain	Residue
A	ARG176
A	TYR178
A	LYS179
A	HOH502

site_id	AC5
Number of Residues	7
Details	binding site for residue SO4 A 405

Chain	Residue
A	ARG68
A	LYS308
A	ARG312
A	HOH508
A	HOH674
A	HOH860
A	HOH904

site_id	AC6
Number of Residues	14
Details	binding site for residue PEG A 406

Chain	Residue
A	ILE102
A	LYS139
A	HIS140
A	VAL143
A	HIS219
A	HOH547
A	HOH612
A	HOH620
A	HOH641
A	HOH694
A	HOH736
A	HOH776
A	HOH802
A	HOH836

site_id	AC7
Number of Residues	6
Details	binding site for residue EDO A 407

Chain	Residue
A	THR245
A	VAL299
A	TRP300
A	HOH507
A	HOH530
A	HOH536

site_id	AC8
Number of Residues	11
Details	binding site for residue EDO A 408

Chain	Residue
A	MET69
A	TYR71
A	ARG241
A	GLU260
A	GLY261
A	ASP262
A	LEU311
A	HOH501
A	HOH663
A	HOH714
A	HOH747

site_id	AC9
Number of Residues	6
Details	binding site for residue EDO A 409

Chain	Residue
A	CYS80
A	ARG81
A	LYS82
A	ASP83
A	ARG337
A	HOH554

Functional Information from SwissProt/UniProt

site_id	SWS_FT_FI1
Number of Residues	1
Details	ACT_SITE: Nucleophile => ECO:0000250\|UniProtKB:P14769

Chain	Residue	Details
A	GLU303

site_id	SWS_FT_FI2
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZI, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R7Y, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1R81, ECO:0007744\|PDB:1R82, ECO:0007744\|PDB:1WT3, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJO, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2A8W, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:2Y7A, ECO:0007744\|PDB:3I0D, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0I, ECO:0007744\|PDB:3I0K, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	PHE121

site_id	SWS_FT_FI3
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZI, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R7Y, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1R81, ECO:0007744\|PDB:1R82, ECO:0007744\|PDB:1WT1, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1WT3, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJO, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2A8W, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:2Y7A, ECO:0007744\|PDB:3I0D, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0I, ECO:0007744\|PDB:3I0K, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	TYR126

site_id	SWS_FT_FI4
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP

Chain	Residue	Details
A	ASP211
A	ASP213

site_id	SWS_FT_FI5
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	HIS233

site_id	SWS_FT_FI6
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1R7U, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZIZ, ECO:0007744\|PDB:1ZJ0, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	THR245

site_id	SWS_FT_FI7
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1R7U, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZIZ, ECO:0007744\|PDB:1ZJ0, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	GLU303

site_id	SWS_FT_FI8
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	ASP326

site_id	SWS_FT_FI9
Number of Residues	1
Details	CARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) asparagine => ECO:0000255

Chain	Residue	Details
A	ASN113

		Sequence (fasta)
		PDBx/mmCIF
		PDBML format (no-atom)
		PDB format (full)
		Validation report (PDF)
		EDMap 2fo-fc (MTZ)