Loading
PDBj
English日本語简体中文繁體中文한국어
✖
MenuPDBj@FacebookPDBj@TwitterPDBj@YouTubewwPDB FoundationwwPDB
RCSB PDBPDBeBMRBAdv. SearchSearch help
SummaryStructural detailsExperimental detailsFunctional detailsSequence NeighborHistoryDownloads

4Y64

AAGlyB in complex with amino-acid analogues

Functional Information from GO Data
ChainGOidnamespacecontents
A0000139cellular_componentGolgi membrane
A0000166molecular_functionnucleotide binding
A0003823molecular_functionantigen binding
A0004380molecular_functionglycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
A0004381molecular_functionfucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase activity
A0005576cellular_componentextracellular region
A0005794cellular_componentGolgi apparatus
A0005975biological_processcarbohydrate metabolic process
A0006486biological_processprotein glycosylation
A0016020cellular_componentmembrane
A0016740molecular_functiontransferase activity
A0016757molecular_functionglycosyltransferase activity
A0016758molecular_functionhexosyltransferase activity
A0030145molecular_functionmanganese ion binding
A0030259biological_processlipid glycosylation
A0031982cellular_componentvesicle
A0032580cellular_componentGolgi cisterna membrane
A0046872molecular_functionmetal ion binding
Functional Information from PDB Data
site_idAC1
Number of Residues12
Detailsbinding site for residue BHE A 401
ChainResidue
AHIS233
AHOH688
AHOH802
AHOH840
AGLY235
APHE236
ATHR245
ATRP300
AGLU303
AASP326
A48C402
AHOH675
site_idAC2
Number of Residues14
Detailsbinding site for residue 48C A 402
ChainResidue
APHE121
AILE123
ATYR126
AVAL184
AARG188
AASP211
AVAL212
AASP213
ABHE401
AHOH631
AHOH656
AHOH698
AHOH841
AHOH846
Functional Information from SwissProt/UniProt
site_idSWS_FT_FI1
Number of Residues31
DetailsTOPO_DOM: Cytoplasmic => ECO:0000255
ChainResidueDetails
AMET1-PHE32
site_idSWS_FT_FI2
Number of Residues20
DetailsTRANSMEM: Helical; Signal-anchor for type II membrane protein => ECO:0000255
ChainResidueDetails
AGLY33-MET53
site_idSWS_FT_FI3
Number of Residues300
DetailsTOPO_DOM: Lumenal => ECO:0000255
ChainResidueDetails
AALA54-PRO354
site_idSWS_FT_FI4
Number of Residues1
DetailsACT_SITE: Nucleophile => ECO:0000250|UniProtKB:P14769
ChainResidueDetails
AGLU303
site_idSWS_FT_FI5
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZI, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R7Y, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1R81, ECO:0007744|PDB:1R82, ECO:0007744|PDB:1WT3, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJO, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2A8W, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:2Y7A, ECO:0007744|PDB:3I0D, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0I, ECO:0007744|PDB:3I0K, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
ChainResidueDetails
APHE121
site_idSWS_FT_FI6
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZI, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R7Y, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1R81, ECO:0007744|PDB:1R82, ECO:0007744|PDB:1WT1, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1WT3, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJO, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2A8W, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:2Y7A, ECO:0007744|PDB:3I0D, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0I, ECO:0007744|PDB:3I0K, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
ChainResidueDetails
ATYR126
site_idSWS_FT_FI7
Number of Residues2
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP
ChainResidueDetails
AASP211
AASP213
site_idSWS_FT_FI8
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
ChainResidueDetails
AHIS233
site_idSWS_FT_FI9
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1R7U, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZIZ, ECO:0007744|PDB:1ZJ0, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
ChainResidueDetails
ATHR245
site_idSWS_FT_FI10
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1R7U, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZIZ, ECO:0007744|PDB:1ZJ0, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
ChainResidueDetails
AGLU303
site_idSWS_FT_FI11
Number of Residues1
DetailsBINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4
ChainResidueDetails
AASP326
site_idSWS_FT_FI12
Number of Residues1
DetailsCARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) asparagine => ECO:0000255
ChainResidueDetails
AASN113

218853

PDB entries from 2024-04-24

PDB statisticsPDBj update infoContact PDBjnumon