4V5E

Insights into translational termination from the structure of RF2 bound to the ribosome

「2JL5」から置き換えられました「2JL6」から置き換えられました「2JL7」から置き換えられました「2JL8」から置き換えられました

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鎖名	残基
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残基数	2
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鎖名	残基
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鎖名	残基
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残基数	6
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鎖名	残基
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鎖名	残基
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鎖名	残基
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残基数	2
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鎖名	残基
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残基数	5
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鎖名	残基
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鎖名	残基
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残基数	2
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鎖名	残基
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残基数	2
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鎖名	残基
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DA	C154
DA	U157

site_id	EG9
残基数	2
詳細	binding site for residue MG DA 3334

鎖名	残基
DA	U269
DA	G271

site_id	EH1
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DA 3335

鎖名	残基
DA	G271

site_id	EH2
残基数	2
詳細	binding site for residue MG DA 3336

鎖名	残基
DA	U350
DA	G351

site_id	EH3
残基数	2
詳細	binding site for residue MG DA 3338

鎖名	残基
DA	G382
DA	G386

site_id	EH4
残基数	4
詳細	binding site for residue MG DA 3340

鎖名	残基
DA	U504
DA	A505
DA	U1234
DA	G1235

site_id	EH5
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DA 3341

鎖名	残基
DA	G592

site_id	EH6
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DA 3342

鎖名	残基
DA	A590

site_id	EH7
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DA 3343

鎖名	残基
DA	G628

site_id	EH8
残基数	3
詳細	binding site for residue MG DA 3344

鎖名	残基
DA	G805
DA	G831
DP	SER40

site_id	EH9
残基数	2
詳細	binding site for residue MG DA 3345

鎖名	残基
DA	A829
DA	G830

site_id	EI1
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DA 3346

鎖名	残基
DA	U913

site_id	EI2
残基数	2
詳細	binding site for residue MG DA 3347

鎖名	残基
DA	C1646
DA	G1649

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残基数	2
詳細	binding site for residue MG DA 3348

鎖名	残基
DA	U1352
DA	C1376

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残基数	1
詳細	binding site for residue MG DA 3350

鎖名	残基
DA	U1352

site_id	EI5
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DA 3352

鎖名	残基
DA	U1679

site_id	EI6
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DA 3353

鎖名	残基
DA	C2295

site_id	EI7
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DB 201

鎖名	残基
DB	C30

site_id	EI8
残基数	2
詳細	binding site for residue MG DB 202

鎖名	残基
DB	A73
DB	G101

site_id	EI9
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DB 203

鎖名	残基
DB	G76

site_id	EJ1
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DB 204

鎖名	残基
DB	C79

site_id	EJ2
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DC 301

鎖名	残基
DC	LYS46

site_id	EJ3
残基数	3
詳細	binding site for residue MG DD 301

鎖名	残基
DA	A2598
DD	GLY235
DD	GLY243

site_id	EJ4
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DD 302

鎖名	残基
DD	ARG244

site_id	EJ5
残基数	3
詳細	binding site for residue MG DF 301

鎖名	残基
DA	G458
DA	G469
DF	ALA58

site_id	EJ6
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DF 303

鎖名	残基
DA	A614

site_id	EJ7
残基数	3
詳細	binding site for residue MG DH 201

鎖名	残基
DA	A2531
DH	ALA156
DH	TYR157

site_id	EJ8
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DQ 201

鎖名	残基
DQ	TYR26

site_id	EJ9
残基数	6
詳細	binding site for residue MG DR 201

鎖名	残基
DA	A2820
DA	A2821
DA	G2822
DE	GLY110
DR	ARG2
DR	LYS5

site_id	EK1
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DU 201

鎖名	残基
DA	G1154

site_id	EK2
残基数	4
詳細	binding site for residue MG DX 101

鎖名	残基
DA	C1398
DA	C1399
DX	LYS25
DX	GLN82

site_id	EK3
残基数	1
詳細	binding site for residue MG DY 201

鎖名	残基
DY	PRO82

UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報

site_id	PS00049
残基数	27
詳細	RIBOSOMAL_L14 Ribosomal protein L14 signature. AVVVrtkkeikrp.DGsairFddNaaVI

鎖名	残基	詳細
DO	ALA60-ILE86

site_id	PS00052
残基数	27
詳細	RIBOSOMAL_S7 Ribosomal protein S7 signature. DvLvtaFInkimrdGKKnlaarIFydA

鎖名	残基	詳細
AG	ASP20-ALA46

site_id	PS00053
残基数	18
詳細	RIBOSOMAL_S8 Ribosomal protein S8 signature. GiaILSTSkGVLtdreAR

鎖名	残基	詳細
AH	GLY108-ARG125

site_id	PS00054
残基数	23
詳細	RIBOSOMAL_S11 Ribosomal protein S11 signature. IrALqaS.GLqVksivDdTPvPHN

鎖名	残基	詳細
AK	ILE95-ASN117

site_id	PS00055
残基数	8
詳細	RIBOSOMAL_S12 Ribosomal protein S12 signature. KkPNSAlR

鎖名	残基	詳細
AL	LYS46-ARG53

site_id	PS00056
残基数	13
詳細	RIBOSOMAL_S17 Ribosomal protein S17 signature. GDvVeIiEsRPIS

鎖名	残基	詳細
AQ	GLY54-SER66

site_id	PS00057
残基数	24
詳細	RIBOSOMAL_S18 Ribosomal protein S18 signature. RDYrn.VevLkrFLSEt.GKIlprRR

鎖名	残基	詳細
AR	ARG32-ARG55

site_id	PS00063
残基数	16
詳細	ALDOKETO_REDUCTASE_3 Aldo/keto reductase family putative active site signature. LAKTIKraRIlGLlPF

鎖名	残基	詳細
AR	LEU66-PHE81

site_id	PS00196
残基数	16
詳細	COPPER_BLUE Type-1 copper (blue) proteins signature. GrvY.VICenPkHkqr.Q

鎖名	残基	詳細
B9	GLY21-GLN36

site_id	PS00323
残基数	25
詳細	RIBOSOMAL_S19 Ribosomal protein S19 signature. NGKqhvpvyItenmVGhkLGEFapT

鎖名	残基	詳細
AS	ASN53-THR77

site_id	PS00358
残基数	17
詳細	RIBOSOMAL_L5 Ribosomal protein L5 signature. LalITGQkpAvTrAKkS

鎖名	残基	詳細
BG	LEU60-SER76

site_id	PS00359
残基数	16
詳細	RIBOSOMAL_L11 Ribosomal protein L11 signature. RmIaGSarSMGvEVvG

鎖名	残基	詳細
DK	ARG125-GLY140

site_id	PS00360
残基数	19
詳細	RIBOSOMAL_S9 Ribosomal protein S9 signature. GGGksGQidAiklGiARAL

鎖名	残基	詳細
AI	GLY67-LEU85

site_id	PS00361
残基数	16
詳細	RIBOSOMAL_S10 Ribosomal protein S10 signature. ArrsGAqvsGPIpLPT

鎖名	残基	詳細
AJ	ALA27-THR42

site_id	PS00362
残基数	31
詳細	RIBOSOMAL_S15 Ribosomal protein S15 signature. LseHLkvhKkDhhShrgLlmMvgqrrrLlrY

鎖名	残基	詳細
AO	LEU39-TYR69

site_id	PS00430
残基数	47
詳細	TONB_DEPENDENT_REC_1 TonB-dependent receptor (TBDR) proteins signature 1. mpkhgkryrallekvdpnkvytideaarlvkelatakfd............................................................................ETVEVHAK

鎖名	残基	詳細
BC	MET0-LYS46

site_id	PS00464
残基数	25
詳細	RIBOSOMAL_L22 Ribosomal protein L22 signature. KrvLpRArGRadiikkrtSHITViL

鎖名	残基	詳細
BW	LYS83-LEU107

site_id	PS00467
残基数	12
詳細	RIBOSOMAL_L2 Ribosomal protein L2 signature. PhvRGAAmNPvD

鎖名	残基	詳細
BD	PRO219-ASP230

site_id	PS00474
残基数	24
詳細	RIBOSOMAL_L3 Ribosomal protein L3 signature. FkpgervDvtGtSkGRGfaGvmkR

鎖名	残基	詳細
BE	PHE96-ARG119

site_id	PS00475
残基数	30
詳細	RIBOSOMAL_L15 Ribosomal protein L15 signature. KILGeGeAkp...LkVvahaFSksAlekLkaaG

鎖名	残基	詳細
DP	LYS113-GLY142

site_id	PS00527
残基数	23
詳細	RIBOSOMAL_S14 Ribosomal protein S14 signature. R.CvrcgrarsvyrfFGLCRiCLR

鎖名	残基	詳細
AN	ARG23-ARG45

site_id	PS00548
残基数	35
詳細	RIBOSOMAL_S3 Ribosomal protein S3 signature. ARtewaaqGrVplHt..LranIDygfalarTtyGvlG

鎖名	残基	詳細
AC	ALA163-GLY197

site_id	PS00579
残基数	15
詳細	RIBOSOMAL_L29 Ribosomal protein L29 signature. QNHKIRdLKRQIARL

鎖名	残基	詳細
B2	GLN46-LEU60

site_id	PS00582
残基数	20
詳細	RIBOSOMAL_L33 Ribosomal protein L33 signature. YaTeKNkrntPnkLElrKYC

鎖名	残基	詳細
B6	TYR21-CYS40

site_id	PS00585
残基数	33
詳細	RIBOSOMAL_S5 Ribosomal protein S5 signature. GRrfrFgAlvVVGDrq.GrVGlGfgkap.EVpl.AV

鎖名	残基	詳細
AE	GLY23-VAL55

site_id	PS00632
残基数	25
詳細	RIBOSOMAL_S4 Ribosomal protein S4 signature. LEsRLdnvVYRlgfAvSrrqARqLV

鎖名	残基	詳細
AD	LEU97-VAL121

site_id	PS00634
残基数	33
詳細	RIBOSOMAL_L30 Ribosomal protein L30 signature. ALkaLgLrRlqQeRvledtpairgNVekVahLV

鎖名	残基	詳細
B3	ALA22-VAL54

site_id	PS00646
残基数	14
詳細	RIBOSOMAL_S13_1 Ribosomal protein S13 signature. RGlRHrrGlpVRGQ

鎖名	残基	詳細
AM	ARG88-GLN101

site_id	PS00651
残基数	28
詳細	RIBOSOMAL_L9 Ribosomal protein L9 signature. GdvGqvvdVkpGYarNYLlprglAvlaT

鎖名	残基	詳細
BI	GLY13-THR40
DI	GLY13-THR40

site_id	PS00745
残基数	17
詳細	RF_PROK_I Prokaryotic-type class I peptide chain release factors signature. RAsGpGGQGVNttdSAV

鎖名	残基	詳細
CY	ARG233-VAL249

site_id	PS00783
残基数	23
詳細	RIBOSOMAL_L13 Ribosomal protein L13 signature. VKGMLPkgpl.GRrlfkrLkVYaG

鎖名	残基	詳細
DN	VAL103-GLY125

site_id	PS00784
残基数	20
詳細	RIBOSOMAL_L34 Ribosomal protein L34 signature. KRTWQpnrrkRakth.GFraR

鎖名	残基	詳細
B7	LYS2-ARG21

site_id	PS00828
残基数	26
詳細	RIBOSOMAL_L36 Ribosomal protein L36 signature. CdkCkvIrRhgrVyViCenp.KHkQrQ

鎖名	残基	詳細
B9	CYS11-GLN36

site_id	PS00831
残基数	15
詳細	RIBOSOMAL_L27 Ribosomal protein L27 signature. GnILvRQRGtrfkpG

鎖名	残基	詳細
D0	GLY34-GLY48

site_id	PS00936
残基数	27
詳細	RIBOSOMAL_L35 Ribosomal protein L35 signature. KTHkGAkKRVkitasgkvvamktgk.RH

鎖名	残基	詳細
B8	LYS5-HIS31

site_id	PS00937
残基数	17
詳細	RIBOSOMAL_L20 Ribosomal protein L20 signature. KrdfRrLWIVRINaacR

鎖名	残基	詳細
BU	LYS54-ARG70

site_id	PS00962
残基数	12
詳細	RIBOSOMAL_S2_1 Ribosomal protein S2 signature 1. VkELLEAGVHFG

鎖名	残基	詳細
AB	VAL7-GLY18

site_id	PS01015
残基数	16
詳細	RIBOSOMAL_L19 Ribosomal protein L19 signature. IvQrGRAR.RAKLYFIR

鎖名	残基	詳細
BT	ILE88-ARG103

site_id	PS01048
残基数	10
詳細	RIBOSOMAL_S6 Ribosomal protein S6 signature. GlRRLAYpIA

鎖名	残基	詳細
AF	GLY44-ALA53

site_id	PS01108
残基数	18
詳細	RIBOSOMAL_L24 Ribosomal protein L24 signature. GDtVlVAsGkyKGrv.GkV

鎖名	残基	詳細
BY	GLY10-VAL27

site_id	PS01143
残基数	22
詳細	RIBOSOMAL_L31 Ribosomal protein L31 signature. EVcskcHPFYTgqqrfvdte....GR

鎖名	残基	詳細
B4	GLU60-ARG81

site_id	PS01199
残基数	20
詳細	RIBOSOMAL_L1 Ribosomal protein L1 signature. MgaVgskLGriLGPRGlLPN

鎖名	残基	詳細
BC	MET120-ASN139

SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報

site_id	SWS_FT_FI1
残基数	2
詳細	MOD_RES: N,N,N-trimethylmethionine => ECO:0000269\|PubMed:18611379, ECO:0007744\|PDB:3EGV

鎖名	残基	詳細
BK	MET1
DK	MET1
B9	CYS27
B9	HIS32
D9	CYS11
D9	CYS14
D9	CYS27
D9	HIS32

site_id	SWS_FT_FI2
残基数	2
詳細	MOD_RES: N6,N6,N6-trimethyllysine => ECO:0000269\|PubMed:10333296

鎖名	残基	詳細
BK	LYS3
DK	LYS3

site_id	SWS_FT_FI3
残基数	2
詳細	MOD_RES: N6,N6,N6-trimethyllysine => ECO:0000269\|PubMed:18611379, ECO:0007744\|PDB:3EGV

鎖名	残基	詳細
BK	LYS39
DK	LYS39

site_id	SWS_FT_FI4
残基数	2
詳細	MOD_RES: N6,N6,N6-trimethyllysine => ECO:0000250\|UniProtKB:P0A7J7

鎖名	残基	詳細
BK	LYS70
DK	LYS70

		Sequence (fasta)
		PDBx/mmCIF
		PDBML (ヘッダのみ (no-atom))
		検証レポート (PDF)
		EDMap 2fo-fc (MTZ)