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新型コロナウイルスの構造情報

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コロナウイルス
コロナウイルス, 2020. David S. Goodsell@RCSB PDB による原画を修正

最近、新型コロナウイルス感染症(Novel Coronavirus disease 2019: COVID-19)の拡大が世界中で深刻な問題となっています。早急にこの新型ウイルス(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2: SARS-CoV-2)を理解し有効な薬を開発するため,関連するタンパク質の構造研究は既に始まっています。そして,解明された構造はPDBに登録されていっています。PDBjでは利用者の利便を図るため,新型コロナウイルス特集ページを作成しました。新たなエントリーが毎週水曜日の週次更新で公開されると、同時にこのページにも追加されます。

またこのウイルスのタンパク質に関する解説記事を以下の「今月の分子」ページに掲載しています。

「全エントリー」のタブでは,同じ著者によるグループ登録のエントリーも全て区別し,すべてのPDB IDを省略せず表示しています。 「代表構造」タブには最も分解能の高い代表構造のみを表示しており,アミノ酸配列が100%同じPDBエントリーはリガンドが異なるものも含め除外してあります。 「最新のエントリー」のタブは,今週公開された最も新しいエントリーです。


作成日: 2020-09-03 (最終更新日: more than 1 year ago)2022-09-02
8U3O
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BU of 8u3o by Molmil
SARS-CoV-2 Main Protease A173V in complex with CDD-1819
分子名称: (2P)-2-(isoquinolin-4-yl)-1-[(1s,3R)-3-(methylcarbamoyl)cyclobutyl]-N-[(1S)-1-(naphthalen-2-yl)ethyl]-1H-benzimidazole-7-carboxamide, ORF1a polyprotein
著者Nnabuife, C, Palzkill, T.
登録日2023-09-08
公開日2024-09-18
実験手法X-RAY DIFFRACTION (1.88 Å)
主引用文献SARS-CoV-2 Main Protease A173V in complex with CDD-1819
To Be Published
8ZBQ
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BU of 8zbq by Molmil
Local map of Omicron Subvariant JN.1 RBD with ACE2
分子名称: Angiotensin-converting enzyme 2, Spike protein S2'
著者Yan, R.H, Yang, H.N.
登録日2024-04-27
公開日2024-09-18
実験手法ELECTRON MICROSCOPY (3.03 Å)
主引用文献Structural basis for the evolution and antibody evasion of SARS-CoV-2 BA.2.86 and JN.1 subvariants
Nat Commun, 15, 2024
9ATO
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BU of 9ato by Molmil
XBB.1.5 spike/Nanosota-3C complex
分子名称: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, Nanosota-3C, ...
著者Ye, G, Bu, F, Liu, B, Li, F.
登録日2024-02-27
公開日2024-09-18
実験手法ELECTRON MICROSCOPY (3.2 Å)
主引用文献Structure of XBB.1.5 spike/Nanosota-3C complex
To Be Published
9ATP
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BU of 9atp by Molmil
local refinement of XBB.1.5 spike/Nanosota-3C complex
分子名称: Nanosota-3C, Spike glycoprotein
著者Ye, G, Bu, F, Liu, B, Li, F.
登録日2024-02-27
公開日2024-09-18
実験手法ELECTRON MICROSCOPY (3.5 Å)
主引用文献Structure of XBB.1.5 spike and Nanosota-3C complex
To Be Published

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件を2024-09-18に公開中

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