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Yorodumi- PDB-4zxu: 2.85 Angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde de... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4zxu | ||||||
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Title | 2.85 Angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betB) H448F/P449M double mutant from Staphylococcus aureus in complex with NAD+ and BME-free Cys289 | ||||||
Components | Betaine-aldehyde dehydrogenase | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / betaine aldehyde dehydrogenase / structural genomics / NAD / Center for Structural Genomics of Infectious / NIAID / National Institute of Allergy and Infectious Diseases / CSGID / Rossmann fold / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases | ||||||
Function / homology | Function and homology information betaine-aldehyde dehydrogenase / betaine-aldehyde dehydrogenase (NAD+) activity / glycine betaine biosynthetic process from choline / nucleotide binding / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Staphylococcus aureus (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.85 Å | ||||||
Authors | Halavaty, A.S. / Minasov, G. / Chen, C. / Joo, J.C. / Yakunin, A.F. / Anderson, W.F. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID) | ||||||
Citation | Journal: To be Published Title: 2.85 Angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betB) H448F/P449M double mutant from Staphylococcus aureus in complex with NAD+ and BME-free Cys289. Authors: Halavaty, A.S. / Minasov, G. / Chen, C. / Joo, J.C. / Yakunin, A.F. / Anderson, W.F. #1: Journal: Acta Crystallogr.,Sect.D / Year: 2015 Title: Structural and functional analysis of betaine aldehyde dehydrogenase from Staphylococcus aureus. Authors: Halavaty, A.S. / Rich, R.L. / Chen, C. / Joo, J.C. / Minasov, G. / Dubrovska, I. / Winsor, J.R. / Myszka, D.G. / Duban, M. / Shuvalova, L. / Yakunin, A.F. / Anderson, W.F. #2: Journal: Appl.Environ.Microbiol. / Year: 2014 Title: Structure-based mutational studies of substrate inhibition of betaine aldehyde dehydrogenase BetB from Staphylococcus aureus. Authors: Chen, C. / Joo, J.C. / Brown, G. / Stolnikova, E. / Halavaty, A.S. / Savchenko, A. / Anderson, W.F. / Yakunin, A.F. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 4zxu.cif.gz | 1.5 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb4zxu.ent.gz | 1.3 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 4zxu.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 4zxu_validation.pdf.gz | 2.6 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 4zxu_full_validation.pdf.gz | 2.7 MB | Display | |
Data in XML | 4zxu_validation.xml.gz | 134.8 KB | Display | |
Data in CIF | 4zxu_validation.cif.gz | 184 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zx/4zxu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zx/4zxu | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 4mpbS S: Starting model for refinement |
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Similar structure data | |
Other databases |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
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