ソフトウェア 名称 バージョン 分類 CNS0.5 精密化 DENZOデータ削減 SCALEPACKデータスケーリング CNS位相決定
精密化 構造決定の手法 : 分子置換開始モデル : 1QHN解像度 : 2.9→99 Å / Rfactor Rfree error : 0.011 / 交差検証法 : THROUGHOUT / σ(F) : 0 Rfactor 反射数 %反射 Selection details Rfree 0.297 723 5 % RANDOM Rwork 0.278 - - - obs 0.278 14463 45 % -
原子変位パラメータ Baniso -1 Baniso -2 Baniso -3 1- 0 Å2 0 Å2 0 Å2 2- - 0 Å2 0 Å2 3- - - 0 Å2
Refine analyze Luzzati coordinate error free : 0.43 Å / Luzzati sigma a free : 0.49 Å精密化ステップ サイクル : LAST / 解像度 : 2.9→99 Åタンパク質 核酸 リガンド 溶媒 全体 原子数 1320 0 23 81 1424
拘束条件 大きな表を表示 (3 x 19) 大きな表を隠す Refine-ID タイプ Dev ideal X-RAY DIFFRACTION c_bond_d0.008 X-RAY DIFFRACTION c_bond_d_naX-RAY DIFFRACTION c_bond_d_protX-RAY DIFFRACTION c_angle_dX-RAY DIFFRACTION c_angle_d_naX-RAY DIFFRACTION c_angle_d_protX-RAY DIFFRACTION c_angle_deg1.3 X-RAY DIFFRACTION c_angle_deg_naX-RAY DIFFRACTION c_angle_deg_protX-RAY DIFFRACTION c_dihedral_angle_d23.5 X-RAY DIFFRACTION c_dihedral_angle_d_naX-RAY DIFFRACTION c_dihedral_angle_d_protX-RAY DIFFRACTION c_improper_angle_d0.7 X-RAY DIFFRACTION c_improper_angle_d_naX-RAY DIFFRACTION c_improper_angle_d_protX-RAY DIFFRACTION c_mcbond_itX-RAY DIFFRACTION c_mcangle_itX-RAY DIFFRACTION c_scbond_itX-RAY DIFFRACTION c_scangle_it
LS精密化 シェル 解像度 : 2.9→3.08 Å / Rfactor Rfree error : 0.051 / Total num. of bins used : 6 Rfactor 反射数 %反射 Rfree 0.463 81 5 % Rwork 0.438 1726 - obs - - 71.5 %
Xplor file Refine-ID Serial no Param file X-RAY DIFFRACTION 1 PROTEIN_REP.PARAMX-RAY DIFFRACTION 2 WATER_REP.PARAMX-RAY DIFFRACTION 3 CLM.PARX-RAY DIFFRACTION 4 ION.PARAM
ソフトウェア *PLUS
名称 : CNS / バージョン : 0.5 / 分類 : refinement精密化 *PLUS
最高解像度 : 3.1 Å / 最低解像度 : 42 Å / Num. reflection obs : 10677 / Rfactor obs : 0.226 / Rfactor Rfree : 0.256 溶媒の処理 *PLUS
原子変位パラメータ *PLUS
拘束条件 *PLUS
Refine-ID タイプ Dev ideal X-RAY DIFFRACTION c_bond_d0.006 X-RAY DIFFRACTION c_angle_deg1.1 X-RAY DIFFRACTION c_dihedral_angle_dX-RAY DIFFRACTION c_dihedral_angle_deg23.5 X-RAY DIFFRACTION c_improper_angle_dX-RAY DIFFRACTION c_improper_angle_deg0.7
LS精密化 シェル *PLUS
Rfactor Rfree : 0.332 / Rfactor obs : 0.336