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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ezy | ||||||
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タイトル | HIGH-RESOLUTION SOLUTION STRUCTURE OF FREE RGS4 BY NMR | ||||||
要素 | REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 4 | ||||||
キーワード | SIGNALING PROTEIN INHIBITOR / 4-helix bundle / free RGS4 NMR Structure | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of glycine import across plasma membrane / negative regulation of dopamine receptor signaling pathway / negative regulation of potassium ion transmembrane transport / dorsal root ganglion development / negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development / regulation of actin filament organization / regulation of potassium ion transmembrane transport / G alpha (q) signalling events / G alpha (i) signalling events / negative regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway ...negative regulation of glycine import across plasma membrane / negative regulation of dopamine receptor signaling pathway / negative regulation of potassium ion transmembrane transport / dorsal root ganglion development / negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development / regulation of actin filament organization / regulation of potassium ion transmembrane transport / G alpha (q) signalling events / G alpha (i) signalling events / negative regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway / positive regulation of heart rate / regulation of calcium ion transport / positive regulation of excitatory postsynaptic potential / G-protein alpha-subunit binding / response to amphetamine / GTPase activator activity / response to cocaine / response to ethanol / protein kinase binding / protein-containing complex / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Rattus norvegicus (ドブネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Moy, F.J. / Chanda, P.K. / Cockett, M.I. / Edris, W. / Jones, P.G. / Mason, K. / Semus, S. / Powers, R. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2000 タイトル: NMR structure of free RGS4 reveals an induced conformational change upon binding Galpha. 著者: Moy, F.J. / Chanda, P.K. / Cockett, M.I. / Edris, W. / Jones, P.G. / Mason, K. / Semus, S. / Powers, R. #1: ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 1999 タイトル: 1H, 15N, 13C and 13CO Assignments and Secondary Structure Determination of RGS4 著者: Moy, F.J. / Chanda, P.K. / Cockett, M.I. / Edris, W. / Jones, P.G. / Powers, R. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ezy.cif.gz | 1.2 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ezy.ent.gz | 1 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ezy.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1ezy_validation.pdf.gz | 350.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1ezy_full_validation.pdf.gz | 576.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1ezy_validation.xml.gz | 80.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1ezy_validation.cif.gz | 104.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ez/1ezy ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ez/1ezy | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19145.711 Da / 分子数: 1 / 断片: CORE DOMAIN OF RGS / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: SIX RESIDUE HISTIDINE TAG AT C-TERMINUS / 由来: (組換発現) Rattus norvegicus (ドブネズミ) / 器官: BRAIN / プラスミド: PRGS4 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P49799 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX / 製造業者: Bruker / モデル: AMX / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: the structures are based on a total of 2871 restraints, 3167 are NOE-derived distance constraints, 431 dihedral angle restraints,78 distance restraints from 39 backbone hydrogen bond, 132 ...詳細: the structures are based on a total of 2871 restraints, 3167 are NOE-derived distance constraints, 431 dihedral angle restraints,78 distance restraints from 39 backbone hydrogen bond, 132 3JHNa restraints, 136 Ca and 134 Cb chemical shift restraints and the use of a conformational database target function. | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with acceptable covalent geometry,structures with favorable non-bond energy,structures with the least restraint violations,structures with the lowest ...コンフォーマー選択の基準: structures with acceptable covalent geometry,structures with favorable non-bond energy,structures with the least restraint violations,structures with the lowest energy,target function 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 30 |