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- EMDB-6784: Large subunit of Trichomonas vaginalis ribosome -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-6784
タイトルLarge subunit of Trichomonas vaginalis ribosome
マップデータ
試料
  • 複合体: Large subunit of Trichomonas vaginalis ribosome
    • RNA: x 3種
    • タンパク質・ペプチド: x 40種
機能・相同性
機能・相同性情報


protein-RNA complex assembly / maturation of LSU-rRNA / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / assembly of large subunit precursor of preribosome / ribosomal large subunit biogenesis / ribosomal large subunit assembly / modification-dependent protein catabolic process / protein tag activity / ribosome biogenesis / 5S rRNA binding ...protein-RNA complex assembly / maturation of LSU-rRNA / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / assembly of large subunit precursor of preribosome / ribosomal large subunit biogenesis / ribosomal large subunit assembly / modification-dependent protein catabolic process / protein tag activity / ribosome biogenesis / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / rRNA binding / negative regulation of translation / ribosome / protein ubiquitination / structural constituent of ribosome / translation / mRNA binding / ubiquitin protein ligase binding / RNA binding / nucleus / metal ion binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
: / : / : / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / Ribosomal L22e protein family / Ribosomal protein L38e / Ribosomal protein L38e superfamily ...: / : / : / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / Ribosomal L22e protein family / Ribosomal protein L38e / Ribosomal protein L38e superfamily / Ribosomal L38e protein family / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L19, eukaryotic / 60S ribosomal protein L18a/ L20, eukaryotes / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / 50S ribosomal protein L18Ae/60S ribosomal protein L20 and L18a / Ribosomal L40e family / Ribosomal protein 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal_L40e / Ribosomal protein L40e / Ribosomal protein L40e superfamily / Ribosomal protein L30e signature 2. / Eukaryotic Ribosomal Protein L27, KOW domain / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e / Ribosomal protein L27e / Ribosomal protein L27e superfamily / Ribosomal L27e protein family / Ribosomal protein L34Ae / Ribosomal protein L34e / 60S ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L30/YlxQ / Ribosomal protein L7A/L8 / Ribosomal protein L13, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L18e / 60S ribosomal protein L6E / Ribosomal protein L37ae / Ribosomal L37ae protein family / 60S ribosomal protein L4, C-terminal domain / 60S ribosomal protein L4 C-terminal domain / Ribosomal_L19e / Ribosomal protein L30, N-terminal / Ribosomal L30 N-terminal domain / Ribosomal protein L19/L19e / Ribosomal protein L19/L19e, domain 1 / Ribosomal protein L19/L19e superfamily / Ribosomal protein L19e / Ribosomal protein L36e / Ribosomal protein L36e domain superfamily / Ribosomal protein L36e / Ribosomal protein L39e / Ribosomal protein L14e domain / Ribosomal protein L39e domain superfamily / Ribosomal L39 protein / Ribosomal protein L14 / Ribosomal protein L35A / Ribosomal protein L5 eukaryotic/L18 archaeal / Ribosomal protein L35Ae / Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18 / Ribosomal protein L35A superfamily / Ribosomal protein L14 / Ribosomal protein L14, KOW motif / Ribosomal protein L4/L1e, eukaryotic/archaeal, conserved site / Ribosomal protein L1e signature. / Ribosomal protein L31e / Ribosomal protein L31e domain superfamily / Ribosomal protein L31e / Ribosomal_L31e / Ribosomal protein L21e / Ribosomal protein L21e, conserved site / Ribosomal protein L21 superfamily / Ribosomal protein L21e / Ribosomal protein L21e signature. / Ribosomal protein L22/L17, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L37e, conserved site / Ribosomal protein L37e signature. / Ribosomal protein L24e-related / Ribosomal protein L24e/L24 superfamily / Ribosomal protein L24e / Ribosomal protein L37e / Ribosomal protein L37e / Ribosomal_L15e / Ribosomal protein L15e / Ribosomal protein L15e core domain superfamily / Ribosomal L15 / Ribosomal protein L32e / Ribosomal protein L37ae/L37e / Ribosomal protein L32e superfamily / Ribosomal protein L32 / Ribosomal_L32e / Ribosomal protein L26/L24, eukaryotic/archaeal / Ribosomal proteins L26 eukaryotic, L24P archaeal / Ribosomal protein L7, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L7/L30
類似検索 - ドメイン・相同性
60S ribosomal protein L18, putative / 60S ribosomal protein L19-3, putative / 60S ribosomal protein L39, putative / Ribosomal protein L31e, putative / 60S ribosomal protein L44, putative / Uncharacterized protein / Ribosomal protein L6, putative / Uncharacterized protein / Ubiquitin / Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein ...60S ribosomal protein L18, putative / 60S ribosomal protein L19-3, putative / 60S ribosomal protein L39, putative / Ribosomal protein L31e, putative / 60S ribosomal protein L44, putative / Uncharacterized protein / Ribosomal protein L6, putative / Uncharacterized protein / Ubiquitin / Ribosomal_L18e/L15P domain-containing protein / Ribosomal protein L24e, putative / Ribosomal protein L24, putative / 60S ribosomal protein L29 / Ribosomal protein L22, putative / Ribosomal protein L27e, putative / Ribosomal protein L5 / 60S ribosomal protein L22-1, putative / 60S ribosomal protein L23, putative / Ribosomal protein L35Ae, putative / Ribosomal protein L23, putative / Ribosomal protein L13, putative / Ribosomal protein L14, putative / Ribosomal protein, putative / Ribosomal protein L29, putative / Ribosomal protein L8, putative / 60S ribosomal protein L30, putative / 60S ribosomal protein L11, putative / Ribosomal protein L15 / 60S ribosomal protein L18a / 60S ribosomal protein L7a / Ribosomal protein L36e, putative / Ribosomal protein L32, putative / Ribosomal protein L21e, putative / Ribosomal protein L30p/L7e, putative / Ribosomal protein L37 / Ribosomal protein L38e, putative / Ribosomal protein, putative / Ribosomal protein L34e, putative / 60S ribosomal protein L6, putative / Ribosomal protein L13e, putative
類似検索 - 構成要素
生物種Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å
データ登録者Li Z / Guo Q / Zheng L / Ji Y / Xie Y / Lai D / Lun Z / Suo X / Gao N
引用ジャーナル: Cell Res / 年: 2017
タイトル: Cryo-EM structures of the 80S ribosomes from human parasites Trichomonas vaginalis and Toxoplasma gondii.
著者: Zhifei Li / Qiang Guo / Lvqin Zheng / Yongsheng Ji / Yi-Ting Xie / De-Hua Lai / Zhao-Rong Lun / Xun Suo / Ning Gao /
要旨: As an indispensable molecular machine universal in all living organisms, the ribosome has been selected by evolution to be the natural target of many antibiotics and small-molecule inhibitors. High- ...As an indispensable molecular machine universal in all living organisms, the ribosome has been selected by evolution to be the natural target of many antibiotics and small-molecule inhibitors. High-resolution structures of pathogen ribosomes are crucial for understanding the general and unique aspects of translation control in disease-causing microbes. With cryo-electron microscopy technique, we have determined structures of the cytosolic ribosomes from two human parasites, Trichomonas vaginalis and Toxoplasma gondii, at resolution of 3.2-3.4 Å. Although the ribosomal proteins from both pathogens are typical members of eukaryotic families, with a co-evolution pattern between certain species-specific insertions/extensions and neighboring ribosomal RNA (rRNA) expansion segments, the sizes of their rRNAs are sharply different. Very interestingly, rRNAs of T. vaginalis are in size comparable to prokaryotic counterparts, with nearly all the eukaryote-specific rRNA expansion segments missing. These structures facilitate the dissection of evolution path for ribosomal proteins and RNAs, and may aid in design of novel translation inhibitors.
履歴
登録2017年7月6日-
ヘッダ(付随情報) 公開2017年8月30日-
マップ公開2017年8月30日-
更新2019年12月18日-
現状2019年12月18日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.044
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.044
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-5xy3
  • 表面レベル: 0.044
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_6784.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_6784.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.32 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.044 / ムービー #1: 0.044
最小 - 最大-0.23113365 - 0.39924592
平均 (標準偏差)0.0004943846 (±0.01008034)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ320320320
Spacing320320320
セルA=B=C: 422.40002 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.321.321.32
M x/y/z320320320
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z422.400422.400422.400
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS320320320
D min/max/mean-0.2310.3990.000

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_6784_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Large subunit of Trichomonas vaginalis ribosome

全体名称: Large subunit of Trichomonas vaginalis ribosome
要素
  • 複合体: Large subunit of Trichomonas vaginalis ribosome
    • RNA: 25S ribosomal RNA
    • RNA: 5S ribosomal RNA
    • RNA: 5.8S ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L8, putative
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L30p/L7e, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L7Ae, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L6, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L13e, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L14, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L13, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L22, putative
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18, putative
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19-3, putative
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18a
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L21e, putative
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L22-1, putative
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L24e, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L23, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L24, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L27e, putative
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L30, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L31e, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L32, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L35Ae, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L34e, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L29, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L36e, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L38e, putative
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L39, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin, putative
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L44, putative
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein

+
超分子 #1: Large subunit of Trichomonas vaginalis ribosome

超分子名称: Large subunit of Trichomonas vaginalis ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)

+
分子 #1: 25S ribosomal RNA

分子名称: 25S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 892.223312 KDa
配列文字列: CGUAGUCUGC CAUACGCAGG AAGACCCGCU GAACUGAAGC AUCUCAUUAA GCGGAGGAAA AGAAACUAAC UAGGAUUCCC UUAGUAAAG GCGAUCGAAA AGGGAACAGC CCAACGUCUU AAUCCCGCAA GGGAAAUGUA GUCGGUUCAC CUAUUGCACU G GUCUAAGU ...文字列:
CGUAGUCUGC CAUACGCAGG AAGACCCGCU GAACUGAAGC AUCUCAUUAA GCGGAGGAAA AGAAACUAAC UAGGAUUCCC UUAGUAAAG GCGAUCGAAA AGGGAACAGC CCAACGUCUU AAUCCCGCAA GGGAAAUGUA GUCGGUUCAC CUAUUGCACU G GUCUAAGU CAGAUGGAAU GCUGCGCGAU UCAGAGUAAA AGCCUCGUAU GACCAACCGC AAGCUUACGA UGGACCGGGG AG AGUCGGA UACUUUGAGA GUAGUGUCUU AAGGGGGUGG UAUGUCCCAU CCAAGGCUAA AUAACGUGAG GAGACCGAUA GAU UACAAG UAGUGUGAAC GAAAGAUGAA AAGAACUCUA AAACAGAGGG UGAAAAGUUC CUGAACUUGC UUAGGGUUAA GGCU AUUUA UAGUACCCGU CUUGAAACAC GGAUUAGGGA GUUUAUCUGU AGUGCGAGUC UUUGCACGUU AACUGUAAAG GCGUA GAGA AAGCAACUGG CGUUUGCAUG GCUACUGAGC AUUACUGAUA GGACCCGAAA GGUGGUGAAC UUUGCCUGCA CAGGUU GAA GUCAGGGGAA ACUCUGAUGG AGGACCGUAC GGGUUAUUGA UGUGCAAAUC AUUUUUCUGA UGUAGGUAAA GGUGCGA AA GACUCAUCGA ACCACCUAAU AGCUGGUUUC CUCCGAAGUU UCCCUCAGGA UAGCUGUAAU GCAUUUAGUU AAGGGGAG U AGAGAUAUGG GUAGAGGUGC AGGGAGCCUU CGGGUUCUCA ACUUAUUUCC AAACUUCGAA CCUCCUUGUU AGGCAUUUA CCUAACUGGA AAUGCUUAAA UGAAUUAGCG UUACAAGUGG GCUCUGACCG GUAAGCGGUC AUGGCGAAAU GGGAUGAACC AUACGUCUG AAUAAGGUGC CGAAAUGUAC UAUCACUGAU ACCAUAAAGG GAGUCCAUGU AUUUAGACAG CAGGUCGGUG C CCCUAAAA GCAGGUAUCC GCUAAAGAGU GUGUUAAAAC UCACCUGCCG AAUACUAGGG CCCCGAAAAU GAAUGGCGCA UA UAGUACU ACCGAUCUCA GACAUCAGUU CUAUUGAACU GAGAGUAGGG GGAUGUGGAC AUUUUUGUGA AGGUGCAAUG UGA GUUGGA CUGGAAGAAU GUCUAUUACA GAUCCUAAUU GAAGUAGCGA UUAUCCAGGC UUGUAUCCUG GGGGCUGAUG AGGA GUAGG GUUUCUGGAC AACUUAAACA GAUCCAGAGU UAGUCGAUCC UAAUCUCAAU AAUGGGAGAA AGGGAGUACA GUUGA UAUU CUGUAACUGA CAACAGUUCG CGGCAACGCA UACUAUUUUU CUCCGCCAAU CUUAUACCGU UGGUAGGGAU CUCUUU CCU ACAUGACAGU ACUAAUACCC AGGGAAACUG GUCAUCAGGC GAACUGCGGC GUUCUGCUGG CAAAACAUAG CUUCGGU UA UGUCAAUGGC UAUUGGAUUG GUCCAUGAAG CGAAAAAUAG UUUACUGUGU CACUCGUACC GAUAACCGCA UCAGGUCU U CUAGGUAAGU AGCCUAUGGC CAUUGAGGCA UGAUAGUUCA GGGAAUUCGG CCAAUUAGAG CUGUAACUUC GGGAUAAAG CUUGGCUCUG AUGAAAAUCA GAACCGAUUG UUACGCGGAG AGCCCAACUG UUUAAUAAAA ACGUAGUGUC GCGCUGUGGU AGUAUAGCC AGUGAACGCG ACAUGAAUCC UGCUCAGUGC UGUGUCUGUU AAUAUGGUUC AAGCCAACGA AGCACCGGUA A AUAGCUGG GGUAACUAUG ACUCUUAUCA AAGUAGCGAA AUACCUCGUC ACUUAAUUAG UGACCUGCAU GAACGGAGCU AU GAGGUUC UCACUGUCCC AAACUGUCUC UCAGCGAACC AACUGUAGUG GGAACGGUCA CUAGAUAUCC AGCGGGGAAA GAA GACCCU GUAGAGCUUC ACUUUGGUCU AGUCUUGUAU AGUUCCUGCG GGGGUGUAGA CUAGGUGGGA GAGCAAUCGA UUCU GAAAA ACCACUACCC UGUUUGGAAU UAUGCUUACC UAUCACAAGG AAUAGGACUA GAUAGAAAGU UUGGCUGGGG CGGCA CACC UUCGAAAGAG CAGCGAAGGU GUCCUAAGUU GAGCUCAGUG AGGACAGAAA UCUCACGUUG AGGAUAAGGC CAAAAG CUC AAUUUACUGU GCCUUUUUGU ACUAGGAUCA GUUACGAAAG UAAGGCCUAA CGAUCCCUAA AUAGCCUCAG GUGCGUG AG GAUUGGGGUG ACAGACAAGU UACCUCCGGG ACAACUGGCU UGUGGCUGCU AAGAGAUCAA AUCAACGCAG CUUUUUGA U UCUUCGAUGU CGGCUCUUCC UAUCCUAGUG AUGUACAAGU UGCUAAGGGU CGGAUUGUUC ACCCGUAUUA GGGAUCGUG AGCUGGGUUU AGACCGUCGU GAGCCAGGUU UGUUUUAUCC UACUGGAUAU AGCAUCAUGA UAGUAGAUUG AUUUAGUACG AGAGGAACU GUUGAUUAUG GCCUCUGGUU AGCGAUUAUC GGAAACGGUA UGUCGCGCAG CUACGCCGUC UGGGAUAAUG G CUGAAAGC CUCUUAAGCC AGAAGCCCAU CUAGAAAGUG AUGCACGUGA UGUUGGACCG AUACGAAUAA UCAUACUCAA AA GGUCCGC UUCAUAGGUA ACCCAAUGUA GAAGACAUUG UGUGAACGAA GGUACUGUAA GCAGUGGAGU GGCAUUACGU CCA CGACCU GUUGAGGUUC AGCUUCGCUU CUAGGUUUCC AAAUAUUUU

+
分子 #2: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 37.963594 KDa
配列文字列:
GAAGCGGCCA CACCCGGCUG GCAACAUCCA GCUCCACUCC GAACCUGGAA AUUAAGCAGU CGCGGGCCAC AUCAGUACUG GGCUGGGCG ACUUCCCGGG AACGUGCGGU GCUUGCUUC

+
分子 #3: 5.8S ribosomal RNA

分子名称: 5.8S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 52.173945 KDa
配列文字列:
AAGUCUCUAA GCAAUGGAUG UCUUGGCUCC UCACACGAUG AAGAACGUGG CAUAAUGUGU UAAGUAACCG GAGUUGCAAA CAUCAUGAC AGGUUAAUCU UUGAAUGCAA AUUGCGCUAA ACUCGAUCUC GGUCGAGAAG CAUGGGUGUG ACAGUACUAC A UC

+
分子 #4: Ribosomal protein L8, putative

分子名称: Ribosomal protein L8, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 26.949082 KDa
配列文字列: MGHIVRAQRR GNGSVFQAHT HHRVGPAKFR ALDAAERTSV ISGMVKEIIH DPGRGAPLAK LIYKKAEGQG FDSALVIAPE GIHTGQFIK CGAQADLHIG NILPLAQIPE GTEICNVEHR PGDGGRYGRC SGDSCRVIGH TENYTRIQLP SGRKALVSNI C RATLGIVA ...文字列:
MGHIVRAQRR GNGSVFQAHT HHRVGPAKFR ALDAAERTSV ISGMVKEIIH DPGRGAPLAK LIYKKAEGQG FDSALVIAPE GIHTGQFIK CGAQADLHIG NILPLAQIPE GTEICNVEHR PGDGGRYGRC SGDSCRVIGH TENYTRIQLP SGRKALVSNI C RATLGIVA GGGRPEKPLL KAGNVHYKYK AKRHTWPVVC GIKMNPVDHR HGGGSHQHMG APGTVARSAR PGQKLGLIAS RR TGRRRGT VNLA

+
分子 #5: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 46.90427 KDa
配列文字列: MSHRKFNAPR RGSLGFLPRG RSHAVRGRVR SWPKDDASQK PHLCAFIGYK AGMTHVLRDV VRPNSRLHKK EACEPVTILE TPPMFVVGI IGYKPTVEGL KPVTTVWASY VNEEVKRNYY KNWYQSKARK AFSCLSNGKA AEKREKQLEE LQKEATVIRV I AHTQSAKT ...文字列:
MSHRKFNAPR RGSLGFLPRG RSHAVRGRVR SWPKDDASQK PHLCAFIGYK AGMTHVLRDV VRPNSRLHKK EACEPVTILE TPPMFVVGI IGYKPTVEGL KPVTTVWASY VNEEVKRNYY KNWYQSKARK AFSCLSNGKA AEKREKQLEE LQKEATVIRV I AHTQSAKT TTRGVDANEQ GAKKVLKGNH LGQKKAHMIE IQINGGDVAA KLNYAKSILE KEIKVADVFT EGEQIDTIGV GK GFGWEGV IHRYGTKRLQ KKTHRGRRKV ACIGPWNPAR VLWSVARYGQ RGCHHRTEMN KRIYRIGAAE VEGKINEGGS TSF DLTKKS INPMGGFPHY GLVKDDFLMI KGSVVGTVKR AITLRKTINI NTRRIATEEI NLKWIDTASK FGHGRFQTKE ERSK FLGKL KISKKNETQQ

+
分子 #6: Ribosomal protein, putative

分子名称: Ribosomal protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 40.320738 KDa
配列文字列: MSRQTVNVLA QDGQKASTIE LPKVFDTPIR AEVVKEVYVN LAKNAQQPHA NDPMAGKKVS AISWGTGRAK ACVPRVNGSG SNRNGQGAY ANFCRGGHRF NPPTLLRRWF RPVPSRQRKF AIASAIAATA VVPLVQARGH VLGEVKEVPI VVVDAVQEIK R TRDAVELL ...文字列:
MSRQTVNVLA QDGQKASTIE LPKVFDTPIR AEVVKEVYVN LAKNAQQPHA NDPMAGKKVS AISWGTGRAK ACVPRVNGSG SNRNGQGAY ANFCRGGHRF NPPTLLRRWF RPVPSRQRKF AIASAIAATA VVPLVQARGH VLGEVKEVPI VVVDAVQEIK R TRDAVELL KKVGVYGDVQ RVLDGSVHRS SKGKFRRAAY KTKKGPLVIY NEDKGIVKAF RNIPGVETIS VKALALAKLA PA AQVGRLT VWTESAFKAL DGIYESKKRF SLPRSIMTNA DIEAVITSDA VQSVLNEKKE VVPLPKCRCC KKLSVGACED WQK ALKEVA ELRAAQEAKR TSPEVVKAVF AEAVAAQPAT PDNMSTQIIN HIPL

+
分子 #7: Ribosomal protein L5

分子名称: Ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 34.932766 KDa
配列文字列: MSAKLVKNAG YFSRFQTKFR RRREAKTDYV QRTQLIQQDK TKYGAAKYRL VARITNTKVI AQIVVAELTG DKTVCQALST ELPKYGIKL GLSNYPAAYA TGLLVARRFL TQMKLADVFK TEITEEYLND EENRRPFKVI LDVGLARTTT GAKVFAVMKG A VDGGLFIP ...文字列:
MSAKLVKNAG YFSRFQTKFR RRREAKTDYV QRTQLIQQDK TKYGAAKYRL VARITNTKVI AQIVVAELTG DKTVCQALST ELPKYGIKL GLSNYPAAYA TGLLVARRFL TQMKLADVFK TEITEEYLND EENRRPFKVI LDVGLARTTT GAKVFAVMKG A VDGGLFIP HNVCRLACKF DKKDKDAGKD RKDVPADKIV KGNQYYILGG AVADYMRKLK KESEEKYNKQ FSRYVKAGIT AD NLEKIYK DAHAAIRKNP AATVIADKKK HAEEMKQKHA PKKPQTKKLS FEEKRKILNE HLVAAGLPPR K

+
分子 #8: 60S ribosomal protein L6, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L6, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 16.045772 KDa
配列文字列:
MAELLFISPI AKKDIKRPSW RGIPRISFTR PAVAAEVDPI AKPACNAKAV ETRANLKVGT VVIIVGGEHQ GKRAVVVADQ GAGIVKVAG PVVPVNEISQ DYLIATSTSI DVAANATEAQ VEAAAAKVPE MVDYLKAPFT IKKGNRIHLM KF

+
分子 #9: Ribosomal protein L30p/L7e, putative

分子名称: Ribosomal protein L30p/L7e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 26.842281 KDa
配列文字列: MGKPLPETLQ KIAARVEAQK AAYLKKKEEL LAAAKANEAK IQERAKKYAA EYVSQTKAEI DAENKATAEG AFYVPAEAKF AFVIRTKGT NKLHPDVRKI LHLFRLNQKH NAIFVRLNKA TIEMLKRVTP QVAFGYPSVD MVRKLIYKLG TANLNGQRIP I ADNQIIKV ...文字列:
MGKPLPETLQ KIAARVEAQK AAYLKKKEEL LAAAKANEAK IQERAKKYAA EYVSQTKAEI DAENKATAEG AFYVPAEAKF AFVIRTKGT NKLHPDVRKI LHLFRLNQKH NAIFVRLNKA TIEMLKRVTP QVAFGYPSVD MVRKLIYKLG TANLNGQRIP I ADNQIIKV ALGHLCIESV EDLAHEIYTV GPNFAAANRF LAVFKLHAPK GGYKKINRAY VEGGDYGNRE HLIDELIERM I

+
分子 #10: Ribosomal protein L7Ae, putative

分子名称: Ribosomal protein L7Ae, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 27.602273 KDa
配列文字列: MAPKATRSAP EKVIEDKDII RQEHLFAEET AEKVADKTTQ TRFPKYVQLQ RQKRILMKRL KVPPPVNHFN HTLGKDAAVA LFKFLEKYR PETKTEKKQR NKDDAEKAKK DLKVAGSGNK KALVQGVKNV TAAIESKKAQ LVIIAHDVDP IELVIWMPAL C RNLEIPYC ...文字列:
MAPKATRSAP EKVIEDKDII RQEHLFAEET AEKVADKTTQ TRFPKYVQLQ RQKRILMKRL KVPPPVNHFN HTLGKDAAVA LFKFLEKYR PETKTEKKQR NKDDAEKAKK DLKVAGSGNK KALVQGVKNV TAAIESKKAQ LVIIAHDVDP IELVIWMPAL C RNLEIPYC IVKSKSRLGQ IVGMKTCSCV ALAEVKPEDR AAFTKIVDSV NSGFLAHYKE EMHQWGGGEL SEKTIEKLKA QG KYKE

+
分子 #11: Ribosomal protein L6, putative

分子名称: Ribosomal protein L6, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 22.930506 KDa
配列文字列: MPRPVLHQEH FKIPENIKCT VKSGVVTIEH QDPKDKKTTK LVKDLSHLKL DFEYDEKDHQ IVARCWFGNR KLLARIGTLF GIVKNMITG VTLGWRYKMH FVYSHFPIKH TCSEDGRTFD FNGFMGHKEH KIVTAPEGVR IWSNESVAKD EINIEGANLE D VSLVCGQI ...文字列:
MPRPVLHQEH FKIPENIKCT VKSGVVTIEH QDPKDKKTTK LVKDLSHLKL DFEYDEKDHQ IVARCWFGNR KLLARIGTLF GIVKNMITG VTLGWRYKMH FVYSHFPIKH TCSEDGRTFD FNGFMGHKEH KIVTAPEGVR IWSNESVAKD EINIEGANLE D VSLVCGQI HQLTKIKDKD LRKFLDGIYV QHIEHLKEE

+
分子 #12: Ribosomal protein, putative

分子名称: Ribosomal protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 23.800781 KDa
配列文字列: MGRRPARCYR YIGNKPYPKS RFCRGVPDPR IIRYETGTKT AHAKELPICC RLILLEHECV SSEALEAARV SSNRYMMKTM GKDGYHIKI NLHPFHVLRI NKMLSTAGAD RLQTGMRHAF GKPEGLVARA NYNSQIMTIR TTSAGLKHAL EALRRASFKF P GHSRVVIS ...文字列:
MGRRPARCYR YIGNKPYPKS RFCRGVPDPR IIRYETGTKT AHAKELPICC RLILLEHECV SSEALEAARV SSNRYMMKTM GKDGYHIKI NLHPFHVLRI NKMLSTAGAD RLQTGMRHAF GKPEGLVARA NYNSQIMTIR TTSAGLKHAL EALRRASFKF P GHSRVVIS NKVGFTPYTF EQFKELQANG QIVDCGNHVK RVYRRGPIPT H

+
分子 #13: 60S ribosomal protein L11, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L11, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 19.373488 KDa
配列文字列:
MSNKLNEIRV AKLCININPG AVGDQVTRAS RVIEQLTKQQ AMLARSHRTI PKFGIRRNDK IAAYATIRGP KALEILNRAL QVHDYEISG RCFSIEGNFG FGIKEHIDLG LKYDRDIGIH GMDLYVVLER PGNRISRRKH CQSRIGPNQR VKREEAKEWF V QKFNGTLL K

+
分子 #14: Ribosomal protein L13e, putative

分子名称: Ribosomal protein L13e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 21.865705 KDa
配列文字列: MVAKNNQIPN DHLRKYWYHR VKTFFDDPAR AQRRRNARNL RAKKIAPRPA EGPLRPIVRC PTVRYNMKTR LGRGFTPKEL VAAGFDPAL ARFQGIAVDA RRAHSKDAMV KQNVERLQAY KARLIKVKKG ETVEQVNDAA LFALPKAQNE IKFRVIKAEE A KKDLFKEK ...文字列:
MVAKNNQIPN DHLRKYWYHR VKTFFDDPAR AQRRRNARNL RAKKIAPRPA EGPLRPIVRC PTVRYNMKTR LGRGFTPKEL VAAGFDPAL ARFQGIAVDA RRAHSKDAMV KQNVERLQAY KARLIKVKKG ETVEQVNDAA LFALPKAQNE IKFRVIKAEE A KKDLFKEK TDKLKAFREA KKEKAAAKHK K

+
分子 #15: Ribosomal protein L14, putative

分子名称: Ribosomal protein L14, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 14.726112 KDa
配列文字列:
MPFKQFVEIG RVALINFGEL VDKLAIIVDI VDDKRVLIDV LEFDAPRQTI PIQRLKLTDY VAKIQRNAAP EAAKAAAKDF IKQFYESAW GKQVIARKNK AQMNDFQRFK YAQLEAKRDA LVAKELNNH

+
分子 #16: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 24.323465 KDa
配列文字列: MGAFTYLREL YTKKQSEVMR FILRLRCWEY RQLPELVRLT HPSRPDKARR MGYKAKQGMV VYRIRVRKGS RRRVASKNRQ YGKPRTHHI YKLTPSLNLQ AIAEQKAGKQ LPSLRLLNSY WVNQDGAFKY FECIFVDPVH PAIQHDAKLN WICDSVHTRR E ARGLTAAG ...文字列:
MGAFTYLREL YTKKQSEVMR FILRLRCWEY RQLPELVRLT HPSRPDKARR MGYKAKQGMV VYRIRVRKGS RRRVASKNRQ YGKPRTHHI YKLTPSLNLQ AIAEQKAGKQ LPSLRLLNSY WVNQDGAFKY FECIFVDPVH PAIQHDAKLN WICDSVHTRR E ARGLTAAG RKHRGLSGVG HGFRHLRPSR YADWKVRNVF KLRRWR

+
分子 #17: Ribosomal protein L13, putative

分子名称: Ribosomal protein L13, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 22.569111 KDa
配列文字列: MSAPIVIDAK GHIQGRLAAA VAKQLLKGRK VVVVRCEEIE LNGQHKFTVH TYERFLNKTT NSNPRDGPFH QRAPHEIFAR AVRGMIPYK THRGADAFAN LQCYEGIPAK YVSYKRLVIP HALRCVSIHT DRPTTKLGRL STTMGWKYGN VVAQLEEQRK A ESAKYFEA ...文字列:
MSAPIVIDAK GHIQGRLAAA VAKQLLKGRK VVVVRCEEIE LNGQHKFTVH TYERFLNKTT NSNPRDGPFH QRAPHEIFAR AVRGMIPYK THRGADAFAN LQCYEGIPAK YVSYKRLVIP HALRCVSIHT DRPTTKLGRL STTMGWKYGN VVAQLEEQRK A ESAKYFEA KKAAQDKRAA AIEKVNKQLG AQAVKFLETF QE

+
分子 #18: Ribosomal protein L22, putative

分子名称: Ribosomal protein L22, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 18.53049 KDa
配列文字列:
MSTHYTFSNV EESKALKAST GLERVHFKPM METGRVIKGM KAQDAIAYLE AVMRKERAVP FFRYKGGISH HAQGHEWGCP TSRWPVKCA ELYIKLIKTA LAGAPQKPGV NVDEVLVAHV QCNRATQYRW RRIHQAHGRV KSYASPPTNV QIVLAEKAAI K ERSQ

+
分子 #19: 60S ribosomal protein L18, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L18, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 21.122545 KDa
配列文字列:
MGVDLDHRVP RKQRQEPKTA DAQMKMLHNL YAFLARRTGN DFNAKIAHRL CISRTNRRPY SLSRLATALN GKEAETIAVL VAKITNDER LLEVPKMKVC ALKFTETARA RILAAGGECI TFDQLAQLRP TGDKCLLLEG DRTRRLVNKH FGAAPGDDNS K TRPKVASH GRKFEMARGR RKSRWYHA

+
分子 #20: 60S ribosomal protein L19-3, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L19-3, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 21.056785 KDa
配列文字列:
MSSLKLQKRL AASVLDCGVR RVWMDDSEVS TIAMANSRQQ IRKLINDGII VKRPVKVHSG ARHTKRILAK RLGRHTGYGK RRGGRNARL TGKFQWIRRI RVLRKVLVDY RKRNEIDCHL YRKLYLKAKG NEFRNRRNLV EHIQTLKAEN LREKTLQSQI D ARRARSRR VRERKNGVSQ

+
分子 #21: 60S ribosomal protein L18a

分子名称: 60S ribosomal protein L18a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 19.853973 KDa
配列文字列:
MSLKQYLVIG RPYPTKEIPN PPAVRVQVFA PDEVIAKSKF WTVAQRIARL KKAHGEVLAV KHVIEPEPTR VKNYGVWLSY RSTRNHHNV YKEYRDTTTE GAATKMLAEL AGTHDVSADN ISIIKIAEVA DKDLVHKNIS QFTHENIKFP MLKQSIRAPT A SARKVFAA TRPTVCGF

+
分子 #22: Ribosomal protein L21e, putative

分子名称: Ribosomal protein L21e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 17.910867 KDa
配列文字列:
MGHTEGLRHA TRYLFARKFR KHGAPAPSIT LRTFRIGDIV DIKVNGALHS GMPNRVYHGA TGIVWNVSPH AVGILVKRRV NNHIAPKRI YVRTEHVFPS KSKNDFVARC QANLKAHEEA KKAGTKIALP KRLPAQPRAS HVVKPELIQT ITDAPFRENW

+
分子 #23: 60S ribosomal protein L22-1, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L22-1, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 12.237054 KDa
配列文字列:
MASSVFYVDC SAPVADKFFQ LQEFVEYLQS HMKVDNLRKN LANKVTIEAD AGANKIVVNA SVKYSKRAVR YYARKFLAKK DIRSRFHVI ASGKDTYELR PYRVSNE

+
分子 #24: 60S ribosomal protein L23, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L23, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 14.840554 KDa
配列文字列:
MSKRGRTGQQ GTKFAMTAGL PVGAVINCCD NSGAKNMFII SVRGHKGRLN RLPAASVSDL IVVTCKKGKP ALRKKVSMGV VVRQRAIWR RKDGVVIGFQ DNAGVIINDK GEMKGSAITG PVAKEAAELW PKVASVAPAV F

+
分子 #25: Ribosomal protein L24e, putative

分子名称: Ribosomal protein L24e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 13.282475 KDa
配列文字列:
MSTKTEICGF SGHIFHAGHG RVHIREDKHL MAFESRKAFR MWERKRNPRK IAWTEHYRHD HKKSVADTAA TEKRAQRKKA TRTYAGVAM EGNQHQMVQI VKKRVARKPV AKKN

+
分子 #26: Ribosomal protein L23, putative

分子名称: Ribosomal protein L23, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 15.582249 KDa
配列文字列:
MSGKAQAAAQ TLAQGQKKEV TKTRNFTKFG KNAAQVVPRR PAFEHKAVKP VSLKHNDYKI IRGPVTSDKS TVKIENENTM TFWVDIKAT KTEIAAAFNR LYKVKPVKVC TVITSKFVKK AYIRLPANVE AMNIATEIGF A

+
分子 #27: Ribosomal protein L24, putative

分子名称: Ribosomal protein L24, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 15.782617 KDa
配列文字列:
MVKTNPFVSS QARKVRKSYF NAKKDAKHVA MSAPLSKELQ EANGIKRLPI RRDDEVMIFS GRMQNRTGKV TAVKLSEMRI YVDTFTTEK INGQAVSFPV HPSNVVITKL KMDKARKNLI ELRRLGRDQI LAKLGHKKQ

+
分子 #28: Ribosomal protein L27e, putative

分子名称: Ribosomal protein L27e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 15.946061 KDa
配列文字列:
MSLLQAGRFV VMLQGRHAGK KAVVLAAYPE GTEDRKFPYA IVMGIEKYPK KVTKDMPTEV LVKKTQVKLF VKAVNFNHVM LTRHNVKDE DFFKKISVEK VVAALKDAPA KKALLTEYAA VLRQKYLNNK MAWFFKPLQF

+
分子 #29: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 17.006787 KDa
配列文字列:
MPTRFHKSRK LRGQVSMGFG RVGKHRVSPG GHGRAGGQHH QRTWFDRFHP GYFGKVGMRH LHLMKNRADE YEPTINVDKL WTLVPEEVR VKAAAAKKGD AVPVIDCVQN GFFKVLARGE LPKIPFVVRA KDFSEEAEKK IKAAGGVCEK VQ

+
分子 #30: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 6.823724 KDa
配列文字列:
MAKRSNTSAH NRSHQHHRNG IHKCVVKKLW FEKGMNAKFL RNARYAKAGQ NKSEEEDE

+
分子 #31: 60S ribosomal protein L30, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L30, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 12.316229 KDa
配列文字列:
MGRKKLSRAR ESIINSLSLV TKSGKYQLGI DKTLQSLRNG EAKLVIFASN VAPAHRSLIE YYAMLSGCDI LPFDGDNVDL GTACGKYFR SSVISIIDAG ESEILKMIKQ KDE

+
分子 #32: Ribosomal protein L31e, putative

分子名称: Ribosomal protein L31e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 12.446528 KDa
配列文字列:
MPKELAPAKI ETTIHLQKAV HGTTRRFRAE RAIKVIAAAA KKMMHTDVVK IDPELNSRIW IHGKNCPPTR VRVTFERKAD EEDAEKMIT IASFKNVASF NGLQTTKVVD Q

+
分子 #33: Ribosomal protein L32, putative

分子名称: Ribosomal protein L32, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 15.249669 KDa
配列文字列:
MVNPAEHKPI IHKKTNRFHR PQSDLWNRVP SAWRHPRGID SRFRRKYRGT PLHPSAGFGS DKETRFMLPN GFIPVIVRSL KDLDMLLTK NTTHGAMISA QVGAKLQQEI IKKAQELNIE ILNQARKHVA QEQ

+
分子 #34: Ribosomal protein L35Ae, putative

分子名称: Ribosomal protein L35Ae, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 11.668678 KDa
配列文字列:
MSEQVKLFVP ATFVSFRRSK RIIKPNQALL EIQGVVSKEE AQFYAGKKVA SVWKFDKQEF INWGVITQPH GNSGVVRAKF EKNLPPQML GKQVRVMLYP STI

+
分子 #35: Ribosomal protein L34e, putative

分子名称: Ribosomal protein L34e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 13.346646 KDa
配列文字列:
MVDNRYTLRR SLGFHTIRNR VAPVRTPGNK LVAHYIAKRQ NGPHCAETGK RINGIKCVKT CELRRMKKNQ RTVSRPYGGV YCGSVVKDR IINAFMEEEA RAAQERKMAN EQKKKGK

+
分子 #36: Ribosomal protein L29, putative

分子名称: Ribosomal protein L29, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 14.300049 KDa
配列文字列:
MGHLKGKELI KKTRQELLDE LAGLEKKLFE LKGQKAASAA ATKLTEIKNT RRDVARVKSI LMVSQRKALQ EKYAKAKLVP IDLRKHQEK SLRNKLAPKY ANKLTAQESR RHKCLFERKF ALKAQ

+
分子 #37: Ribosomal protein L36e, putative

分子名称: Ribosomal protein L36e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 10.941717 KDa
配列文字列:
MSEEQQKVLA PKRECGLHSS GKRVNFARKI VHELVGWQPY ERHTMDLIKI ERRRAARQFL KKRLGTHRRA MKKLNTLEEV VQEESLHHH HE

+
分子 #38: Ribosomal protein L37

分子名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 9.355945 KDa
配列文字列:
MGAGTPSFGP RHNKTHTICR RCGNRCFHIQ KSKCAKCGYP DATMRHYDWE KKAHRKRAQG SGEMRHLKVT FAKLQRAYAP K

+
分子 #39: Ribosomal protein L38e, putative

分子名称: Ribosomal protein L38e, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 8.46896 KDa
配列文字列:
MPKQVTTPKE FLALAARSDA KWVKVKKASD DNTKFKLRTT KYLYTLSVKP KFVELVQNSI PESLEVIVLD KKAE

+
分子 #40: 60S ribosomal protein L39, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L39, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 6.297775 KDa
配列文字列:
MAAHKTLRTK RILCKAMKVN RPMPQFIRQM TGVRHIRNPL TRHWRRRKMN I

+
分子 #41: Ubiquitin, putative

分子名称: Ubiquitin, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 15.101515 KDa
配列文字列:
MQIFVKTLTG KHITLEVEPT DRIEDVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGNTLQDYS IQKDSTLHLV LRLRGGGKEA YEPSLRILA EKTNVKRSVC RKCYARLSER AQQCRHKQCG HCKSIRPKKA GKE

+
分子 #42: 60S ribosomal protein L44, putative

分子名称: 60S ribosomal protein L44, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 12.471015 KDa
配列文字列:
MVHHPKTKKF FCKFCKKHTM CKVSQASRGE ERHSALGRRR YDRKQKGFGG RVKPILRRSK KTSKKISLRF TCQSCKKATM YCLGRLRKF EWTVEKKKKH AEPTW

+
分子 #43: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichomonas vaginalis (ちつほねまくむし)
分子量理論値: 10.051994 KDa
配列文字列:
MARRTKKVGI CGKYGVRYGA SLRKTIKKIE ISQRKKYPCA FCGKDSVKRN AVGIWTCTKC GKAVAGGAYT PTTPAALTAR AAYKRIREA QAK

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 2.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 57162
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION
FSC曲線 (解像度の算出)

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

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  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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