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- EMDB-11900: Staphylococcus aureus 50S after 30 minutes incubation at 37C -

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基本情報

登録情報

データベース: EMDB / ID: EMD-11900

タイトル

Staphylococcus aureus 50S after 30 minutes incubation at 37C

マップデータ

試料

複合体: 50S ribosomal subunitProkaryotic large ribosomal subunit
- タンパク質・ペプチド: x 27種
- RNA: x 2種
リガンド: x 1種

機能・相同性

機能・相同性情報

large ribosomal subunit /

5S rRNA binding /

transferase activity /

tRNA binding /

rRNA binding /

リボソーム / structural constituent of ribosome /

ribonucleoprotein complex /

翻訳 (生物学) /

細胞質
類似検索 - 分子機能

Ribosomal protein L25, long-form /

Ribosomal protein L25, beta domain /

Ribosomal protein L25, C-terminal /

Ribosomal protein TL5, C-terminal domain /

Ribosomal protein L16 signature 1. /

: /

Ribosomal protein L6, conserved site /

Ribosomal protein L6 signature 1. /

Ribosomal protein L16, conserved site /

Ribosomal protein L16 signature 2. ...

Ribosomal protein L25, long-form /

Ribosomal protein L25, beta domain /

Ribosomal protein L25, C-terminal /

Ribosomal protein TL5, C-terminal domain /

Ribosomal protein L16 signature 1. /

: /

Ribosomal protein L6, conserved site /

Ribosomal protein L6 signature 1. /

Ribosomal protein L16, conserved site /

Ribosomal protein L16 signature 2. /

Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal L25p family /

Ribosomal protein L25 /

Ribosomal protein L28/L24 superfamily /

Ribosomal protein L36 signature. /

Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal /

Ribosomal protein L32p, bacterial type /

Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily /

Ribosomal protein L28 /

Ribosomal protein L35, conserved site /

Ribosomal protein L35 signature. /

Ribosomal protein L33, conserved site /

Ribosomal protein L33 signature. /

Ribosomal protein L35, non-mitochondrial /

Ribosomal protein L5, bacterial-type /

Ribosomal protein L6, bacterial-type /

Ribosomal protein L18, bacterial-type /

Ribosomal protein L19, conserved site /

Ribosomal protein L19 signature. /

Ribosomal protein L36 /

Ribosomal protein L36 superfamily /

Ribosomal protein L36 /

Ribosomal protein L20 signature. /

Ribosomal protein L27, conserved site /

Ribosomal protein L27 signature. /

Ribosomal protein L14P, bacterial-type /

Ribosomal protein L34, conserved site /

Ribosomal protein L34 signature. /

Ribosomal protein L35 /

Ribosomal protein L35 superfamily /

Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type /

Ribosomal protein L35 / Ribosomal L28 family /

Ribosomal protein L33 /

Ribosomal protein L28/L24 /

Ribosomal protein L33 superfamily /

Ribosomal protein L30, bacterial-type /

Ribosomal protein L16 /

Ribosomal protein L18 / Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast / L28p-like /

Ribosomal protein L20 /

Ribosomal protein L20, C-terminal /

Ribosomal protein L21 /

Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein /

Ribosomal protein L19 /

Ribosomal protein L19 superfamily /

Ribosomal protein L19 /

Ribosomal protein L17 /

Ribosomal protein L17 superfamily /

Ribosomal protein L17 /

Ribosomal protein L21-like / L21-like superfamily / Ribosomal prokaryotic L21 protein / Ribosomal L32p protein family /

Ribosomal protein L32p /

Ribosomal protein L34 /

Ribosomal protein L13, bacterial-type /

Ribosomal protein L3, bacterial/organelle-type /

Ribosomal protein L15, bacterial-type /

50S ribosomal protein uL4 /

Ribosomal protein L5, conserved site /

: /

Ribosomal protein L5, N-terminal /

Ribosomal protein L5 signature. /

Ribosomal protein L15, conserved site /

Ribosomal protein L5, C-terminal /

Ribosomal protein L5 /

Ribosomal protein L5 domain superfamily /

Ribosomal protein L2, conserved site /

Ribosomal protein L2 signature. /

Ribosomal protein L10e/L16 /

Ribosomal protein L10e/L16 superfamily /

Ribosomal protein L5 /

Ribosomal protein L6, alpha-beta domain /

Ribosomal protein L6 / ribosomal L5P family C-terminus /

Ribosomal protein L6, alpha-beta domain superfamily /

Ribosomal protein L16p/L10e /

Ribosomal protein L6 /

Ribosomal protein L2, domain 3 /

Ribosomal protein L14P, conserved site /

Ribosomal protein L15 signature. /

Ribosomal protein L29/L35 /

Ribosomal protein L29/L35 superfamily / Ribosomal L29 protein
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)

手法

単粒子再構成法 /

クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.48 Å

データ登録者

Cimicata G / Bashan A / Yonath A

資金援助

1件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Staphylococcus aureus 50S after 30 minutes incubation a 37C
著者: Cimicata G / Bashan A / Yonath A

履歴

登録	2020年10月27日	-
ヘッダ(付随情報) 公開	2021年11月17日	-
マップ公開	2021年11月17日	-
更新	2021年11月17日	-
現状	2021年11月17日	処理サイト: PDBe / 状態: 公開

-
構造の表示

ムービー	表面図（断面を密度値に従い着色）表面レベル: 0.0037 UCSF Chimeraによる作画ダウンロード表面図（高さに従い着色）表面レベル: 0.0037 UCSF Chimeraによる作画ダウンロードあてはめたモデルとの重ね合わせ原子モデル: PDB-7asm 表面レベル: 0.0037 UCSF Chimeraによる作画ダウンロードムービービューア
構造ビューア	EMマップ: SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像	emd_11900.png

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ダウンロードとリンク

-
EMDBアーカイブ

マップデータ	emd_11900.map.gz	140.6 MB		EMDBマップデータ形式
ヘッダ (付随情報)	emd-11900-v30.xml emd-11900.xml	41.1 KB 41.1 KB	表示表示	EMDBヘッダ
画像	emd_11900.png	91.7 KB
その他	emd_11900_additional_1.map.gz	166.9 MB
アーカイブディレクトリ	http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-11900 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-11900	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	7asmMC 11901C 11902C 11903C 7asnC 7asoC 7aspC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	7asm-d 1qvf-d 3cd6-d 1vqn-d 11916 3cxc-d 30215 1vqp-d 1vq9-d 1jj2-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

EMDBのページ	EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource
「今月の分子」の関連する項目	#10 - 2000年10月リボソーム (Ribosome) 類似性 (1) #253 - 2021年1月エクスプレソーム (Expressome) 類似性 (8) #121 - 2010年1月 70Sリボソーム (70S Ribosomes) 類似性 (6) #157 - 2013年1月転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA) 類似性 (11) #262 - 2021年10月 PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures ) 類似性 (6)

EMDBのページ

EMDB (EBI/PDBe) /

EMDataResource

「今月の分子」の関連する項目

#10 - 2000年10月
リボソーム (Ribosome)
類似性 (1)
#253 - 2021年1月
エクスプレソーム (Expressome)
類似性 (8)
#121 - 2010年1月
70Sリボソーム (70S Ribosomes)
類似性 (6)
#157 - 2013年1月
転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA)
類似性 (11)
#262 - 2021年10月
PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures )
類似性 (6)

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マップ

ファイル

ダウンロード / ファイル: emd_11900.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 178 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)

ボクセルのサイズ

X=Y=Z: 0.858 Å

密度

表面レベル	登録者による: 0.0037 / ムービー #1: 0.0037
最小 - 最大	-0.029684417 - 0.08533615
平均 (標準偏差)	-6.4310785e-05 (±0.0033578738)

対称性

空間群: 1

詳細

EMDB XML:

マップ形状

Axis order	X	Y	Z
Origin	0	0	0
サイズ	360	360	360
Spacing	360	360	360

セル

A=B=C: 308.88 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップヘッダ情報:

mode	Image stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z	0.858	0.858	0.858
M x/y/z	360	360	360
origin x/y/z	0.000	0.000	0.000
length x/y/z	308.880	308.880	308.880
α/β/γ	90.000	90.000	90.000
MAP C/R/S	1	2	3
start NC/NR/NS	0	0	0
NC/NR/NS	360	360	360
D min/max/mean	-0.030	0.085	-0.000

-
添付データ

-
追加マップ: #1

ファイル

emd_11900_additional_1.map

投影像・断面図

軸	Z	Y	X
投影像
断面 (1/2)

密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : 50S ribosomal subunit

全体	名称: 50S ribosomal subunitProkaryotic large ribosomal subunit
要素	複合体: 50S ribosomal subunitProkaryotic large ribosomal subunit タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4 RNA: 23S rRNA23SリボソームRNA RNA: 5S rRNA5SリボソームRNA タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17 リガンド: MAGNESIUM ION

全体

名称: 50S ribosomal subunit

Prokaryotic large ribosomal subunit

要素

複合体: 50S ribosomal subunitProkaryotic large ribosomal subunit
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
- RNA: 23S rRNA23SリボソームRNA
- RNA: 5S rRNA5SリボソームRNA
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32
- タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
リガンド: MAGNESIUM ION

+
超分子 #1: 50S ribosomal subunit

超分子	名称: 50S ribosomal subunit / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#29
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)

+
分子 #1: 50S ribosomal protein L19

分子	名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 13.104381 KDa
配列	文字列: TNHKLIEAVT KSQLRTDLPS FRPGDTLRVH VRIIEGTRER IQVFEGVVIK RRGGGVSETF TVRKISSGVG VERTFPLHTP KIEKIEVKR RGKVRRAKLY YLRSLRGKAA RIQEI

+
分子 #2: 50S ribosomal protein L4

分子	名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 22.364504 KDa
配列	文字列: ANYDVLKLDG TKSGSIELSD AVFGIEPNNS VLFEAINLQR ASLRQGTHAV KNRSAVSGGG RKPWKQKGTG RARQGTIRAP QWRGGGIVF GPTPRSYAYK MPKKMRRLAL RSALSFKAQE NGLTVVDAFN FEAPKTKEFK NVLSTLEQPK KVLVVTENED V NVELSARN ...文字列: ANYDVLKLDG TKSGSIELSD AVFGIEPNNS VLFEAINLQR ASLRQGTHAV KNRSAVSGGG RKPWKQKGTG RARQGTIRAP QWRGGGIVF GPTPRSYAYK MPKKMRRLAL RSALSFKAQE NGLTVVDAFN FEAPKTKEFK NVLSTLEQPK KVLVVTENED V NVELSARN IPGVQVTTAQ GLNVLDITNA DSLVITEAAA KKVEEVLG

+
分子 #5: 50S ribosomal protein L2

分子	名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 29.827607 KDa
組換発現	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列	文字列: AIKKYKPITN GRRNMTSLDF AEITKTTPEK SLLKPLPKKA GRNNQGKLTV RHHGGGHKRQ YRVIDFKRNK DGINAKVDSI QYDPNRSAN IALVVYADGE KRYIIAPKGL EVGQIVESGA EADIKVGNAL PLQNIPVGTV VHNIELKPGK GGQIARSAGA S AQVLGKEG ...文字列: AIKKYKPITN GRRNMTSLDF AEITKTTPEK SLLKPLPKKA GRNNQGKLTV RHHGGGHKRQ YRVIDFKRNK DGINAKVDSI QYDPNRSAN IALVVYADGE KRYIIAPKGL EVGQIVESGA EADIKVGNAL PLQNIPVGTV VHNIELKPGK GGQIARSAGA S AQVLGKEG KYVLIRLRSG EVRMILSTCR ATIGQVGNLQ HELVNVGKAG RSRWKGIRPT VRGSVMNPND HPHGGGEGRA PI GRPSPMS PWGKPTLGKK TRRGKKSSDK LIVRGRK

+
分子 #6: 50S ribosomal protein L6

分子	名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 19.501154 KDa
配列	文字列: SRVGKKIIDI PSDVTVTFDG NHVTVKGPKG ELSRTLNERM TFKQEENTIE VVRPSDSKED RTNHGTTRAL LNNMVQGVSQ GYVKVLELV GVGYRAQMQG KDLILNVGYS HPVEIKAEEN ITFSVEKNTV VKVEGISKEQ VGALASNIRS VRPPEPYKGK G IRYQGEYV RRKEGKT

+
分子 #7: 50S ribosomal protein L13

分子	名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 16.359427 KDa
配列	文字列: MRQTFMANES NIERKWYVID AEGQTLGRLS SEVASILRGK NKVTYTPHVD TGDYVIVINA SKIEFTGNKE TDKVYYRHSN HPGGIKSIT AGELRRTNPE RLIENSIKGM LPSTRLGEKQ GKKLFVYGGA EHPHAAQQPE NYELRG

+
分子 #8: 50S ribosomal protein L15

分子	名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 15.62889 KDa
配列	文字列: MKLHELKPAE GSRKERNRVG RGVATGNGKT SGRGHKGQKA RSGGGVRPGF EGGQLPLFRR LPKRGFTNIN RKEYAIVNLD QLNKFEDGT EVTPALLVES GVVKNEKSGI KILGNGSLDK KLTVKAHKFS ASAAEAIDAK GGAHEVI

+
分子 #9: 50S ribosomal protein L16

分子	名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 15.599435 KDa
組換発現	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列	文字列: MLLPKRVKYR RQHRPKTTGR SKGGNYVTFG EFGLQATTTS WITSRQIESA RIAMTRYMKR GGKVWIKIFP HTPYTKKPLE VRMGAGKGA VEGWIAVVKP GRILFEVAGV SEEVAREALR LASHKLPVKT KFVKREEL

+
分子 #10: 50S ribosomal protein L18

分子	名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 13.124093 KDa
配列	文字列: MISKIDKNKV RLKRHARVRT NLSGTAEKPR LNVYRSNKHI YAQIIDDNKG VTLAQASSKD SDIATTATKV ELATKVGEAI AKKAADKGI KEIVFDRGGY LYHGRVKALA EAARESGLEF

+
分子 #11: 50S ribosomal protein L20

分子	名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 13.459919 KDa
配列	文字列: PRVKGGTVTR ARRKKTIKLA KGYFGSKHTL YKVAKQQVMK SGQYAFRDRR QRKRDFRKLW ITRINAAARQ HEMSYSRLMN GLKKAGIDI NRKMLSEIAI SDEKAFAQLV TKAKDAL

+
分子 #12: 50S ribosomal protein L21

分子	名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 11.354081 KDa
配列	文字列: MFAIIETGGK QIKVEEGQEI FVEKLDVNEG DTFTFDKVLF VGGDSVKVGA PTVEGATVTA TVNKQGRGKK ITVFTYKRRK NSKRKKGHR QPYTKLTIDK INA

+
分子 #13: 50S ribosomal protein L23

分子	名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 10.3801 KDa
配列	文字列: EARDILKRPV ITEKSSEAMA EDKYTFDVDT RVNKTQVKMA VEEIFNVKVA SVNIMNYKPK KKRMGRYQGY TNKRRKAIVT LKEGSIDLF

+
分子 #14: 50S ribosomal protein L24

分子	名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 詳細: MHIKKGDNVKVIAGKDKGKEGKVIATLPKKDRVVVEGVNIMKKHQKPTQLNPEGGILETEAAIHVSNVQLLDPKTNEPTRVGYKFVDGKKVRIAKKSGEEIKSNN コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 11.447401 KDa
配列	文字列: MHIKKGDNVK VIAGKDKGKE GKVIATLPKK DRVVVEGVNI MKKHQKPTQL NPEGGILETE AAIHVSNVQL LDPKTNEPTR VGYKFVDGK KVRIAKKSGE EIKSN

+
分子 #15: 50S ribosomal protein L25

分子	名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 10.4622 KDa
配列	文字列: ASLKSIIRQG KQTRSDLKQL RKSGKVPAVV YGYGTKNVSV KVDEVEFIKV IREVGRNGVI ELGVGSKTIK VMVADYQFDP LKNQITHID FLAIN

+
分子 #16: 50S ribosomal protein L27

分子	名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 8.595688 KDa
配列	文字列: VSSTKNGRDS ESKRLGAKRA DGQFVTGGSI LYRQRGTKIY PGENVGRGGD DTLFAKIDGV VKFERKGRDK KQVSVYAVA

+
分子 #17: 50S ribosomal protein L29

分子	名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 7.845942 KDa
配列	文字列: KAKEIRDLTT SEIEEQIKSS KEELFNLRFQ LATGQLEETA RIRTVRKTIA RLKTVARERE IEQSKAN

+
分子 #18: 50S ribosomal protein L35

分子	名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 7.461992 KDa
配列	文字列: PKMKTHRGAA KRVKRTASGQ LKRSRAFTSH LFANKSTKQK RQLRKARLVS KSDMKRVKQL LAYK

+
分子 #19: 50S ribosomal protein L33

分子	名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 5.684561 KDa
配列	文字列: RVNVTLACTE CGDRNYITTK NKRNNPERIE MKKYCPRLNK YTLHRET

+
分子 #20: 50S ribosomal protein L34

分子	名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 5.252369 KDa
配列	文字列: VKRTYQPNKR KHSKVHGFRK RMSTKNGRKV LARRRRKGRK VLS

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L36

分子	名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 4.318422 KDa
配列	文字列: MKVRPSVKPI CEKCKVIKRK GKVMVICENP KHKQRQG

+
分子 #22: 50S ribosomal protein L3

分子	名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 23.199545 KDa
配列	文字列: TKGILGRKIG MTQVFGENGE LIPVTVVEAK ENVVLQKKTV EVDGYNAIQV GFEDKKAYKK DAKSNKYANK PAEGHAKKAD AAPKRFIRE FRNVDVDAYE VGQEVSVDTF VAGDVIDVTG VSKGKGFQGA IKRHGQSRGP MSHGSHFHRA PGSVGMASDA S RVFKGQKM ...文字列: TKGILGRKIG MTQVFGENGE LIPVTVVEAK ENVVLQKKTV EVDGYNAIQV GFEDKKAYKK DAKSNKYANK PAEGHAKKAD AAPKRFIRE FRNVDVDAYE VGQEVSVDTF VAGDVIDVTG VSKGKGFQGA IKRHGQSRGP MSHGSHFHRA PGSVGMASDA S RVFKGQKM PGRMGGNTVT VQNLEVVQVD TENKVILVKG NVPGPKKGLV EIRTSIK

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L5

分子	名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 17.651479 KDa
配列	文字列: KFNYSSVMEV PKIDKIVVNM GVGDAVQNSK VLDNAVEELE LITGQKPLVT KAKKSIATFR LREGMPIGAK VTLRGERMYE FLDKLISVS LPRVRDFQGV SKKAFDGRGN YTLGVKEQLI FPEIDYDKVS KVRGMDIVIV TTANTDEEAR ELLANFGMP

+
分子 #24: 50S ribosomal protein L14

分子	名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 13.157342 KDa
配列	文字列: MIQQETRLKV ADNSGAREVL TIKVLGGSGR KTANIGDVIV CTVKNATPGG VVKKGDVVKA VIVRTKSGVR RNDGSYIKFD ENACVIIRD DKGPRGTRIF GPVARELREG NFMKIVSLAP EVL

+
分子 #25: 50S ribosomal protein L22

分子	名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 12.328358 KDa
配列	文字列: MEAKAVARTI RIAPRKVRLV LDLIRGKNAA EAIAILKLTN KASSPVIEKV LMSALANAEH NYDMNTDELV VKEAYANEGP TLKRFRPRA QGRASAINKR TSHITIVVSD GKE

+
分子 #26: 50S ribosomal protein L28

分子	名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 5.499432 KDa
配列	文字列: ASTGNRRSHA LNSTKRRWNA NLQKVRILVD GKPKKVWVSA RALKSGKVT

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L30

分子	名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 6.434487 KDa
配列	文字列: AKLQITLTRS VIGRPETQRK TVEALGLKKT NSSVVVEDNP AIRGQINKVK HLVTVEEK

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L32

分子	名称: 50S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 5.569565 KDa
配列	文字列: AVPKRRTSKT RKNKRRTHFK ISVPGMTECP NCGEYKLSHR VCKNCGSY

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L17

分子	名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 13.583523 KDa
配列	文字列: YRKLGRTSDQ RKAMLRDLAT SLIISERIET TEARAKEVRS VVEKLITLGK KGDLASRRNA AKTLRNVEIL NEDETTQTAL QKLFGEIAE RYTERQGGYT RILKQGPRRG DGAESVIIEL V

+
分子 #3: 23S rRNA

分子	名称: 23S rRNA / タイプ: rna / ID: 3 詳細: ...詳細: GAUUAAGUUAUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCCGAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGGAGCUGUAAGCUUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGCAUGAGUUAUGUCAUGUUAUCGAUAUGUGAAUACAUAGCAUAUCAGAAGGCACACCCGGAGAACUGAAACAUCUUAGUACCCGGAGGAAGAGAAAGAAAAUUCGAUUCCCUUAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAACAAGCUUGCUUGUUGGGGUUGUAGGACACUCUGUACGGAGUUACAAAGGACGACAUUAGACGAAUCAUCUGGAAAGAUGAAUCAAAGAAGGUAAUAAUCCUGUAGUCGAAAAUGUUGUCUCUCUUGAGUGGAUCCUGAGUACGACGGAGCACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCUGGGAGGACCAUCUCCUAAGGCUAAAUACUCUCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCGUGUGCUUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUUUGAUGCAAGGUUAAGCAGUAAAUGUGGAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUUAGUAUUUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCUUGGUCAGGUUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGACCGAACCGACUUACGUUGAAAAGUGAGCGGAUGAACUGAGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGUGAUGAUUAUUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACGAGGGGCCCCUCUCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCAAUUAAUUUAACUUGGGAGUCAGAACAUGGGUGAUAAGGUCCGUGUUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGCUAAGGUCCCAAAAUAUAUGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGCGUUGCCCAGACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACACUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAGCUGUGGAUUGUCCUUUGGACAAUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGUUGAAGCAUGAUCGUAAGGACAUGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAAAGACGGGUGAGAAUCCCGUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCUGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUAUAAUCGUUUUAAUCGAUGGGGGGACGCAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCGAUUGGAUUGCACGUCUAAGCAGUAAGGCUGAGUAUUAGGCAAAUCCGGUACUCGUUAAGGCUGAGCUGUGAUGGGGAGAAGACAUUGAGUCUUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGCCGAGAAAAGCCUCUAGAUAGAAAAUAGGUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAUUCUAAGGUGAGCGAGCGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUAACGCCCAGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUCAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGUAGCCUGAUAUUGAAAUUCGGCACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUUGAAACGUGAGCGCUAGCUUACGUGGAGGCGCUGGUGGGAUACUACCCUAGCUGUGUUGGCUUUCUAACCCGCACCACUUAUCGUGGUGGGAGACAGUGUCAAGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCUCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCAUAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGACUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGUGGGCGUAGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUGUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGAGGUGGAAGCAUGGUGACAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCGAAGACUUAAUCAA コピー数: 1
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 946.738688 KDa
配列	文字列: GAUUAAGUUA UUAAGGGCGC ACGGUGGAUG CCUUGGCACU AGAAGCCGAU GAAGGACGUU ACUAACGACG AUAUGCUUUG GGGAGCUGU AAGUAAGCUU UGAUCCAGAG AUUUCCGAAU GGGGAAACCC AGCAUGAGUU AUGUCAUGUU AUCGAUAUGU G AAUACAUA ...文字列: GAUUAAGUUA UUAAGGGCGC ACGGUGGAUG CCUUGGCACU AGAAGCCGAU GAAGGACGUU ACUAACGACG AUAUGCUUUG GGGAGCUGU AAGUAAGCUU UGAUCCAGAG AUUUCCGAAU GGGGAAACCC AGCAUGAGUU AUGUCAUGUU AUCGAUAUGU G AAUACAUA GCAUAUCAGA AGGCACACCC GGAGAACUGA AACAUCUUAG UACCCGGAGG AAGAGAAAGA AAAUUCGAUU CC CUUAGUA GCGGCGAGCG AAACGGGAAG AGCCCAAACC AACAAGCUUG CUUGUUGGGG UUGUAGGACA CUCUAUACGG AGU UACAAA GGACGACAUU AGACGAAUCA UCUGGAAAGA UGAAUCAAAG AAGGUAAUAA UCCUGUAGUC GAAAAUGUUG UCUC UCUUG AGUGGAUCCU GAGUACGACG GAGCACGUGA AAUUCCGUCG GAAUCUGGGA GGACCAUCUC CUAAGGCUAA AUACU CUCU AGUGACCGAU AGUGAACCAG UACCGUGAGG GAAAGGUGAA AAGCACCCCG GAAGGGGAGU GAAAUAGAAC CUGAAA CCG UGUGCUUACA AGUAGUCAGA GCCCGUUAAU GGGUGAUGGC GUGCCUUUUG UAGAAUGAAC CGGCGAGUUA CGAUUUG AU GCAAGGUUAA GCAGUAAAUG UGGAGCCGUA GCGAAAGCGA GUCUGAAUAG GGCGUUUAGU AUUUGGUCGU AGACCCGA A ACCAGGUGAU CUACCCUUGG UCAGGUUGAA GUUCAGGUAA CACUGAAUGG AGGACCGAAC CGACUUACGU (5MU)GAAA AGUG AGCGGAUGAA CUGAGGGUAG CGGAGAAAUU CCAAUCGAAC CUGGAGAUAG CUGGUUCUCU CCGAAAUAGC UUUAGG GCU AGCCUCAAGU GAUGAUUAUU GGAGGUAGAG CACUGUUUGG ACGAGGGGCC CCUCUCGGGU UACCGAAUUC AGACAAA CU CCGAAUGCCA AUUAAUUUAA CUUGGGAGUC AGAACAUGGG UGAUAAGGUC CGUGUUCGAA AGGGAAACAG CCCAGACC A CCAGCUAAGG UCCCAAAAUA UAUGUUAAGU GGAAAAGGAU GUGGCGUUGC CCAGACAACU AGGAUGUUGG CUUAGAAGC AGCCAUCAUU UAAAGAGUGC GUAAUAGCUC ACUAGUCGAG UGACACUGCG CCGAAAAUGU ACCGGGGCUA AACAUAUUAC CGAAGCUGU GGAUUGUCCU UUGGACAAUG GUAGGAGAGC GUUCUAAGGG CGUUGAAGCA UGAUCGUAAG GACAUGUGGA G CGCUUAGA AGUGAGAAUG CCGGUGUGAG UAGCGAAAGA CGGGUGAGAA UCCCGUCCAC CGAUUGACUA AGGUUUCCAG AG GAAGGCU CGUCCGCUCU GGGUUAGUCG GGUCCUAAGC UGAGGCCGAC AGGCGUAGGC GAUGGAUAAC AGGUUGAUAU UCC UGUACC ACCUAUAAUC GUUUUAAUCG AUGGGGGGAC GCAGUAGGAU AGGCGAAGCG UGCGAUUGGA UUGCACGUCU AAGC AGUAA GGCUGAGUAU UAGGCAAAUC CGGUACUCGU UAAGGCUGAG CUGUGAUGGG GAGAAGACAU UGUGUCUUCG AGUCG UUGA UUUCACACUG CCGAGAAAAG CCUCUAGAUA GAAAAUAGGU GCCCGUACCG CAAACCGACA CAGGUAGUCA AGAUGA GAA UUCUAAGGUG AGCGAGCGAA CUCUCGUUAA GGAACUCGGC AAAAUGACCC CGUAACUUCG GGAGAAGGGG UGCUCUU UA GGGUUAACGC CCAGAAGAGC CGCAGUGAAU AGGCCCAAGC GACUGUUUAU CAAAAACACA GGUCUCUGCU AAACCGUA A GGUGAUGUAU AGGGGCUGAC GCCUGCCCGG UGCUGGAAGG UUAAGAGGAG UGGUUAGCUU CUGCGAAGCU ACGAAUCGA AGCCCCAGUA AACGGCGGCC GUAACUAUAA CGGUCCUAAG GUAGCGAAA(5MU) UCCUUGUCGG GUAAGUUCCG ACCCGC ACG AAAGGCGUAA CGAUUUGGGC ACUGUCUCAA CGAGAGACUC GGUGAAAUCA UAGUACCUGU GAAGAUGCAG GUUACCC GC GACAGGACGG AAAGACCCCG UGGAGCUUUA CUGUAGCCUG AUAUUGAAAU UCGGCACAGC UUGUACAGGA UAGGUAGG A GCCUUUGAAA CGUGAGCGCU AGCUUACGUG GAGGCGCUGG UGGGAUACUA CCCUAGCUGU GUUGGCUUUC UAACCCGCA CCACUUAUCG UGGUGGGAGA CAGUGUCAGG CGGGCAGUUU GACUGGGGCG GUCGCCUCCU AAAAGGUAAC GGAGGCGCUC AAAGGUUCC CUCAGAAUGG UUGGAAAUCA UUCAUAGAGU GUAAAGGCAU AAGGGAGCUU GACUGCGAGA CCUACAAGUC G AGCAGGGU CGAAAGACGG ACUUAGUGAU CCGGUGGUUC CGCAUGGAAG GGCCAUCGCU CAACGGAUAA AAGCUACCCC GG GGAUAAC AGGCUUAUCU CCCCCAAGAG UUCACAUCGA CGGGGAGGUU UGGCACCUCG (2MA)UGUCGGCUC AUCGCAUCC UGGGGCUGUA GUCGGUCCCA AGGGUUGGGC UGUUCGCCCA UUAAAGCGGU ACGCGAGCUG GGUUCAGAAC GUCGUGAGAC AGUUCGGUC CCUAUCCGUC GUGGGCGUAG GAAAUUUGAG AGGAGCUGUC CUUAGUACGA GAGGACCGGG AUGGACAUAC C UCUGGUGU ACCAGUUGUC GUGCCAACGG CAUAGCUGGG UAGCUAUGUG UGGACGGGAU AAGUGCUGAA AGCAUCUAAG CA UGAAGCC CCCCUCAAGA UGAGAUUUCC CAACUUCGGU UAUAAGAUCC CUCAAAGAUG AUGAGGUUAA UAGGUUCGAG GUG GAAGCA UGGUGACAUG UGGAGCUGAC GAAUACUAAU CGAUCGAAGA CUUAAUCAA

+
分子 #4: 5S rRNA

分子	名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)	生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量	理論値: 36.974945 KDa
配列	文字列: UCUGGUGACU AUAGCAAGGA GGUCACACCU GUUCCCAUGC CGAACACAGA AGUUAAGCUC CUUAGCGUCG AUGGUAGUCG AACUUACGU UCCGCUAGAG UAGAACGUUG CCAGGC

+
分子 #30: MAGNESIUM ION

分子	名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 30 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量	理論値: 24.305 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法	クライオ電子顕微鏡法
解析	単粒子再構成法
試料の集合状態	particle

-
試料調製

緩衝液	pH: 7.6
グリッド	モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 200
凍結	凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡	FEI TITAN KRIOS
電子線	加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系	照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影	フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 47.0 e/Å²
実験機器	モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期角度割当	タイプ: NOT APPLICABLE
最終角度割当	タイプ: NOT APPLICABLE
最終再構成	解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.48 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 198422

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万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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-添付データ

-追加マップ: #1

-試料の構成要素

+全体 : 50S ribosomal subunit

+超分子 #1: 50S ribosomal subunit

+分子 #1: 50S ribosomal protein L19

+分子 #2: 50S ribosomal protein L4

+分子 #5: 50S ribosomal protein L2

+分子 #6: 50S ribosomal protein L6

+分子 #7: 50S ribosomal protein L13

+分子 #8: 50S ribosomal protein L15

+分子 #9: 50S ribosomal protein L16

+分子 #10: 50S ribosomal protein L18

+分子 #11: 50S ribosomal protein L20

+分子 #12: 50S ribosomal protein L21

+分子 #13: 50S ribosomal protein L23

+分子 #14: 50S ribosomal protein L24

+分子 #15: 50S ribosomal protein L25

+分子 #16: 50S ribosomal protein L27

+分子 #17: 50S ribosomal protein L29

+分子 #18: 50S ribosomal protein L35

+分子 #19: 50S ribosomal protein L33

+分子 #20: 50S ribosomal protein L34

+分子 #21: 50S ribosomal protein L36

+分子 #22: 50S ribosomal protein L3

+分子 #23: 50S ribosomal protein L5

+分子 #24: 50S ribosomal protein L14

+分子 #25: 50S ribosomal protein L22

+分子 #26: 50S ribosomal protein L28

+分子 #27: 50S ribosomal protein L30

+分子 #28: 50S ribosomal protein L32

+分子 #29: 50S ribosomal protein L17

+分子 #3: 23S rRNA

+分子 #4: 5S rRNA

+分子 #30: MAGNESIUM ION

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