登録情報 | データベース: PDB / ID: 7qf9 |
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タイトル | Crystal structure of PDE6D bound to HRas peptide |
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要素 | - HRas peptide
- Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta
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キーワード | TRANSPORT PROTEIN / complex / trafficking |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
ARL13B-mediated ciliary trafficking of INPP5E / GTPase inhibitor activity / response to stimulus / visual perception / cytoplasmic vesicle membrane / small GTPase binding / cilium / RAS processing / cytoplasmic vesicle / cytoskeleton ...ARL13B-mediated ciliary trafficking of INPP5E / GTPase inhibitor activity / response to stimulus / visual perception / cytoplasmic vesicle membrane / small GTPase binding / cilium / RAS processing / cytoplasmic vesicle / cytoskeleton / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3', 5'-cyclic phosphodiesterase, delta subunit / GMP phosphodiesterase, delta subunit / GMP phosphodiesterase, delta subunit superfamily / GMP-PDE, delta subunit / Immunoglobulin E-set類似検索 - ドメイン・相同性 O-METHYLCYSTEINE / FARNESYL / Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.95 Å |
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データ登録者 | Yelland, T. / Ismail, I. |
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資金援助 | 英国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Cancer Research UK | | 英国 |
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引用 | ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2022 タイトル: Stabilization of the RAS:PDE6D Complex Is a Novel Strategy to Inhibit RAS Signaling. 著者: Yelland, T. / Garcia, E. / Parry, C. / Kowalczyk, D. / Wojnowska, M. / Gohlke, A. / Zalar, M. / Cameron, K. / Goodwin, G. / Yu, Q. / Zhu, P.C. / ElMaghloob, Y. / Pugliese, A. / Archibald, L. ...著者: Yelland, T. / Garcia, E. / Parry, C. / Kowalczyk, D. / Wojnowska, M. / Gohlke, A. / Zalar, M. / Cameron, K. / Goodwin, G. / Yu, Q. / Zhu, P.C. / ElMaghloob, Y. / Pugliese, A. / Archibald, L. / Jamieson, A. / Chen, Y.X. / McArthur, D. / Bower, J. / Ismail, S. |
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履歴 | 登録 | 2021年12月5日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2022年2月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2022年6月1日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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改定 2.0 | 2022年12月7日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Polymer sequence / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: atom_site / atom_type ...atom_site / atom_type / entity / entity_poly / entity_poly_seq / pdbx_entity_src_syn / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.label_seq_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _atom_type.pdbx_N_electrons / _atom_type.pdbx_scat_Z / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity_poly.nstd_monomer / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq.db_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end / _struct_ref_seq.seq_align_end |
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改定 2.1 | 2024年1月31日 | Group: Data collection / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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