PDB-7lom: Ornithine Aminotransferase (OAT) soaked with its inactivator - (1...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7lom

タイトル

Ornithine Aminotransferase (OAT) soaked with its inactivator - (1S,3S)-3-amino-4-(difluoromethylene)cyclohexene-1-carboxylic acid

要素

Ornithine aminotransferase, mitochondrial

キーワード

TRANSFERASE/Inactivator / Ornithine Aminotransferase / OAT / aminotransferase / inactivator / inhibitor / TRANSFERASE / TRANSFERASE-Inactivator complex

機能・相同性

機能・相同性情報

L-arginine catabolic process to proline via ornithine / ornithine aminotransferase activity / ornithine aminotransferase / L-arginine catabolic process to L-glutamate / L-proline biosynthetic process / Glutamate and glutamine metabolism / visual perception / pyridoxal phosphate binding / mitochondrial matrix / mitochondrion ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.1 Å

データ登録者

Butrin, A. / Zhu, W. / Liu, D. / Silverman, R.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2021
タイトル: Remarkable and Unexpected Mechanism for ( S )-3-Amino-4-(difluoromethylenyl)cyclohex-1-ene-1-carboxylic Acid as a Selective Inactivator of Human Ornithine Aminotransferase.
著者: Zhu, W. / Doubleday, P.F. / Butrin, A. / Weerawarna, P.M. / Melani, R.D. / Catlin, D.S. / Dwight, T.A. / Liu, D. / Kelleher, N.L. / Silverman, R.B.

履歴

登録	2021年2月10日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2021年8月25日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年10月18日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
改定 1.2	2024年12月25日	Group: Advisory / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: database_PDB_caveat / pdbx_entry_details ...database_PDB_caveat / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_symm_contact / struct_conn Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7lom.cif.gz	491.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7lom.ent.gz	407.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7lom.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	7lom_validation.pdf.gz	1.4 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	7lom_full_validation.pdf.gz	1.5 MB	表示
XML形式データ	7lom_validation.xml.gz	56.3 KB	表示
CIF形式データ	7lom_validation.cif.gz	74.1 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lo/7lom ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/lo/7lom	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	7lnmC 7lonC 1oatS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	2can-1 7lnm-2 1oat-1 6v8c-1 6oia-2 2byj-1 2byl-2 7nnc-1 1gbn-3 6hx7-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Ornithine aminotransferase, mitochondrial

B: Ornithine aminotransferase, mitochondrial

C: Ornithine aminotransferase, mitochondrial

ヘテロ分子

136 kDa, 3 ポリマー
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1

A: Ornithine aminotransferase, mitochondrial

ヘテロ分子

A: Ornithine aminotransferase, mitochondrial

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
90.7 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Ornithine aminotransferase, mitochondrial

ヘテロ分子

C: Ornithine aminotransferase, mitochondrial

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
90.7 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	115.610, 115.610, 186.570
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	154
Space group name H-M	P3₂21

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	A-670- HOH
2	1	A-757- HOH
3	1	C-772- HOH

#1: タンパク質	Ornithine aminotransferase, mitochondrial / Ornithine delta-aminotransferase / Ornithine--oxo-acid aminotransferase 分子量: 44860.320 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: OAT / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P04181, ornithine aminotransferase
#2: 化合物	ChemComp-THR / THREONINE / トレオニンタイプ: L-peptide linking / 分子量: 119.119 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₉NO₃
#3: 化合物	ChemComp-Y8P / (3~{S},4~{S})-4-methyl-3-[[2-methyl-3-oxidanyl-5-(phosphonooxymethyl)pyridin-4-yl]methylamino]cyclohexene-1-carboxylic acid 分子量: 388.353 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₆H₂₅N₂O₇P
#4: 化合物	ChemComp-YCD / (4~{R})-4-(fluoranylmethyl)-3-[[2-methyl-3-oxidanyl-5-(phosphonooxymethyl)pyridin-4-yl]methylamino]cyclohexene-1-carboxylic acid 分子量: 400.295 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₆H₁₈FN₂O₇P
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 470 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.66 Å³/Da / 溶媒含有率: 53.79 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: The holoenzyme crystals were first grown via a hanging drop vapor diffusion method. Each drop contained 2 uL of protein and 2 uL of well solution. The best crystallization condition contained ...詳細: The holoenzyme crystals were first grown via a hanging drop vapor diffusion method. Each drop contained 2 uL of protein and 2 uL of well solution. The best crystallization condition contained 8% PEG 6000, 100 mM NaCl, 5% glycerol, and 50 mM Tricine pH 7.8. Once the holoenzyme crystals reached their maximum size within five days, 1 uL of 10 mM 181 was added to the drop with crystals. Within the first three minutes of 181 addition, the hOAT crystals turned their color from yellow to transparent. The crystals were soaked for 44 minutes, transferred into cryoprotective solution (well solution supplemented with 30% glycerol), and then flash-frozen in liquid nitrogen.

結晶

マシュー密度: 2.66 Å³/Da / 溶媒含有率: 53.79 %

結晶化

温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法
詳細: The holoenzyme crystals were first grown via a hanging drop vapor diffusion method. Each drop contained 2 uL of protein and 2 uL of well solution. The best crystallization condition contained ...

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 21-ID-D / 波長: 1.1271 Å

検出器

タイプ: DECTRIS EIGER X 9M / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年9月19日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.1271 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.1→44.11 Å / Num. obs: 83376 / % possible obs: 98.4 % / 冗長度: 7 % / B_iso Wilson estimate: 34.37 Å² / R_pim(I) all: 0.065 / R_rim(I) all: 0.175 / Net I/σ(I): 7.3 / Num. measured all: 579510

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	Mean I/σ(I) obs	Num. measured all	Num. unique obs	R_pim(I) all	R_rim(I) all	% possible all
2.1-2.14	7.1	0.9	29842	4194	0.825	2.235	99.8
5.7-44.12	7.3	22.8	31303	4278	0.025	0.071	94.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.17.1_3660	精密化
xia2		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
xia2		データ削減
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1OAT

1oat

解像度: 2.1→44.11 Å / SU ML: 0.26 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 25.36 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.235	4098	4.92 %
R_work	0.2	-	-
obs	0.201	83345	98.4 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 52.21 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.1→44.11 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9450	0	100	470	10020

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.1-2.12	0.3491	132	0.3357	2771	X-RAY DIFFRACTION	100
2.12-2.15	0.3186	159	0.3177	2693	X-RAY DIFFRACTION	100
2.15-2.18	0.3402	132	0.3088	2750	X-RAY DIFFRACTION	100
2.18-2.21	0.3215	130	0.2979	2742	X-RAY DIFFRACTION	99
2.21-2.24	0.3171	127	0.292	2753	X-RAY DIFFRACTION	99
2.24-2.27	0.314	151	0.2882	2726	X-RAY DIFFRACTION	100
2.27-2.3	0.3051	171	0.2777	2724	X-RAY DIFFRACTION	99
2.3-2.34	0.2959	131	0.2787	2703	X-RAY DIFFRACTION	99
2.34-2.38	0.2667	125	0.2602	2759	X-RAY DIFFRACTION	100
2.38-2.42	0.3025	138	0.2592	2739	X-RAY DIFFRACTION	99
2.42-2.46	0.2674	138	0.2504	2742	X-RAY DIFFRACTION	99
2.46-2.51	0.2928	165	0.2388	2718	X-RAY DIFFRACTION	99
2.51-2.56	0.2841	158	0.2405	2713	X-RAY DIFFRACTION	99
2.56-2.62	0.2766	148	0.2419	2702	X-RAY DIFFRACTION	99
2.62-2.68	0.2466	153	0.2347	2742	X-RAY DIFFRACTION	99
2.68-2.74	0.282	147	0.2187	2710	X-RAY DIFFRACTION	99
2.74-2.82	0.2587	144	0.2139	2734	X-RAY DIFFRACTION	99
2.82-2.9	0.27	128	0.2154	2721	X-RAY DIFFRACTION	99
2.9-2.99	0.2576	123	0.2182	2742	X-RAY DIFFRACTION	99
2.99-3.1	0.2531	158	0.2138	2727	X-RAY DIFFRACTION	98
3.1-3.23	0.2271	137	0.2032	2766	X-RAY DIFFRACTION	98
3.23-3.37	0.2572	137	0.1992	2712	X-RAY DIFFRACTION	98
3.37-3.55	0.2154	111	0.1892	2737	X-RAY DIFFRACTION	98
3.55-3.77	0.1902	97	0.1749	2761	X-RAY DIFFRACTION	97
3.77-4.06	0.2287	136	0.1588	2721	X-RAY DIFFRACTION	97
4.06-4.47	0.1932	166	0.1547	2701	X-RAY DIFFRACTION	97
4.47-5.12	0.1822	173	0.1559	2672	X-RAY DIFFRACTION	96
5.12-6.45	0.2395	122	0.1829	2779	X-RAY DIFFRACTION	96
6.45-44.11	0.1834	161	0.1585	2787	X-RAY DIFFRACTION	94

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.0138	0.0379	0.0461	0.257	0.3728	0.5967	0.1135	1.0044	-0.027	-0.2191	0.2259	0.4321	-0.3879	-0.4739	-0.2891	0.3642	0.0517	-0.0763	0.8207	0.2027	1.0195	-6.9524	-13.1446	-50.137
2	1.7343	0.512	-0.3863	0.6286	0.035	1.3526	0.1915	0.1635	0.5351	0.0961	0.0493	0.3783	-0.56	-0.542	-0.1926	0.4795	0.1347	0.1402	0.4681	0.1381	1.1654	-7.7291	-3.6626	-30.5824
3	1.1111	0.5346	-0.478	0.5837	-0.1219	1.1061	0.0913	-0.0336	0.1517	0.0898	-0.0395	0.17	-0.0972	-0.0741	-0.0425	0.2461	-0.0684	0.0636	0.3279	-0.0187	0.5108	8.0004	-24.5853	-21.4841
4	1.376	-0.4398	0.5105	2.3343	-0.4338	1.3611	0.0643	-0.0021	0.3044	0.1904	0.0035	0.4231	-0.1086	-0.2535	-0.0716	0.2795	-0.0688	0.1143	0.39	-0.0297	0.5898	-1.7564	-26.448	-15.2802
5	3.4721	-0.1075	0.3737	1.1844	-0.4036	1.8806	0.191	-0.0636	0.1637	0.1842	0.0418	0.5403	-0.1322	-0.4632	-0.1562	0.2524	-0.0084	0.1124	0.3833	0.0376	0.7654	-8.1381	-17.343	-23.7105
6	0.6001	0.2779	0.6407	0.3302	0.0296	1.014	-0.0263	0.2707	0.13	-0.0541	0.216	0.7156	-0.1362	-0.8175	0.2776	-0.0296	0.0054	0.0689	1.028	0.2793	1.1748	-21.9813	-20.0202	-34.8944
7	1.8788	-0.6224	-0.7965	0.2347	0.2591	0.3593	0.0466	0.4702	0.4159	-0.4756	-0.0474	0.0035	-0.2762	0.4444	-0.1373	0.5899	-0.077	-0.01	0.5753	0.1108	0.6973	3.0445	-43.1139	-97.2476
8	2.0881	0.2105	-0.0009	1.6068	0.0865	4.2201	0.0746	-0.0979	0.4316	-0.2412	-0.0609	-0.4221	-0.4644	0.7348	-0.1245	0.5706	-0.2859	0.056	0.6676	-0.0048	0.6262	16.0434	-40.7689	-85.9445
9	2.0955	0.6917	-0.263	2.898	0.6574	2.1184	-0.0463	-0.1419	-0.0007	0.2283	0.1442	-0.17	-0.4952	0.7069	-0.1291	0.3217	-0.1205	-0.0442	0.7583	0.039	0.4423	16.6552	-56.035	-80.2091
10	0.515	0.1958	-0.4892	1.1196	0.0932	1.6081	0.0159	-0.1165	-0.189	-0.003	-0.0054	-0.046	-0.0248	0.321	-0.0078	0.2121	0.0513	-0.0543	0.4826	0.0421	0.3507	-1.9008	-66.9961	-71.7501
11	1.0915	0.207	-0.3932	1.4972	-0.2533	2.0994	0.1153	-0.0902	0.1299	0.1079	-0.0119	0.2452	-0.3264	-0.0408	-0.0786	0.3291	0.0391	0.0023	0.3777	-0.019	0.3824	-12.1962	-53.3858	-65.87
12	1.3094	-0.2416	-0.1058	1.336	-0.2464	1.5875	0.1212	-0.2072	-0.1904	0.0859	-0.0538	-0.2686	-0.0522	0.5596	-0.069	0.2297	-0.0161	-0.0468	0.5338	0.009	0.3428	5.6238	-60.6237	-70.1775
13	2.6128	1.7903	-0.6574	4.4416	0.4331	3.2843	0.1636	-0.4106	1.0892	0.669	0.1775	0.2432	-0.8596	0.5693	-0.1321	0.7217	-0.288	0.0919	0.5675	-0.1093	0.674	7.09	-35.2214	-66.3178
14	0.8462	-1.1252	1.3005	5.5537	-1.0398	5.8346	0.1179	-0.2479	0.8167	-0.2531	0.2752	0.5021	-1.2748	0.114	-0.2035	0.8731	-0.0963	0.0243	0.4806	0.0357	0.9379	0.6492	-28.1465	-82.2089
15	2.333	-2.3277	1.5457	5.768	-1.4356	5.0268	0.0479	-0.213	0.7986	0.1551	-0.0262	-0.349	-1.0001	0.3056	-0.0446	0.5826	-0.2946	0.0852	0.6222	-0.1067	0.7553	9.8177	-34.2023	-75.4471
16	0.0409	0.0199	0.0154	0.1307	0.0204	0.0075	-0.0006	-0.4484	-0.0719	0.0268	-0.0277	0.358	0.4811	-0.4162	0.0021	0.4512	-0.19	0.1275	0.5281	0.034	0.6381	-16.4871	-67.7967	-9.9132
17	1.4383	-0.6438	0.4203	0.7341	0.0538	1.1402	0.1847	-0.2822	-0.1653	0.0208	-0.0974	0.4384	0.2477	-0.3282	-0.0248	0.5071	-0.2594	0.0093	0.4752	0.0257	0.6505	-15.0044	-75.335	-28.3855
18	1.1045	0.2679	0.0691	2.0893	0.0525	2.0545	-0.0211	0.06	-0.1555	-0.0203	-0.068	-0.2173	0.4316	0.1428	0.0577	0.3215	-0.0423	0.0484	0.3433	0.0047	0.3682	11.693	-66.1183	-30.8485
19	0.0203	-0.028	0.2077	1.26	-0.4729	1.9848	0.0256	0.0068	0.0892	0.036	0.0567	-0.0111	-0.0203	-0.1859	0.0675	0.2299	-0.0942	0.0089	0.2864	0.0173	0.3713	5.198	-47.1245	-25.483
20	3.5963	0.3877	0.4272	2.2097	-0.111	1.1143	-0.1507	0.175	-0.0692	-0.2363	0.0518	0.0299	-0.0059	0.024	0.0484	0.3561	-0.1115	-0.0033	0.3442	0.0213	0.3814	5.4131	-50.566	-37.9604
21	2.6786	0.2427	0.69	2.3681	-0.4357	1.2359	-0.0263	0.3513	-0.0354	-0.2399	0.0475	0.0927	-0.0818	-0.1075	-0.0271	0.3686	-0.1224	0.0009	0.3374	-0.0221	0.3261	-0.4414	-62.5193	-39.7791
22	2.2288	0.0328	-0.0162	1.9983	-0.2697	1.0588	0.0435	0.1404	-0.1883	-0.224	0.0369	0.1479	0.3392	-0.1322	-0.0469	0.4065	-0.1347	0.0329	0.3419	-0.0092	0.2988	-0.7684	-68.7168	-35.6576
23	2.3068	0.8456	1.0605	2.681	-0.5397	1.9698	0.1161	-0.2419	0.6185	0.5298	-0.1474	0.8264	-0.1292	-0.5747	-0.0703	0.3787	-0.0952	0.1067	0.561	-0.0043	1.0318	-21.3303	-49.7186	-30.8447
24	2.2698	-1.9827	-2.4927	2.3373	1.2039	5.3655	0.0682	0.0282	0.1639	-0.012	0.0194	0.4369	-0.1311	-0.3235	-0.0967	0.3103	-0.1964	0.0179	0.5463	0.0725	0.6957	-23.5061	-60.4373	-29.8966

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	CHAIN 'A' AND (RESID 37 THROUGH 61 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	CHAIN 'A' AND (RESID 62 THROUGH 117 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	CHAIN 'A' AND (RESID 118 THROUGH 220 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	CHAIN 'A' AND (RESID 221 THROUGH 290 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	CHAIN 'A' AND (RESID 291 THROUGH 389 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	CHAIN 'A' AND (RESID 390 THROUGH 439 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	CHAIN 'B' AND (RESID 37 THROUGH 61 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	CHAIN 'B' AND (RESID 62 THROUGH 82 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	CHAIN 'B' AND (RESID 83 THROUGH 106 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	CHAIN 'B' AND (RESID 107 THROUGH 181 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	CHAIN 'B' AND (RESID 182 THROUGH 263 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	CHAIN 'B' AND (RESID 264 THROUGH 344 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	CHAIN 'B' AND (RESID 345 THROUGH 381 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	CHAIN 'B' AND (RESID 382 THROUGH 400 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	CHAIN 'B' AND (RESID 401 THROUGH 439 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	CHAIN 'C' AND (RESID 37 THROUGH 61 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	CHAIN 'C' AND (RESID 62 THROUGH 105 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	CHAIN 'C' AND (RESID 106 THROUGH 181 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	CHAIN 'C' AND (RESID 182 THROUGH 220 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	CHAIN 'C' AND (RESID 221 THROUGH 263 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	CHAIN 'C' AND (RESID 264 THROUGH 295 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	CHAIN 'C' AND (RESID 296 THROUGH 362 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	CHAIN 'C' AND (RESID 363 THROUGH 389 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	CHAIN 'C' AND (RESID 390 THROUGH 439 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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