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- PDB-7l7r: CCHFV Gc prefusion monomer bound to ADI-36121 and ADI-37801 Fabs -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7l7r
タイトルCCHFV Gc prefusion monomer bound to ADI-36121 and ADI-37801 Fabs
要素
  • (ADI-36121 Fab ...) x 2
  • (ADI-37801 Fab ...) x 2
  • Glycoprotein C
キーワードVIRAL PROTEIN / fusion protein / antibody / Fab complex / class II fusion
機能・相同性
機能・相同性情報


host cell Golgi membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell endoplasmic reticulum membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / virion membrane / membrane
類似検索 - 分子機能
Nairovirus M polyprotein-like / : / : / : / : / Nairovirus GP38 / Nairovirus, structural glycoprotein Gn / Nairovirus, mucin-like domain / Nairovirus NSm / Hantavirus glycoprotein Gc ...Nairovirus M polyprotein-like / : / : / : / : / Nairovirus GP38 / Nairovirus, structural glycoprotein Gn / Nairovirus, mucin-like domain / Nairovirus NSm / Hantavirus glycoprotein Gc / : / Hantavirus glycoprotein Gc, N-terminal / Hantavirus glycoprotein Gc, C-terminal / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Envelopment polyprotein
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (ウイルス)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.1 Å
データ登録者Mishra, A.K. / McLellan, J.S.
資金援助 米国, 1件
組織認可番号国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)U19 AI142777 米国
引用ジャーナル: Science / 年: 2022
タイトル: Structural basis of synergistic neutralization of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus by human antibodies.
著者: Mishra, A.K. / Hellert, J. / Freitas, N. / Guardado-Calvo, P. / Haouz, A. / Fels, J.M. / Maurer, D.P. / Abelson, D.M. / Bornholdt, Z.A. / Walker, L.M. / Chandran, K. / Cosset, F.L. / McLellan, J.S. / Rey, F.A.
履歴
登録2020年12月30日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02021年12月1日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12022年1月19日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID
改定 1.22023年10月18日Group: Data collection / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
改定 1.32024年11月13日Group: Structure summary
カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature
Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: ADI-36121 Fab light chain
B: ADI-36121 Fab heavy chain
C: ADI-37801 Fab light chain
D: ADI-37801 Fab heavy chain
G: Glycoprotein C
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)158,0776
ポリマ－157,4915
非ポリマー5871
水7,134396
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: gel filtration
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
単位格子
Length a, b, c (Å)60.200, 95.179, 323.000
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number19
Space group name H-MP212121

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要素

-
抗体 , 4種, 4分子 ABCD

#1: 抗体 ADI-36121 Fab light chain


分子量: 23416.941 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#2: 抗体 ADI-36121 Fab heavy chain


分子量: 24663.793 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#3: 抗体 ADI-37801 Fab light chain


分子量: 23473.098 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#4: 抗体 ADI-37801 Fab heavy chain


分子量: 25039.004 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)

-
タンパク質 / 糖 / 非ポリマー , 3種, 398分子 G

#5: タンパク質 Glycoprotein C


分子量: 60898.074 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (strain Nigeria/IbAr10200/1970) (ウイルス)
株: Nigeria/IbAr10200/1970 / 遺伝子: GP / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8JSZ3
#6: 多糖 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta- ...beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose


タイプ: oligosaccharide / 分子量: 586.542 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
記述子タイププログラム
DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROHGlycam Condensed SequenceGMML 1.0
WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1WURCSPDB2Glycan 1.1.0
[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}LINUCSPDB-CARE
#7: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 396 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかN
Has protein modificationY

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.94 Å3/Da / 溶媒含有率: 58.13 %
結晶化温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法
詳細: 0.1 M sodium citrate pH 5.6, 2% (v/v) MPD, 13.4% (w/v) PEG 8000

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データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 0.979 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2019年8月1日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.1→43.1 Å / Num. obs: 107701 / % possible obs: 98.5 % / 冗長度: 6.1 % / Biso Wilson estimate: 39.85 Å2 / CC1/2: 0.997 / Net I/σ(I): 9.5
反射 シェル解像度: 2.1→2.14 Å / Num. unique obs: 5342 / CC1/2: 0.697

-
位相決定

位相決定手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX1.19_4080精密化
Aimlessデータスケーリング
PHASER位相決定
PDB_EXTRACT3.27データ抽出
MOSFLMデータ削減
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 5I19, 1HEZ

5i19

1hez


解像度: 2.1→43.05 Å / SU ML: 0.24 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 27.92 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2435 5453 5.07 %
Rwork0.2187 102079 -
obs0.22 107532 98.16 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
原子変位パラメータBiso max: 179.32 Å2 / Biso mean: 67.0727 Å2 / Biso min: 30.39 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 2.1→43.05 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数9295 0 39 396 9730
Biso mean--54.13 54.09 -
残基数----1207
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0069556
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.81512994
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d5.9211311
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.0491471
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0071641
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkNum. reflection all% reflection obs (%)
2.1-2.120.38261840.336234403624100
2.12-2.150.34891770.338133963573100
2.15-2.180.35851820.31543365354799
2.18-2.20.33271710.30833392356399
2.2-2.230.31471820.30163406358899
2.23-2.260.32521840.29643335351997
2.26-2.290.31511600.29533205336593
2.29-2.330.26571840.28423255343995
2.33-2.370.27431700.276733743544100
2.37-2.40.3271780.28434863664100
2.4-2.450.34751640.267434283592100
2.45-2.490.30991770.266433973574100
2.49-2.540.28561740.270134153589100
2.54-2.590.27991740.25353451362599
2.59-2.650.28351720.25853447361999
2.65-2.710.26141980.25263326352498
2.71-2.770.27651890.26083292348195
2.77-2.850.31441770.26523298347595
2.85-2.930.28381990.251633913590100
2.93-3.030.2442140.2333443365799
3.03-3.140.23721820.22293444362699
3.14-3.260.24872110.22633377358899
3.26-3.410.24861930.21623464365799
3.41-3.590.23651690.20093379354897
3.59-3.820.23521700.19323371354196
3.82-4.110.21181890.18683459364899
4.11-4.520.19091800.16893504368499
4.52-5.180.17411690.15783437360697
5.18-6.520.19262000.19953443364396
6.52-43.050.23671800.20233659383996
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
11.5725-0.02780.98745.23911.08012.5266-0.0187-0.0133-0.343-0.52990.0940.48870.4309-0.173-0.06330.5967-0.0118-0.11230.25010.03490.4603-3.1681-6.12713.2319
21.38731.6061.03735.70431.3120.66590.04180.33260.0029-1.26250.2041-0.11620.05230.4781-0.26260.75750.011-0.11690.28690.02720.5752-1.3881-12.68499.4544
30.48291.31061.41843.64561.5381.0470.4405-0.2587-0.1362-0.175-0.350.58470.4723-0.6611-0.25870.7901-0.0733-0.14290.28550.04880.6306-6.694-15.051215.309
42.59631.36160.44212.4150.3994.5554-0.222-0.0219-0.03670.16830.0680.6135-0.4138-0.1538-0.06550.43980.0122-0.040.2318-0.02230.6592-11.4039-42.557718.7774
51.70172.02011.03422.67741.42991.02230.16750.00120.80830.6479-0.14531.1532-0.6934-0.7426-0.06930.72730.1630.08250.5234-0.10070.9885-16.5112-38.729225.5016
62.9681-0.82031.42583.1292-0.81014.3667-0.0109-0.0643-0.0173-0.23630.23530.9517-0.1108-0.6511-0.0730.52940.0321-0.07680.3054-0.05720.7439-14.4414-42.128417.7509
71.55020.15820.95767.1969-0.85343.85480.2614-0.2676-0.28540.4129-0.1327-0.37530.51260.2192-0.09040.48270.0075-0.11250.25490.01860.402710.0288-9.975431.2795
80.83770.3272-0.9752.5329-1.48251.47530.1263-0.1101-0.32250.2444-0.2119-0.36710.0724-0.14390.25590.49140.0492-0.09460.25440.05640.56231.2642-41.683823.8582
90.0790.51480.97224.52074.64439.0770.0704-0.01340.3468-0.2969-0.1659-0.7617-1.34240.60.26990.4868-0.1164-0.04040.39660.11520.6037.8641-40.395218.7293
102.53360.65610.18853.4708-0.68066.9597-0.13950.1062-0.1783-0.22440.076-0.4227-0.0740.64030.24270.48890.0202-0.00160.29030.09910.60472.5229-45.328416.465
111.20510.7108-0.48712.6630.62831.5761-0.16351.1315-0.0126-0.48440.3915-0.4811-0.40931.7256-0.26330.6102-0.09770.05421.8388-0.18530.563812.165919.1688-48.5576
121.77322.10510.42373.43271.67211.5512-0.05810.67560.42-0.22650.7592-0.3911-0.76331.1134-0.57510.4859-0.29840.0592.2581-0.06050.715717.696523.0544-46.9268
130.56260.20850.33260.781-1.27152.8448-0.43152.1028-0.9119-1.6868-0.3378-1.39110.32381.9885-1.35550.2599-0.2128-0.33092.0409-0.5089-0.4388.864618.5193-49.0727
140.8842-0.1538-1.88890.3443-0.20124.80560.0523-0.0992-0.0385-0.00510.01120.14320.04580.3956-0.09661.3008-0.1601-0.08123.2124-0.33580.313311.249617.2025-71.995
152.74580.2092-1.34582.2905-0.62521.1546-0.40580.36771.205-0.17090.24240.2389-0.5740.635-0.02071.2391-0.0844-0.14262.0139-0.20070.7921-7.977217.514-80.6182
161.08560.03810.37340.86940.72670.7142-0.35640.2490.6099-0.26280.35640.25520.10190.87550.01011.0726-0.0334-0.11351.6005-0.2341.0293-7.003925.6158-75.1689
170.0220.17880.28931.83382.39544.0477-0.02250.2482-0.5002-0.11960.1436-0.16690.69130.68920.33070.96870.10640.1072.3708-0.44040.49766.39410.974-71.4333
180.82240.89960.28523.1828-1.26353.1715-0.37641.22671.6073-0.42680.79910.5438-0.35840.783-0.08781.4081-0.0573-0.34692.15810.12340.8698-13.610825.5991-83.1484
190.04390.0985-0.05980.5539-0.20770.4592-0.19310.63721.2703-0.63930.2770.02-0.72370.31650.04411.2896-0.2522-0.25782.24710.11541.1598-0.846525.0329-86.7418
202.6090.1338-0.88033.03830.8795.42810.31620.5977-0.6579-0.4161-0.24790.2320.88160.3885-0.00480.58350.0414-0.11180.57-0.24610.6576-10.23057.667-41.4038
213.4345-0.25780.05524.70762.8743.95460.17941.657-0.1926-2.0369-0.2299-0.3596-1.30041.00990.19650.10250.0854-0.11630.7682-0.1690.3901-4.009916.8556-42.8466
223.6415-1.1042-0.1783.49010.31256.00230.12180.6762-0.3351-0.3204-0.01030.3344-0.02980.3829-0.06820.25420.014-0.04830.4575-0.13950.315-6.6115.3959-37.7038
230.48530.25520.23990.8594-0.43941.0112-0.25820.19740.1856-0.42140.00660.07480.3917-0.27860.04580.96420.0522-0.23511.3512-0.25670.6501-14.721610.558-69.7394
241.211.2025-0.71051.0001-0.69470.8267-0.19820.01330.0189-0.61420.2402-0.09080.29950.54590.0041.01060.1355-0.10341.5432-0.30850.6554-9.18327.9669-73.2001
250.87680.229-0.05260.77810.33510.2917-0.10130.4151-0.3607-0.32020.09190.06410.92110.00090.00051.23640.0932-0.1841.6684-0.30720.7472-15.80961.9016-77.2926
260.34760.1432-0.55030.9839-0.0510.9294-0.0645-0.6230.0363-0.4332-0.1627-0.3761-0.35270.95580.20091.4164-0.11080.13381.55890.13690.8871-0.178310.271567.8157
271.46410.4001-0.2261.2032-0.57551.97630.3243-0.9054-0.06770.8513-0.20030.2706-0.5891-0.0503-0.19771.0259-0.12070.14890.78860.07920.41870.20511.249557.5449
280.6699-0.11840.8972-0.2064-0.69374.90720.02650.18-0.04040.0618-0.02720.05240.12870.57910.04810.45070.0185-0.00860.3001-0.0160.37024.357320.7021-3.5512
291.8812-0.3603-0.35311.9919-0.98844.58920.1735-0.9825-0.59880.69930.05450.03470.58060.1469-0.11990.8307-0.03520.0770.8360.18340.52622.91216.426455.8782
302.1833-1.71980.70481.7342-0.25163.1051-0.0265-0.06580.27830.0590.0362-0.0285-0.32550.1381-0.07620.4424-0.02060.0410.23180.00470.37035.922321.887721.2086
313.42490.60692.95561.47161.29822.89660.21371.2083-0.3753-0.40120.1812-0.39310.10691.0157-0.230.67060.00710.03170.463-0.01510.437813.658117.34611.1156
321.328-0.27251.24071.08960.8254.7131-0.18710.01240.1050.0059-0.06750.1454-0.6252-0.24720.18890.48990.0124-0.00430.1890.00630.4508-1.134128.17013.5884
332.11510.4918-0.09832.488-1.42125.94040.2781-0.41280.01120.5695-0.0569-0.0323-0.4909-0.08920.0260.6469-0.05380.03030.41340.0170.34364.64812.616546.7104
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 1 through 75 )A1 - 75
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 76 through 90 )A76 - 90
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 91 through 113 )A91 - 113
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 114 through 150 )A114 - 150
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 151 through 163 )A151 - 163
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 164 through 213 )A164 - 213
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resid 1 through 106 )B1 - 106
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resid 107 through 145 )B107 - 145
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resid 146 through 157 )B146 - 157
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 158 through 215 )B158 - 215
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'C' and (resid 1 through 61 )C1 - 61
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'C' and (resid 62 through 75 )C62 - 75
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'C' and (resid 76 through 102 )C76 - 102
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'C' and (resid 103 through 114 )C103 - 114
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'C' and (resid 115 through 144 )C115 - 144
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'C' and (resid 145 through 163 )C145 - 163
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'C' and (resid 164 through 174 )C164 - 174
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'C' and (resid 175 through 197 )C175 - 197
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'C' and (resid 198 through 212 )C198 - 212
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'D' and (resid 1 through 33 )D1 - 33
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'D' and (resid 34 through 51 )D34 - 51
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'D' and (resid 52 through 103 )D52 - 103
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'D' and (resid 104 through 145 )D104 - 145
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'D' and (resid 146 through 193 )D146 - 193
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'D' and (resid 194 through 214 )D194 - 214
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'G' and (resid 1066 through 1098 )G0
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'G' and (resid 1099 through 1153 )G0
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'G' and (resid 1154 through 1229 )G0
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'G' and (resid 1230 through 1276 )G0
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'G' and (resid 1277 through 1320 )G0
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'G' and (resid 1321 through 1351 )G0
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'G' and (resid 1352 through 1390 )G0
33X-RAY DIFFRACTION33chain 'G' and (resid 1391 through 1437 )G0

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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