PDB-7dlv: shrimp dUTPase in complex with Stl

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7dlv

タイトル

shrimp dUTPase in complex with Stl

要素

Orf20
shrimp dUTPase

キーワード

HYDROLASE / dUTPase / Stl / dUTP / shrimp / Penaeus vannamei / Staphylococcus aureus

機能・相同性

Helix-turn-helix / Helix-turn-helix XRE-family like proteins / Cro/C1-type HTH domain profile. / Cro/C1-type helix-turn-helix domain / Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily / DNA binding / Orf20

機能・相同性情報

生物種

Penaeus vannamei (甲殻類)

Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.525 Å

データ登録者

Ma, Q. / Wang, F.

資金援助

中国, 2件

引用

ジャーナル: Int.J.Biol.Macromol. / 年: 2021
タイトル: Structural basis of staphylococcal Stl inhibition on a eukaryotic dUTPase.
著者: Wang, F. / Liu, C. / Wang, C. / Wang, Y. / Zang, K. / Wang, X. / Liu, X. / Li, S. / Li, F. / Ma, Q.

履歴

登録	2020年11月30日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2021年12月1日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2021年12月8日	Group: Derived calculations カテゴリ: pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_assembly_gen ...pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_assembly_prop / pdbx_struct_oper_list Item: _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id / _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
改定 1.2	2023年11月29日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7dlv.cif.gz	683.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7dlv.ent.gz	577 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7dlv.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dl/7dlv ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dl/7dlv	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	6h49S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	4h63-d 6f8z-d 23827 6f90-d 7lby-d 5c6g-d 6z3m-3 1t5l-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#144 - 2011年12月複合体I (Complex I) 類似性 (1) #112 - 2009年4月 Oct・Sox転写因子 (Oct and Sox Transcription Factors) 類似性 (1) #39 - 2003年3月 lac転写抑制因子 (lac Repressor) 類似性 (1) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (5)

登録構造単位

A: shrimp dUTPase

B: shrimp dUTPase

C: shrimp dUTPase

D: Orf20

E: Orf20

F: Orf20

G: shrimp dUTPase

H: shrimp dUTPase

I: shrimp dUTPase

J: Orf20

K: Orf20

L: Orf20

ヘテロ分子

208 kDa, 12 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: shrimp dUTPase

B: shrimp dUTPase

C: shrimp dUTPase

D: Orf20

E: Orf20

F: Orf20

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
104 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

G: shrimp dUTPase

H: shrimp dUTPase

I: shrimp dUTPase

J: Orf20

K: Orf20

L: Orf20

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
104 kDa, 6 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	74.702, 135.884, 135.627
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 105.790, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	(chain D and resid 13 through 153)
2	1	chain E
3	1	(chain F and resid 13 through 153)
4	1	(chain J and resid 13 through 153)
5	1	(chain K and resid 13 through 153)
6	1	(chain L and resid 13 through 153)
1	2	(chain A and resid 69 through 195)
2	2	(chain B and resid 69 through 195)
3	2	(chain C and resid 69 through 195)
4	2	(chain G and resid 69 through 195)
5	2	chain H
6	2	(chain I and resid 69 through 195)

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	HIS	HIS	SER	SER	(chain D and resid 13 through 153)	D	D	13 - 153	15 - 155
2	1	HIS	HIS	SER	SER	chain E	E	E	13 - 153	15 - 155
3	1	HIS	HIS	SER	SER	(chain F and resid 13 through 153)	F	F	13 - 153	15 - 155
4	1	HIS	HIS	SER	SER	(chain J and resid 13 through 153)	J	J	13 - 153	15 - 155
5	1	HIS	HIS	SER	SER	(chain K and resid 13 through 153)	K	K	13 - 153	15 - 155
6	1	HIS	HIS	SER	SER	(chain L and resid 13 through 153)	L	L	13 - 153	15 - 155
1	2	LYS	LYS	MET	MET	(chain A and resid 69 through 195)	A	A	69 - 195	8 - 134
2	2	LYS	LYS	MET	MET	(chain B and resid 69 through 195)	B	B	69 - 195	8 - 134
3	2	LYS	LYS	MET	MET	(chain C and resid 69 through 195)	C	C	69 - 195	8 - 134
4	2	LYS	LYS	MET	MET	(chain G and resid 69 through 195)	G	G	69 - 195	8 - 134
5	2	LYS	LYS	MET	MET	chain H	H	H	69 - 195	8 - 134
6	2	LYS	LYS	MET	MET	(chain I and resid 69 through 195)	I	I	69 - 195	8 - 134

NCSアンサンブル:

ID
1
2

#1: タンパク質	shrimp dUTPase 分子量: 16304.496 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Penaeus vannamei (甲殻類) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
#2: タンパク質	Orf20 分子量: 18127.365 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9F0J8
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 9 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.21 Å³/Da / 溶媒含有率: 61.64 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法詳細: The crystals were obtained after four days in drops mixing equal volumes (1.5 ul) of protein solution (10 mg/ml) and reservoir solution (100 mM Bis-Tris pH 6.0, 2.4 M ammonium sulphate).

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL19U1 / 波長: 0.9788 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年11月11日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9788 Å / 相対比: 1
Reflection twin	Operator: -h,-k,h+l / Fraction: 0.48
反射	解像度: 2.525→94.13 Å / Num. obs: 86385 / % possible obs: 98.8 % / 冗長度: 6.7 % / CC_1/2: 0.999 / R_pim(I) all: 0.024 / R_rim(I) all: 0.062 / R_sym value: 0.057 / Net I/σ(I): 22.6
反射シェル	解像度: 2.525→2.568 Å / 冗長度: 7.1 % / Mean I/σ(I) obs: 2.1 / Num. unique obs: 4290 / CC_1/2: 0.796 / R_pim(I) all: 0.297 / R_rim(I) all: 0.801 / R_sym value: 0.743 / % possible all: 98.3

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.13_2998	精密化
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
XDS	Mar 15, 2019 (BUILT 20190315)	データ削減
Aimless	0.5.29	データスケーリング
PHASER	2.7.17	位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6H49

6h49

解像度: 2.525→94.126 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 35.97 / 位相誤差: 23 / 立体化学のターゲット値: TWIN_LSQ_F

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2009	4463	5.17 %	random selection
R_work	0.1716	81880	-	-
obs	0.1773	86385	98.84 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 168.62 Å² / B_iso mean: 64.6351 Å² / B_iso min: 25.48 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.525→94.126 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13392	0	47	0	13439
B_iso mean	-	-	74.29	-	-
残基数	-	-	-	-	1664

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	D	2304	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
1	2	E	2304	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
1	3	F	2304	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
1	4	J	2304	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
1	5	K	2304	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
1	6	L	2304	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
2	1	A	2544	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
2	2	B	2544	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
2	3	C	2544	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
2	4	G	2544	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
2	5	H	2544	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL
2	6	I	2544	X-RAY DIFFRACTION	5.712	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 20

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.5255-2.5691	0.3492	210	0.2812	4078	4288	93
2.5691-2.6158	0.2678	209	0.2725	4058	4267	94
2.6158-2.6661	0.2954	208	0.2582	4111	4319	94
2.6661-2.7205	0.2707	236	0.2609	3984	4220	93
2.7205-2.7796	0.2766	235	0.2632	4088	4323	93
2.7796-2.8443	0.3175	210	0.2381	4032	4242	94
2.8443-2.9154	0.2659	238	0.2362	4078	4316	93
2.9154-2.9942	0.2848	245	0.2257	4041	4286	93
2.9942-3.0823	0.2473	192	0.2175	4113	4305	94
3.0823-3.1818	0.2402	195	0.2098	4088	4283	94
3.1818-3.2954	0.2296	228	0.1963	4100	4328	94
3.2954-3.4273	0.2576	218	0.1936	4103	4321	94
3.4273-3.5832	0.2228	203	0.1891	4132	4335	94
3.5832-3.772	0.1983	214	0.1812	4106	4320	94
3.772-4.0082	0.192	211	0.1643	4092	4303	94
4.0082-4.3174	0.1772	208	0.1457	4106	4314	94
4.3174-4.7514	0.1613	250	0.1308	4108	4358	94
4.7514-5.4378	0.1407	224	0.1394	4158	4382	94
5.4378-6.8465	0.1925	251	0.1545	4116	4367	94
6.8465-42.8633	0.1709	226	0.1517	4188	4414	94

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	9.8735	1.0042	3.7836	6.2045	2.2752	5.2339	0.3937	-0.342	-0.0796	0.7086	-0.8101	0.4539	1.0914	-1.266	0.1496	0.6662	-0.0409	0.0205	0.3826	-0.0226	0.2945	32.8724	-10.3734	175.7119
2	7.8707	0.8761	0.1139	7.7927	-1.8508	2.2013	0.1707	-0.2422	0.4291	-0.0957	-0.1235	0.3913	-0.2967	-0.3122	-0.0334	0.5148	0.1256	-0.0361	0.3662	-0.0107	0.2459	34.4893	-1.0654	171.0428
3	3.5354	1.4335	0.2676	2.9914	1.2146	4.748	0.0083	0.3651	-0.1536	0.867	-0.2137	-0.4212	-0.3839	-0.6038	0.2125	0.6661	-0.0924	-0.133	0.4296	-0.0741	0.4201	50.5081	8.2049	170.8997
4	2.9415	1.6972	-1.8866	3.6387	-3.7441	7.1271	0.1732	-0.0041	0.1221	0.5114	-0.0176	0.0127	-0.354	0.0234	-0.1471	0.4325	0.095	-0.0986	0.3909	0.0053	0.2646	43.9145	-6.6514	172.9367
5	1.4137	1.0607	-1.2825	9.2623	-8.3977	7.8336	0.1706	0.1785	0.0746	0.3385	0.2184	0.2464	-0.7511	-0.2547	-0.4069	0.5841	0.0298	-0.0299	0.4766	-0.0425	0.2428	44.4864	0.3222	160.011
6	1.7546	-1.5397	-1.6867	5.1708	5.1134	5.0875	-0.2958	-0.156	-0.1107	-0.289	0.431	-0.1408	-0.3953	-0.2652	-0.1424	0.5799	-0.0252	-0.1753	0.5732	0.0243	0.2467	45.6629	-12.1429	172.6444
7	7.0302	-0.1555	-2.407	4.2615	-3.0812	5.9732	0.1768	0.461	0.2376	0.4228	-0.3907	-1.2174	-1.1395	0.3053	-0.0403	0.5997	-0.0966	0.0251	0.3943	0.0057	0.3209	53.1115	5.9631	162.539
8	9.7564	7.9995	-9.3426	7.6826	-9.2424	1.9975	0.3974	-0.2971	1.2259	-0.508	0.744	0.9635	-1.3215	0.3726	-0.4638	1.349	0.0055	-0.0018	0.4621	-0.1002	0.3784	44.3062	10.7759	169.9649
9	2.1721	1.9961	1.7036	7.5751	4.5219	2.9969	0.0624	-0.045	0.0221	-0.2659	0.2979	0.5068	0.1403	-0.2346	-0.3997	0.6191	0.055	-0.057	0.5336	0.0673	0.1895	38.6606	-6.2314	164.2925
10	9.7612	-6.6045	-6.5457	4.5286	4.4342	4.4917	0.2761	0.1983	0.3482	0.0621	0.0967	-0.6193	0.5504	-0.1612	-0.3701	0.812	0.0329	-0.1234	0.4752	0.1089	0.4588	50.0643	-29.4602	159.3593
11	7.086	-2.1103	-3.4821	5.7938	-0.2304	8.0934	0.6274	0.735	-0.2617	0.6405	-0.4223	0.445	1.9311	-0.0774	-0.3674	1.416	-0.0273	0.0129	0.768	-0.267	0.492	52.3123	-30.2526	142.6959
12	4.0439	0.8566	1.3291	0.7985	0.1427	2.9757	-0.2103	0.5102	0.0604	-0.8048	0.1319	0.0628	-0.0026	-0.116	0.052	0.901	0.0935	-0.0512	0.5543	-0.0019	0.2722	38.9384	-5.3916	140.3982
13	3.3681	0.1991	1.0382	1.8713	1.8183	2.167	-0.0272	-0.0045	0.3288	-0.4801	-0.1692	0.3979	-0.1434	-0.129	0.1828	0.8544	0.0299	-0.1137	0.5093	0.0228	0.1929	37.2973	-3.8739	148.7162
14	9.0177	-5.6321	-1.5278	7.045	-1.3516	4.455	-0.254	0.1873	0.2103	-0.85	0.1457	-0.62	-0.1777	-0.1661	0.1065	0.6975	-0.0244	0.0665	0.356	-0.0371	0.3463	54.8793	-4.9606	146.6238
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精密化 TLSグループ

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10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resid 183 through 192 )	A	183 - 192
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13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 108 through 130 )	B	108 - 130
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16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 174 through 192 )	B	174 - 192
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 193 through 205 )	B	193 - 205
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 69 through 76 )	C	69 - 76
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 77 through 86 )	C	77 - 86
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 87 through 97 )	C	87 - 97
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 98 through 107 )	C	98 - 107
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 108 through 130 )	C	108 - 130
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 131 through 143 )	C	131 - 143
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 144 through 155 )	C	144 - 155
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 156 through 182 )	C	156 - 182
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resid 183 through 192 )	C	183 - 192
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'C' and (resid 193 through 204 )	C	193 - 204
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 10 through 68 )	D	10 - 68
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 69 through 112 )	D	69 - 112
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 113 through 153 )	D	113 - 153
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'E' and (resid 13 through 68 )	E	13 - 68
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'E' and (resid 69 through 107 )	E	69 - 107
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'E' and (resid 108 through 153 )	E	108 - 153
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resid 11 through 54 )	F	11 - 54
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resid 55 through 68 )	F	55 - 68
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resid 69 through 90 )	F	69 - 90
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 91 through 112 )	F	91 - 112
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 113 through 131 )	F	113 - 131
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'F' and (resid 132 through 153 )	F	132 - 153
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'G' and (resid 69 through 76 )	G	69 - 76
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'G' and (resid 77 through 86 )	G	77 - 86
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'G' and (resid 87 through 97 )	G	87 - 97
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'G' and (resid 98 through 107 )	G	98 - 107
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'G' and (resid 108 through 123 )	G	108 - 123
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'G' and (resid 124 through 131 )	G	124 - 131
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'G' and (resid 132 through 143 )	G	132 - 143
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'G' and (resid 144 through 155 )	G	144 - 155
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'G' and (resid 156 through 166 )	G	156 - 166
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'G' and (resid 167 through 173 )	G	167 - 173
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'G' and (resid 174 through 182 )	G	174 - 182
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'G' and (resid 183 through 192 )	G	183 - 192
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'G' and (resid 193 through 204 )	G	193 - 204
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'H' and (resid 69 through 76 )	H	69 - 76
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'H' and (resid 77 through 86 )	H	77 - 86
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'H' and (resid 87 through 113 )	H	87 - 113
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58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'H' and (resid 144 through 166 )	H	144 - 166
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'H' and (resid 167 through 173 )	H	167 - 173
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'H' and (resid 174 through 182 )	H	174 - 182
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'H' and (resid 183 through 195 )	H	183 - 195
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'I' and (resid 69 through 86 )	I	69 - 86
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65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'I' and (resid 108 through 123 )	I	108 - 123
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67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'I' and (resid 132 through 143 )	I	132 - 143
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'I' and (resid 144 through 166 )	I	144 - 166
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'I' and (resid 167 through 182 )	I	167 - 182
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'I' and (resid 183 through 192 )	I	183 - 192
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'I' and (resid 193 through 204 )	I	193 - 204
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'J' and (resid 8 through 48 )	J	8 - 48
73	X-RAY DIFFRACTION	73	chain 'J' and (resid 49 through 56 )	J	49 - 56
74	X-RAY DIFFRACTION	74	chain 'J' and (resid 57 through 68 )	J	57 - 68
75	X-RAY DIFFRACTION	75	chain 'J' and (resid 69 through 90 )	J	69 - 90
76	X-RAY DIFFRACTION	76	chain 'J' and (resid 91 through 105 )	J	91 - 105
77	X-RAY DIFFRACTION	77	chain 'J' and (resid 106 through 117 )	J	106 - 117
78	X-RAY DIFFRACTION	78	chain 'J' and (resid 118 through 131 )	J	118 - 131
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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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